(1S,3R)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-2,3,4,9-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]indole-3-carboxylic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 生物碱及其衍生物 - 哈马拉生物碱
• 英文名称: (1S,3R)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-2,3,4,9-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]indole-3-carboxylic acid
• 英文别名: NSC96603；(1S,3R)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-2,3,4,9-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]indol-2-ium-3-carboxylate
• 化学式: C₂₀H₂₀N₂O₄
• 分子量: 352.39
• InChiKey: JLKKXFLIQLNLAN-QAPCUYQASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  83.6
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,3R)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-2,3,4,9-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]indole-3-carboxylic acid 在 盐酸羟胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 (1S,3R)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-N-(4-(hydroxycarbamoyl)benzyl)-2,3,4,9-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]indole-3-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  四氢-β-咔啉衍生物作为有效的组蛋白脱乙酰酶 6 抑制剂，具有广谱抗增殖活性

  摘要：

  应用支架跳跃策略合理设计并合成了一系列基于四氢β-咔啉（TH β C）的异羟肟酸作为新型选择性HDAC6抑制剂（sHDAC6is）。几种 TH β C 类似物对 HDAC6 酶具有高效能（IC 50 < 5 nM）和选择性，并对人多发性骨髓瘤(MM) 细胞表现出良好的抗增殖活性。分子对接解释了结构活性关系（SAR）。使用 WB 测定在 RPMI-8226 细胞中证实了 HDAC6 的靶标参与。体外，(1 S , 3 R )-1-(4-氯苯基) -N -(4-(羟基氨基甲酰基)苄基)-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3, 4- b ] indole-3-carboxamide ( 14g ) 对各种肿瘤（包括白血病、结肠癌、黑色素瘤和乳腺癌细胞系）表现出有效、广泛的抗增殖活性，优于 ACY-1215。此外， 14g在小鼠口服给药中也表现出良好的药代动力学特性。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2023.115776
• 作为产物：
  描述：

  (1S,3R)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-2,3,4,9-tetrahydro-1H-β-carboline-3-carboxylic acid methyl ester 在 lithium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 生成 (1S,3R)-1-(3,4-dimethoxyphenyl)-2,3,4,9-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]indole-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  四氢-β-咔啉衍生物作为有效的组蛋白脱乙酰酶 6 抑制剂，具有广谱抗增殖活性

  摘要：

  应用支架跳跃策略合理设计并合成了一系列基于四氢β-咔啉（TH β C）的异羟肟酸作为新型选择性HDAC6抑制剂（sHDAC6is）。几种 TH β C 类似物对 HDAC6 酶具有高效能（IC 50 < 5 nM）和选择性，并对人多发性骨髓瘤(MM) 细胞表现出良好的抗增殖活性。分子对接解释了结构活性关系（SAR）。使用 WB 测定在 RPMI-8226 细胞中证实了 HDAC6 的靶标参与。体外，(1 S , 3 R )-1-(4-氯苯基) -N -(4-(羟基氨基甲酰基)苄基)-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3, 4- b ] indole-3-carboxamide ( 14g ) 对各种肿瘤（包括白血病、结肠癌、黑色素瘤和乳腺癌细胞系）表现出有效、广泛的抗增殖活性，优于 ACY-1215。此外， 14g在小鼠口服给药中也表现出良好的药代动力学特性。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2023.115776

文献信息

• Discovery of novel phosphatidylcholine-specific phospholipase C drug-like inhibitors as potential anticancer agents
  作者：Chatchakorn Eurtivong、Lisa I. Pilkington、Michelle van Rensburg、Reuben M. White、Harpreet Kaur Brar、Shaun Rees、Emily K. Paulin、Chris Sun Xu、Nabangshu Sharma、Ivanhoe K.H. Leung、Euphemia Leung、David Barker、Jóhannes Reynisson

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.111919

  日期：2020.2

  Phosphatidylcholine-specific phospholipase C (PC-PLC) is a promising target for new anticancer treatment. Herein, we report our work in the discovery of novel drug-like PC-PLC inhibitors. Virtual screening led to the identification of promising hits from four different structural series that contain the molecular scaffold of benzenesulphonamides (10), pyrido[3,4-b]indoles (22), morpholinobenzoic acid (84) and benzamidobenzoic acid (80). 164 structural analogues were tested to investigate the chemical space around the hit series and to generate preliminary structurally activity relationships (SAR). Two of the pyrido[3,4-b]indoles (22_10 and 22_15) had comparable or better potency as D609, an established but non-drug-like PC-PLC inhibitor. Furthermore, three morpholinobenzoic acids (84, 84_4 and 84_5) had superior potency than D609. Therefore, this study paves the way towards the development of drug-like PL-PLC inhibitors as potential anticancer agents. (C) 2019 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
• Design, synthesis and antiproliferative evaluation of tetrahydro-β-carboline histone deacetylase inhibitors bearing an aliphatic chain linker
  作者：Jing Shi、Jiayun Wang、Xingjie Wang、Chao Qu、Changchun Ye、Xiuli Li、Xin Chen、Zhengshui Xu

  DOI：10.1039/d4ra01672f

  日期：2024.4.16

  The use of histone deacetylase inhibitors (HDACis) is an effective approach for cancer treatment.
• Tetrahydro-β-carboline derivatives as potent histone deacetylase 6 inhibitors with broad-spectrum antiproliferative activity
  作者：Xin Chen、Jiayun Wang、Peng Zhao、Baiyun Dang、Ting Liang、Raphael R. Steimbach、Aubry K. Miller、Jia Liu、Xin Wang、Tongtong Zhang、Xiaofa Luan、Jiadong Hu、Jinming Gao

  DOI：10.1016/j.ejmech.2023.115776

  日期：2023.11

  application of scaffold hopping strategy. Several THβC analogues were highly potent (IC50 < 5 nM) and selective against HDAC6 enzyme and exhibited good antiproliferative activity against human multiple myeloma (MM) cell. Molecular docking interpreted the structure activity relationship (SAR). Target engagement of HDAC6 was confirmed in RPMI-8226 cells using the WB assay. In vitro, (1S, 3R)-1-(4-chloro

  应用支架跳跃策略合理设计并合成了一系列基于四氢β-咔啉（TH β C）的异羟肟酸作为新型选择性HDAC6抑制剂（sHDAC6is）。几种 TH β C 类似物对 HDAC6 酶具有高效能（IC 50 < 5 nM）和选择性，并对人多发性骨髓瘤(MM) 细胞表现出良好的抗增殖活性。分子对接解释了结构活性关系（SAR）。使用 WB 测定在 RPMI-8226 细胞中证实了 HDAC6 的靶标参与。体外，(1 S , 3 R )-1-(4-氯苯基) -N -(4-(羟基氨基甲酰基)苄基)-2,3,4,9-四氢-1H-吡啶并[3, 4- b ] indole-3-carboxamide ( 14g ) 对各种肿瘤（包括白血病、结肠癌、黑色素瘤和乳腺癌细胞系）表现出有效、广泛的抗增殖活性，优于 ACY-1215。此外， 14g在小鼠口服给药中也表现出良好的药代动力学特性。