micrococcin P1 | 67401-56-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酰胺类
• 英文名称: micrococcin P1
• 英文别名: 2-[2-[(12S,19S,26Z,29S)-26-ethylidene-14,21,28,31-tetrahydroxy-12,29-bis[(1R)-1-hydroxyethyl]-19-propan-2-yl-10,17,24,34-tetrathia-6,13,20,27,30,35,36,37,38-nonazahexacyclo[30.2.1.18,11.115,18.122,25.02,7]octatriaconta-1(35),2(7),3,5,8,11(38),13,15,18(37),20,22,25(36),27,30,32-pentadecaen-5-yl]-1,3-thiazol-4-yl]-N-[(Z)-1-hydroxy-1-[(2R)-2-hydroxypropyl]iminobut-2-en-2-yl]-1,3-thiazole-4-carboximidic acid
• CAS: 67401-56-3
• 化学式: C₄₈H₄₉N₁₃O₉S₆
• 分子量: 1144.39
• InChiKey: MQGFYNRGFWXAKA-QMXXNAFJSA-N

物化性质

• 密度：
  1.1650 (rough estimate)
• 溶解度：
  DMF：可溶； DMSO：可溶；乙醇：可溶；甲醇：可溶

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  76
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  495
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

制备方法与用途

生物活性

Micrococcin P1 是一种大环肽抗生素，有效抑制丙型肝炎病毒 (HCV)，EC50 值范围为 0.1-0.5 μM。此外，它还表现出对革兰氏阳性细菌菌株的体外抗菌活性：针对金黄色葡萄球菌 1974149、粪肠球菌 1674621 和化脓性链球菌 1744264 的最小抑菌浓度 (MIC) 分别为 2 μg/mL、1 μg/mL 和 1 μg/mL。Micrococcin P1 还对恶性疟原虫具有显著抑制作用。

靶点

• HCV
• 细菌
• 疟原虫

体外研究

剂量反应实验表明，Micrococcin P1 非常有效，其最小抑菌浓度 (MIC) 为 32-63 nM。细胞毒性实验显示，在 40 小时内，对于肝细胞系 HepG2 和单核细胞系 THP-1，该物质在 30 mM 浓度下对细胞生长的抑制作用不到 10%，选择性指数大于 500。此外，研究还探讨了 Micrococcin P1 的 intracellular 活性，其能够以约 1 mM 的 IC80 值有效对抗在 RAW 264.7 巨噬细胞内生长的表达 GFP 的 M. tuberculosis H37Rv 菌株，其效力与异烟肼相当。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 N,N-二异丙基乙胺 、 ((3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)oxy)tri(pyrrolidin-1-yl)phosphonium hexafluorophosphate(V) 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 micrococcin P1
  参考文献：
  名称：

  通过 Mo(vi) 催化剂全合成微球菌素 P1 和硫西林 I†

  摘要：

  硫肽是一类具有良好治疗潜力的强效抗生素。我们开发了一种新型 Mo( VI )-氧化物/吡啶甲酸催化剂，用于半胱氨酸肽环脱水形成噻唑啉杂环。借助这个强大的工具，我们完成了两种具有代表性的硫肽抗生素的全合成：微球菌素 P1 和硫西林 I。这两种简洁的合成（15 个步骤，最长的线性序列）采用 C-H 激活策略来安装三取代的吡啶核心和噻唑基团。通过针对一系列革兰氏阳性细菌的测量，该合成材料显示出有前景的抗菌特性。

  DOI：

  10.1039/c8sc04885a

文献信息

• Total Synthesis and Stereochemical Assignment of Micrococcin P1
  作者：David Lefranc、Marco A. Ciufolini

  DOI：10.1002/anie.200900621

  日期：2009.5.25

  Fifty years after the discovery of the thiopeptide antibiotic micrococcin P1, the constitutional and stereochemical uncertainties concerning its structure have been lifted with its total synthesis and absolute stereochemical assignment (see picture).

  发现硫肽抗生素微球菌素P1五十年后，通过其总合成和绝对立体化学分配，消除了有关其结构的组成和立体化学不确定性（见图）。
• Antibacterial method
  申请人：NORWEGIAN UNIVERSITY OF LIFE SCIENCES

  公开号：US10851139B2

  公开（公告）日：2020-12-01

  The present invention provides a method of killing, damaging or preventing the replication of bacteria comprising administering or applying a bacteriocin to said bacteria, wherein said bacteriocin is a peptide comprising the amino acid sequence MKFKFNPTGTIVKKLTQYEIAWFKNKHGYYPWEIPRC and related sequences, wherein the bacteria is selected from E. faecium, E. faecalis. E. hirae, S. pseudointermedius and/or S. hemolyticus; and/or in said method said bacteria are subjected to a stress condition. Also provided are related methods and uses such as methods of treatment. Also provided are novel truncation and fusion proteins variants such as MIKKFPNPYTLAAKLTTYEINWYKQQYGRYPWERPVA and MKFKFNPTGTIVKKLTQYEINWYKQQYGRYPWERPVA and their use as bacteriocins in various methods and uses.

  本发明提供了一种杀死、破坏或阻止细菌复制的方法，该方法包括对所述细菌施用或应用细菌素，其中所述细菌素是包含氨基酸序列MKFKFNPTGTIVKKLTQYEIAWFKNKHGYYPWEIPRC及相关序列的肽，其中所述细菌选自粪肠球菌、粪肠杆菌、假肠球菌和/或溶血杆菌；和/或在所述方法中，所述细菌受到应激条件的影响。E. hirae、S. pseudointermedius 和/或 S. hemolyticus；和/或在所述方法中，将所述细菌置于应激条件下。还提供了相关的方法和用途，如治疗方法。还提供了新型截短蛋白和融合蛋白变体，如MIKKFPNPYTLAAKLTTYEINWYKQQYGRYPWERPVA和MKFKFNPTGTIVKKLTQYEINWYKQYGRYPWERPVA及其在各种方法和用途中作为细菌素的使用。
• ANTIBACTERIAL METHOD
  申请人：NORWEGIAN UNIVERSITY OF LIFE SCIENCES

  公开号：US20190322705A1

  公开（公告）日：2019-10-24

  The present invention provides a method of killing, damaging or preventing the replication of bacteria comprising administering or applying a bacteriocin to said bacteria, wherein said bacteriocin is a peptide comprising the amino acid sequence MKFKFNPTGTIVKKLTQYEIAWFKNKHGYYPWEIPRC and related sequences, wherein the bacteria is selected from E. faecium, E. faecalis. E. hirae, S. pseudointermedius and/or S. hemolyticus; and/or in said method said bacteria are subjected to a stress condition. Also provided are related methods and uses such as methods of treatment. Also provided are novel truncation and fusion proteins variants such as MIKKFPNPYTLAAKLTTYEINWYKQQYGRYPWERPVA and MKFKFNPTGTIVKKLTQYEINWYKQQYGRYPWERPVA and their use as bacteriocins in various methods and uses.
• Total synthesis of micrococcin P1 and thiocillin I enabled by Mo(<scp>vi</scp>) catalyst
  作者：Siddhartha Akasapu、Aaron B. Hinds、Wyatt C. Powell、Maciej A. Walczak

  DOI：10.1039/c8sc04885a

  日期：——

  Thiopeptides are a class of potent antibiotics with promising therapeutic potential. We developed a novel Mo(VI)-oxide/picolinic acid catalyst for the cyclodehydration of cysteine peptides to form thiazoline heterocycles. With this powerful tool in hand, we completed the total syntheses of two representative thiopeptide antibiotics: micrococcin P1 and thiocillin I. These two concise syntheses (15 steps

  硫肽是一类具有良好治疗潜力的强效抗生素。我们开发了一种新型 Mo( VI )-氧化物/吡啶甲酸催化剂，用于半胱氨酸肽环脱水形成噻唑啉杂环。借助这个强大的工具，我们完成了两种具有代表性的硫肽抗生素的全合成：微球菌素 P1 和硫西林 I。这两种简洁的合成（15 个步骤，最长的线性序列）采用 C-H 激活策略来安装三取代的吡啶核心和噻唑基团。通过针对一系列革兰氏阳性细菌的测量，该合成材料显示出有前景的抗菌特性。