Fmoc-Spr(oNB)-OH | 1032400-98-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: Fmoc-Spr(oNB)-OH
• 英文别名: 3-[2,4-dimethyl-6-[(2-nitrophenyl)methoxy]phenyl]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutanoic acid
• CAS: 1032400-98-8
• 化学式: C₃₅H₃₄N₂O₇
• 分子量: 594.664
• InChiKey: RXVSJPRQBJUOHZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.5
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-Spr(oNB)-OH 生成
  参考文献：
  名称：

  基于FRET的刺激反应肽的加工反应动力学的测定：氨基酸序列对反应动力学的影响

  摘要：

  在化学生物学领域中，通过刺激来控制肽基功能的方法引起了越来越多的关注。最近，我们报道了一种刺激反应性肽，暴露于刺激后可以裂解。在这项研究中，我们开发了一种基于FRET的测定系统，以评估刺激诱导的加工（肽键裂解）反应的动力学。基于FRET系统，澄清了在与刺激响应性氨基酸相邻的位置处引入空间较少受阻或极性的残基加速了加工反应。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2009.01.063
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-甘氨酸 、 生成 Fmoc-Spr(oNB)-OH
  参考文献：
  名称：

  基于FRET的刺激反应肽的加工反应动力学的测定：氨基酸序列对反应动力学的影响

  摘要：

  在化学生物学领域中，通过刺激来控制肽基功能的方法引起了越来越多的关注。最近，我们报道了一种刺激反应性肽，暴露于刺激后可以裂解。在这项研究中，我们开发了一种基于FRET的测定系统，以评估刺激诱导的加工（肽键裂解）反应的动力学。基于FRET系统，澄清了在与刺激响应性氨基酸相邻的位置处引入空间较少受阻或极性的残基加速了加工反应。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2009.01.063

文献信息

• Design and synthesis of caged ceramide: UV-responsive ceramide releasing system based on UV-induced amide bond cleavage followed by O–N acyl transfer
  作者：Akira Shigenaga、Hiroko Hirakawa、Jun Yamamoto、Keiji Ogura、Masaya Denda、Keiko Yamaguchi、Daisuke Tsuji、Kohji Itoh、Akira Otaka

  DOI：10.1016/j.tet.2011.04.048

  日期：2011.6

  Sphingolipids, recognized as membrane constructs and as key signaling molecules, have been studied to examine intracellular function. Some caged sphingolipids that release parent sphingolipids after exposure to UV-irradiation have been previously developed, but caged ceramide has yet to be reported. In this study, we report the design and synthesis of a caged ceramide. Photo-irradiation experiment clarified that the caged ceramide can be successfully converted to the parent ceramide by UV-irradiation. Introduction of an alkyne-handle moiety for further modification of the caged ceramide is also reported. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• FRET-based assay of the processing reaction kinetics of stimulus-responsive peptides: influence of amino acid sequence on reaction kinetics
  作者：Akira Shigenaga、Jun Yamamoto、Hiroko Hirakawa、Keiko Yamaguchi、Akira Otaka

  DOI：10.1016/j.tet.2009.01.063

  日期：2009.3

  study, we developed a FRET-based assay system to estimate the kinetics of the stimulus-induced processing (peptide bond cleavage) reaction. Based on the FRET system, it was clarified that introduction of a sterically less-hindered or polar residue at the position adjacent to the stimulus-responsive amino acid accelerates the processing reaction.

  在化学生物学领域中，通过刺激来控制肽基功能的方法引起了越来越多的关注。最近，我们报道了一种刺激反应性肽，暴露于刺激后可以裂解。在这项研究中，我们开发了一种基于FRET的测定系统，以评估刺激诱导的加工（肽键裂解）反应的动力学。基于FRET系统，澄清了在与刺激响应性氨基酸相邻的位置处引入空间较少受阻或极性的残基加速了加工反应。