Conformational characteristics of rigid cyclic nucleotides. 3. The solution conformation of .beta.-lyxonucleoside cyclic 2',5'- and 3',5'-monophosphates and of .alpha.-arabinonucleoside cyclic 2',5'-monophosphates. Implications for evaluation of the solution properties of nucleoside analogs
作者:Malcolm MacCoss、Clinton F. Ainsworth、Gregory Leo、Fouad S. Ezra、Steven S. Danyluk
DOI:10.1021/ja00544a034
日期:1980.11
-D-arabinofuranosyl)adenine cyclic 2',5'-monophosphate (3, ..cap alpha..-2',5'-cAAMP) in D/sub 2/O solution. Conformational analyses showed the cyclic 2',5'-phosphates (2a,b and 3) to exhibit sugar conformations in the range of /sup 2/E whereas the cyclic 3',5'-phosphates (1a,b) showed a preference for the /sup 3/E to /sub 4//sup 3/T conformation. The unusually large /sup 3/J/sub PH/ coupling of approx. 31 Hz
b) 显示对 /sup 3/E 到 /sub 4//sup 3/T 构象的偏好。异常大的/sup 3/J/sub PH/ 耦合大约。31 Hz,之前在 9-(..beta..-D-arabinofuranosyl) 腺嘌呤环 2',5' 单磷酸 (2c, 2',5'-cAAMP) 中的 J/sub 5'P/ 和1-(..beta..-D-arabinofuranosyl) 胞嘧啶环状 2',5'-单磷酸 (2d, 2',5'-cACMP) 在 2a,b 中再次明显,但在 3 中不明显。这种差异归因于..beta.. 导向的碱基和 2a-d 中的环状 2',5'-磷酸环之间的空间相互作用,这在 3 中不存在,其中碱基朝向 ..cap alpha..;这允许磷酸环采用比 2a-d 中的更少应变的构象。本研究中描述的化合物的环状磷酸环将糖环固定成特定的构象,排除通常在无环单核苷酸中发现的 /sup