5-<3-<<2-<<4-(4'-methyl-2,2'-bipyridin-4-yl)-1-oxobutyl>amino>ethyl>amino>-3-oxopropyl>-2'-deoxyuridine | 130699-90-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-<3-<<2-<<4-(4'-methyl-2,2'-bipyridin-4-yl)-1-oxobutyl>amino>ethyl>amino>-3-oxopropyl>-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 5-{3-{{2-{{4-(4'-methyl-2,2'-bipyridin-4'-yl)-1-oxobutyl}-amino}ethyl}amino}-3-oxopropyl}-2'-deoxyuridine；N-[2-[3-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]propanoylamino]ethyl]-4-[2-(4-methylpyridin-2-yl)pyridin-4-yl]butanamide
• CAS: 130699-90-0
• 化学式: C₂₉H₃₆N₆O₇
• 分子量: 580.641
• InChiKey: UDQOQACFCBQPLK-CLCZQPDDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  183
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-<3-<<2-<<4-(4'-methyl-2,2'-bipyridin-4-yl)-1-oxobutyl>amino>ethyl>amino>-3-oxopropyl>-2'-deoxyuridine 、 copper dichloride 在 HEPES buffer 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 {5-{3-{{2-{{4-(4'-methyl-2,2'-bipyridin-4'-yl)-1-oxobutyl}amino-}ethyl}amino}-3-oxopropyl}-2'-deoxyuridine}copper(II)chloride
  参考文献：
  名称：

  走向化学核糖核酸酶。2. 核苷-联吡啶偶联物的合成和表征。RNA 的铜 (II) 复合物水解裂解

  摘要：

  作为我们开发通过磷酸二酯水解切割 RNA 的化学核糖核酸酶的计划的一部分，描述了对共价连接的核苷-2,2'-联吡啶 (bpy) 偶联物​​的系统研究

  DOI：

  10.1021/ja00001a041
• 作为产物：
  描述：

  4-甲基-4'-(3-羟丙基)-2,2'-双吡啶 在 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 36.25h， 生成 5-<3-<<2-<<4-(4'-methyl-2,2'-bipyridin-4-yl)-1-oxobutyl>amino>ethyl>amino>-3-oxopropyl>-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  走向化学核糖核酸酶。2. 核苷-联吡啶偶联物的合成和表征。RNA 的铜 (II) 复合物水解裂解

  摘要：

  作为我们开发通过磷酸二酯水解切割 RNA 的化学核糖核酸酶的计划的一部分，描述了对共价连接的核苷-2,2'-联吡啶 (bpy) 偶联物​​的系统研究

  DOI：

  10.1021/ja00001a041

文献信息

• US6258941B1
  申请人：——

  公开号：US6258941B1

  公开（公告）日：2001-07-10
• [EN] RNA HYDROLYSIS/CLEAVAGE
  申请人：MONSANTO COMPANY

  公开号：WO1991019730A1

  公开（公告）日：1991-12-26

  (EN) The selected sequence-directed hydrolysis of RNA under physiologically relevant conditions is described using conjugates comprising metal complexes covalently linked to oligodeoxynucleotides as hydrolysis agents. The oligodeoxynucleotide portions of the agents are selected to provide molecular recognition via the Watson Crick base pairing to the target RNA sequence to be hydrolyzed. A method is described for determining the RNA hydrolysis effectiveness of metals and ligands used to form the metal complexes useful in this invention. Also the selected sequence-directed cleavage of RNA is described using conjugates comprising two or more imidazole groups covalently linked to oligodeoxynucleotides as cleavage agents and combinations of conjugates comprising one or more imidazole groups covalently linked to two or more oligodeoxynucleotides. The oligodeoxynucleotide portions of the agents are selected to provide molecular recognition via the Watson Crick base pairing to the target RNA sequence to be cleaved.(FR) L'invention se rapporte à l'hydrolyse sélectionnée dirigée par séquences qui est effectuée sur des ARN dans des conditions physiologiquement pertinentes grâce à l'utilisation, comme agents d'hydrolyse, de conjugués comprenant des complexes métalliques liés par covalence à des oligodésoxynucléotides. Les parties oligodésoxynucléotides des agents sont sélectionnées de façon à assurer une reconnaissance moléculaire par l'intermédiaire de l'accouplement des bases Watson Cryck à la séquence d'ARN cible devant faire l'objet de l'hydrolyse. Un procédé est prévu pour déterminer l'efficacité, dans l'hydrolyse des ARN, des métaux et des ligands utilisés pour former les complexes métalliques utiles. L'invention décrit également le clivage sélectionné dirigé par séquences qui est effectué sur des ARN grâce à l'utilisation, comme agents de clivage, de conjugués comprenant deux groupes imidazole ou davantage liés par covalence à des oligodésoxynucléotides et de combinaisons de conjugués comprenant un plusieurs groupes imidazole liés par covalence à deux oligodésoxynucléotides ou davantage. Les parties oligodésoxynucléotides de ces agents sont sélectionnées pour assurer une reconnaissance moléculaire par l'intermédiaire de l'accouplement des bases Watson Crick à la séquence d'ARN cible devant faire l'objet du clivage.
• Toward Chemical Ribonucleases. 2. Synthesis and Characterization of Nucleoside-Bipyridine Conjugates. Hydrolytic Cleavage of RNA by Their Copper(II) Complexes
  作者：Amil Modak、Janice Gard、Michael Merriman、Kimberly Winkeler、James Bashkin、Michael Stern

  DOI：10.1021/ja00001a041

  日期：1991.1

  As part of our program to develop chemical ribonucleases that cleave RNA by phosphodiester hydrolysis, a systematic study of covalently linked nucleoside-2,2'-bipyridine (bpy) conjugates is described

  作为我们开发通过磷酸二酯水解切割 RNA 的化学核糖核酸酶的计划的一部分，描述了对共价连接的核苷-2,2'-联吡啶 (bpy) 偶联物​​的系统研究