摘要:
化学交联结合蛋白水解消化和质谱(MS)是一种有前途的方法,可为蛋白质拓扑结构和功能性多蛋白质复合物的结构表征提供分子间和分子内的距离限制。尽管这些方法相对直接,但由于所得肽混合物的复杂性以及内部,内部或“死端”的排列,交联蛋白的鉴定和表征仍然面临着巨大的分析挑战。 -可以从单个交联实验中产生的交联肽。为了解决这些问题,我们在此描述新型“固定电荷”含“离子交联剂S-甲基5,5'的合成,表征和初步评估。-硫代二戊酰基羟基suc-cinimide。通过与该试剂反应获得的肽产物均显示出仅通过在CID-MS / MS中与固定电荷直接相邻的CS键的易裂解而片段化,从而形成了特征性的产物离子,使得该离子的存在和类型得以实现(独立于前驱体离子的“质子迁移率”,易于确定的交联产物(例如,末端,内部或内部)。MS3对这些产物的后续分离和解离提供了鉴定参与交联反应的肽序列以及表征发生交联的特定位点所需的其他结构信息。这些气相裂解反应的特异性,