A Suite of “Minimalist” Photo-Crosslinkers for Live-Cell Imaging and Chemical Proteomics: Case Study with BRD4 Inhibitors
作者:Sijun Pan、Se-Young Jang、Danyang Wang、Si Si Liew、Zhengqiu Li、Jun-Seok Lee、Shao Q. Yao
DOI:10.1002/anie.201706076
日期:2017.9.18
Affinity‐based probes (AfBPs) provide a powerful tool for large‐scale chemoproteomic studies of drug–target interactions. The development of high‐quality probes capable of recapitulating genuine drug–target engagement, however, could be challenging. “Minimalist” photo‐crosslinkers, which contain an alkyl diazirine group and a chemically tractable tag, could alleviate such challenges, but few are currently available
基于亲和力的探针(A f BPs)为药物-靶标相互作用的大规模化学计量学研究提供了强大的工具。然而,开发能够概括真正的药物-靶点参与的高质量探针可能是具有挑战性的。包含烷基重氮基团和化学易处理标签的“极简主义”光交联剂可以缓解此类挑战,但目前很少。本文中,我们开发了具有不同生物正交标签的新型含烷基重氮基的光交联剂。随后,它们被用来创建A f的套件基于GW841819X(BRD4的小分子抑制剂)的BP。通过在模拟天然药物与靶标相互作用的条件下进行的体外和原位研究,我们获得了关于标签如何影响探针性能的更好的见解。最后,基于SILAC的化学密码学研究导致发现了新型脱靶APEX1。进一步的研究表明,GW841819X与APEX1结合并在常氧条件下引起内源性DNMT1表达上调。