4-Amino-5-[1-((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-2-one | 1054665-79-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 咪唑核糖核苷和核糖核苷酸
• 英文名称: 4-Amino-5-[1-((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-2-one
• 英文别名: 6-amino-5-[1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis(phenylmethoxy)-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-2-one
• CAS: 1054665-79-0
• 化学式: C₃₃H₃₃N₅O₅
• 分子量: 579.656
• InChiKey: XWDFPUSLKYFNNB-PBAMLIMUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  122
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-Amino-5-[1-((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-2-one 在 palladium on activated charcoal ammonium formate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 以42 mg的产率得到4-Amino-5-[1-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  “分子变色龙”。第二系列柔性核苷的设计与合成

  摘要：

  介绍了柔性形状修饰的核苷的第二系列。“挠性分子”的特征是嘌呤环系统分为各自的咪唑和嘧啶组分。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。因此，这些结构创新的核苷可以更轻松地适应其环境，并应作为生物探针用于研究酶与辅酶的结合位点以及核酸和蛋白质的相互作用。描述了它们的设计和综合。

  DOI：

  10.1021/jo048218h
• 作为产物：
  描述：

  1-(4,5-diiodoimidazol-3-yl)-β-D-ribofuranose 在 四(三苯基膦)钯 乙基溴化镁 、 氨 、 四丁基碘化铵 、 sodium hydride 、 碳酸氢钠 、 溶剂黄146 、 sodium nitrite 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙二醇二甲醚 、 乙醚 、 水 为溶剂， 反应 123.0h， 生成 4-Amino-5-[1-((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  “分子变色龙”。第二系列柔性核苷的设计与合成

  摘要：

  介绍了柔性形状修饰的核苷的第二系列。“挠性分子”的特征是嘌呤环系统分为各自的咪唑和嘧啶组分。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。因此，这些结构创新的核苷可以更轻松地适应其环境，并应作为生物探针用于研究酶与辅酶的结合位点以及核酸和蛋白质的相互作用。描述了它们的设计和综合。

  DOI：

  10.1021/jo048218h

文献信息

• “Molecular Chameleons”. Design and Synthesis of a Second Series of Flexible Nucleosides
  作者：Katherine L. Seley、Samer Salim、Liang Zhang、Peter I. O'Daniel

  DOI：10.1021/jo048218h

  日期：2005.3.1

  The second series of flexible shape-modified nucleosides is introduced. The “fleximers” feature the purine ring systems split into their individual imidazole and pyrimidine components. This structural modification serves to introduce flexibility to the nucleoside while still retaining the elements essential for recognition. As a consequence, these structurally innovative nucleosides can more readily

  介绍了柔性形状修饰的核苷的第二系列。“挠性分子”的特征是嘌呤环系统分为各自的咪唑和嘧啶组分。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。因此，这些结构创新的核苷可以更轻松地适应其环境，并应作为生物探针用于研究酶与辅酶的结合位点以及核酸和蛋白质的相互作用。描述了它们的设计和综合。