Ds-Gly-D-Ala-D-Ala-OH | 203189-21-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Ds-Gly-D-Ala-D-Ala-OH
• 英文别名: Dan-Gly-D-Ala-D-Ala-OH；(2R)-2-[[(2R)-2-[[2-[[5-(dimethylamino)naphthalen-1-yl]sulfonylamino]acetyl]amino]propanoyl]amino]propanoic acid
• CAS: 203189-21-3
• 化学式: C₂₀H₂₆N₄O₆S
• 分子量: 450.516
• InChiKey: BHSOAHNDNIFNBL-CHWSQXEVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Ds-Gly-D-Ala-D-Ala-OH 在 盐酸 作用下， 以 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 以0.17 g的产率得到Ds-Gly-D-Ala-D-Lac-OH
  参考文献：
  名称：

  通过筛选基于CTV的组合文库，选择能够感知d-Ala-d-Ala或d-Ala-d-Lac配体结合差异的合成受体

  摘要：

  筛选基于组合CTV的人工合成受体文库1 {1-13，1-13，1-13}以结合各种d-Ala-d-Ala和d-Ala-d-Lac配体（6 – 11）在磷酸盐缓冲液（0.1 N，pH = 7.0）中进行。经过筛选和Edman测序后，发现含有氨基酸序列的合成受体，该序列是结合染料标记的d-Ala-d-Ala或d-Ala-d-Lac配体的特征。例如，受体能够结合配体含有d-ALA-d丙氨酸6，7，9和11在他们的手臂中包含-几乎在所有情况下-至少包含一个基本氨基酸残基-主要是Lys。这与能够结合含有d-Ala-d-Lac的配体8和10的受体的臂确实是一个惊人的区别，配体8和10通常包含大量的极性氨基酸（Gln和Ser），尤其是在配体8中，但是几乎没有任何碱性氨基酸。使用不同的（荧光）染料标记表明该标记对受体的结合具有深远的影响，尽管不是决定性的。选择了用FITC-肽聚糖筛选CTV库的命中片段（6），以进行重新合成和验证。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.08.074
• 作为产物：
  描述：

  (R)-2-{(R)-2-[2-(5-Dimethylamino-naphthalene-1-sulfonylamino)-acetylamino]-propionylamino}-propionic acid tert-butyl ester 在 盐酸 作用下， 以 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 以65%的产率得到Ds-Gly-D-Ala-D-Ala-OH
  参考文献：
  名称：

  通过筛选基于CTV的组合文库，选择能够感知d-Ala-d-Ala或d-Ala-d-Lac配体结合差异的合成受体

  摘要：

  筛选基于组合CTV的人工合成受体文库1 {1-13，1-13，1-13}以结合各种d-Ala-d-Ala和d-Ala-d-Lac配体（6 – 11）在磷酸盐缓冲液（0.1 N，pH = 7.0）中进行。经过筛选和Edman测序后，发现含有氨基酸序列的合成受体，该序列是结合染料标记的d-Ala-d-Ala或d-Ala-d-Lac配体的特征。例如，受体能够结合配体含有d-ALA-d丙氨酸6，7，9和11在他们的手臂中包含-几乎在所有情况下-至少包含一个基本氨基酸残基-主要是Lys。这与能够结合含有d-Ala-d-Lac的配体8和10的受体的臂确实是一个惊人的区别，配体8和10通常包含大量的极性氨基酸（Gln和Ser），尤其是在配体8中，但是几乎没有任何碱性氨基酸。使用不同的（荧光）染料标记表明该标记对受体的结合具有深远的影响，尽管不是决定性的。选择了用FITC-肽聚糖筛选CTV库的命中片段（6），以进行重新合成和验证。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.08.074

文献信息

• Peptide-binding antibiotics: A solid-phase assay for screening libraries of vancomycin mimics for selective d-Ala-d-Ala binding
  作者：Jeffrey H. Rothman、W.Clark Still

  DOI：10.1016/s0960-894x(97)10175-5

  日期：1997.12

  Due to recent increases of vancomycin-resistant bacterial infections, research on more effective antibiotics has intensified, As part of such research, screening of combinatorial libraries is a valuable approach for discovering new lead antibiotics, A screening method is presented here that uses a solid state library and a fluorescent label to detect RCO-d-Ala-d-Ala binding in aqueous media. (C) 1997 Elsevier Science Ltd.
• Selection of synthetic receptors capable of sensing the difference in binding of d-Ala-d-Ala or d-Ala-d-Lac ligands by screening of a combinatorial CTV-based library
  作者：Cristina Chamorro、Rob M.J. Liskamp

  DOI：10.1016/j.tet.2004.08.074

  日期：2004.11

  Screening of a combinatorial CTV-based artificial, synthetic receptor library 1 1-13, 1-13, 1-13} for binding of a variety d-Ala-d-Ala and d-Ala-d-Lac containing ligands (6–11) was carried out in phosphate buffer (0.1 N, pH=7.0). After screening and Edman sequencing, synthetic receptors were found containing amino acid sequences, which are either characteristic for binding dye labeled d-Ala-d-Ala

  筛选基于组合CTV的人工合成受体文库1 1-13，1-13，1-13}以结合各种d-Ala-d-Ala和d-Ala-d-Lac配体（6 – 11）在磷酸盐缓冲液（0.1 N，pH = 7.0）中进行。经过筛选和Edman测序后，发现含有氨基酸序列的合成受体，该序列是结合染料标记的d-Ala-d-Ala或d-Ala-d-Lac配体的特征。例如，受体能够结合配体含有d-ALA-d丙氨酸6，7，9和11在他们的手臂中包含-几乎在所有情况下-至少包含一个基本氨基酸残基-主要是Lys。这与能够结合含有d-Ala-d-Lac的配体8和10的受体的臂确实是一个惊人的区别，配体8和10通常包含大量的极性氨基酸（Gln和Ser），尤其是在配体8中，但是几乎没有任何碱性氨基酸。使用不同的（荧光）染料标记表明该标记对受体的结合具有深远的影响，尽管不是决定性的。选择了用FITC-肽聚糖筛选CTV库的命中片段（6），以进行重新合成和验证。