Major-Groove-Halogenated DNA: The Effects of Bromo and Iodo Substituents Replacing H−C(7) of 8-Aza-7-deazapurine-2,6-diamine or H−C(5) of Uracil Residues
作者:Georg Becher、Junlin He、Frank Seela
DOI:10.1002/1522-2675(20010516)84:5<1048::aid-hlca1048>3.0.co;2-9
日期:2001.5.16
counterparts containing 2′-deoxyadenosine, the purine-2,6-diamine 2′-deoxyribonucleoside (1), or 2a at the same positions. Six 2b residues replacing dA in the duplex 5′-d(TAGGTCAATACT)-3′ (11)⋅5′-d(AGTATTGACCTA)-3′ (12) raised the Tm value from 48 to 75° (4.5° per modification (Table 3)). Contrary to this, incorporation of the 5-halogenated 2′-deoxyuridines 3b or 3c into oligonucleotide duplexes showed very
合成了含有卤代“嘌呤”和嘧啶碱基的寡核苷酸。溴和碘取代基被引入 8-aza-7-deazapurine-2,6-二胺的 7 位(见 2b,c)或尿嘧啶残基的 5 位(见 3b,c)。在用异丁酰基保护2b和用苯甲酰基保护2c后合成亚磷酰胺。含有残基 2b 或 2c 的双链体的 Tm 值总是高于在相同位置含有 2'-脱氧腺苷、嘌呤-2,6-二胺 2'-脱氧核糖核苷 (1) 或 2a 的未修饰对应物的 Tm 值。六个 2b 残基取代双链体 5'-d(TAGGTCAATACT)-3' (11)⋅5'-d(AGTATTGACCTA)-3' (12) 中的 dA 将 Tm 值从 48 提高到 75°(每次修饰 4.5°(表3))。与此相反,将 5-卤代 2'-脱氧尿苷 3b 或 3c 掺入寡核苷酸双链体中对热稳定性的影响很小,无论哪个“嘌呤”核苷位于它们对面(表 4 和表 5)。对 DNA 中观察到的双链体热稳定性的积极影响也在