methyl 2-(4-nitro-1-methylpyrrole-2-yl)-1-methylbenzimidazole-5-carboxylate | 794513-94-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: methyl 2-(4-nitro-1-methylpyrrole-2-yl)-1-methylbenzimidazole-5-carboxylate
• 英文别名: methyl 1-methyl-2-(1-methyl-4-nitropyrrol-2-yl)benzimidazole-5-carboxylate
• CAS: 794513-94-3
• 化学式: C₁₅H₁₄N₄O₄
• 分子量: 314.301
• InChiKey: CCGOVWQHHJSVKJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  94.9
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-(4-nitro-1-methylpyrrole-2-yl)-1-methylbenzimidazole-5-carboxylate 、 二碳酸二叔丁酯 在 palladium(II) hydroxide/carbon 甲酸铵 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以90%的产率得到methyl 2-(4-tert-butoxycarbonylamino-1-methylpyrrole-2-yl)-1-methylbenzimidazole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOUNDS HAVING A FUSED, BICYCLIC MOIETY FOR BINDING TO THE MINOR GROOVE OF DSDNA
  [FR] COMPOSES COMPORTANT UNE FRACTION BICYCLIQUE FUSIONNEE QUI SE LIE AU PETIT SILLON D'ADN DOUBLE BRIN

  摘要：

  公开号：

  WO2004099131A3
• 作为产物：
  描述：

  methyl 3-((4-nitro-1-methylpyrrole-2-yl)carbonyl)amino-4-methylaminobenzoate 在 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 5.0h， 以95%的产率得到methyl 2-(4-nitro-1-methylpyrrole-2-yl)-1-methylbenzimidazole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOUNDS HAVING A FUSED, BICYCLIC MOIETY FOR BINDING TO THE MINOR GROOVE OF DSDNA
  [FR] COMPOSES COMPORTANT UNE FRACTION BICYCLIQUE FUSIONNEE QUI SE LIE AU PETIT SILLON D'ADN DOUBLE BRIN

  摘要：

  公开号：

  WO2004099131A3

文献信息

• Compounds having a fused, bicyclic moiety for binding to the minor groove of dsDNA
  申请人：Phillion P. Dennis

  公开号：US20050009054A1

  公开（公告）日：2005-01-13

  The present invention is directed to the means by which to alter the binding affinity and/or specificity of a compound with a sequence of DNA in the minor groove of a double-strand thereof. More particularly, the present invention is directed to a synthetic and/or non-naturally occurring compound (e.g., an analog of a polyamide oligomer or polymer) which contains at least one hydrogen bond donor moiety and at least one hydrogen bond acceptor moiety, wherein the latter moiety or “building block” has a fused, bicyclic structure which is heteroaromatic, said structure having a heteroatom therein which acts as a hydrogen bond acceptor to bind guanine in the minor groove of the dsDNA sequence, and which is incapable of forming a tautomer. In one particular embodiment of the synthetic and/or non-naturally occurring compound, the fused, bicyclic structure occupies an initial or first terminal position within the compound.

  本发明涉及一种改变化合物与DNA双链中小沟的序列的结合亲和力和/或特异性的方法。特别地，本发明涉及一种合成和/或非自然存在的化合物（例如，聚酰胺寡聚物或聚合物的类似物），该化合物含有至少一个氢键供体基团和至少一个氢键受体基团，其中后者基团或“构建块”具有融合的、杂环芳香性的双环结构，该结构在其中具有作为氢键受体以结合双链DNA序列中的鸟嘌呤的杂原子，并且不能形成互变异构体。在合成和/或非自然存在的化合物的一个特定实施例中，融合的、双环结构占据化合物的初始或第一端位置。
• [EN] COMPOUNDS HAVING A FUSED, BICYCLIC MOIETY FOR BINDING TO THE MINOR GROOVE OF DSDNA<br/>[FR] COMPOSES COMPORTANT UNE FRACTION BICYCLIQUE FUSIONNEE QUI SE LIE AU PETIT SILLON D'ADN DOUBLE BRIN
  申请人：PHARMACIA CORP

  公开号：WO2004099131A3

  公开（公告）日：2005-02-17