5'-O-DMT-2'-O-propynyl-uridine | 171486-54-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-DMT-2'-O-propynyl-uridine
• 英文别名: prop-2-ynyl(-2)[DMT(-5)]Ribf(b)-uracil-1-yl；1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-3-prop-2-ynoxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 171486-54-7
• 化学式: C₃₃H₃₂N₂O₈
• 分子量: 584.626
• InChiKey: VFYMBSPPKISNAZ-PMFUCWTESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-DMT-2'-O-propynyl-uridine 在 吡啶 、 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基氟化铵 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 乙酸乙酯 、 乙腈 为溶剂， 反应 28.0h， 生成 2’-O-propargyl-5’-dimethoxytrityl-N⁴-acetyl-cytidine
  参考文献：
  名称：

  2'-O-丙炔基-5'-二甲氧三苯甲基-N4-乙酰基-胞苷的合成方法

  摘要：

  本发明涉及一种2'‑O‑丙炔基‑5'‑二甲氧三苯甲基‑N4‑乙酰基‑胞苷的合成方法，以5'‑O‑DMT‑2'‑O‑丙炔基‑尿苷为反应底物，采用四步联投的方式合成2'‑O‑丙炔基‑5'‑二甲氧三苯甲基‑N4‑乙酰基‑胞苷，避免了异构体的产生，提高了产物的纯度和质量，缩减了纯化的步骤，降低了生产成本，提高了生产效率，简化了操作，降低了成本。

  公开号：

  CN117417400A
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 碳酸二苯酯 、 三氟化硼乙醚 、 碳酸氢钠 作用下， 以 N,N-二甲基乙酰胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 31.42h， 生成 5'-O-DMT-2'-O-propynyl-uridine
  参考文献：
  名称：

  5'-O-DMT-2'-O-丙炔基-尿苷的合成方法

  摘要：

  本发明涉及一种5'‑O‑DMT‑2'‑O‑丙炔基‑尿苷的合成方法，主要采用2'‑O‑丙炔基‑尿苷为底物，通过加入4,4'‑双甲氧基三苯甲基氯和吡啶，并通过设计的特定的工艺将2'‑O‑丙炔基‑尿苷转化为5'‑O‑DMT‑2'‑O‑丙炔基‑尿苷。本申请的合成技术路线中，不会产生异构体，缩减了纯化的时间，降低了成本，且合成过程中不涉及管制试剂，有利于产业化生产。

  公开号：

  CN117551155B

文献信息

• EXTRAHEPATIC DELIVERY
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：US20220125823A1

  公开（公告）日：2022-04-28

  The invention relates to a method of gene silencing, comprising administering to a cell or a subject in need thereof a therapeutically effective amount of the lipophilic moieties-conjugated double-stranded iRNAs at one or more internal positions on at least one strand, optionally via a linker or carrier.

  本发明涉及一种基因沉默方法，包括向细胞或需要治疗的受体中给予脂溶性基团偶联的双链iRNA，在至少一条链的一个或多个内部位置上给予治疗有效量，可选地通过连接剂或载体给予。
• DELIVERY OF OLIGONUCLEOTIDES TO THE STRIATUM
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：US20220307024A1

  公开（公告）日：2022-09-29

  One aspect of the present invention relates to a double stranded iRNA agent comprising an antisense strand which is complementary to a target gene; a sense strand which is complementary to said antisense strand; and one or more lipophilic moieties conjugated to one or more internal positions on at least one strand, optionally via a linker or carrier, which provides for targeting to, and uptake by, tissues and cells of the CNS, and in particular the striatum. Another aspect of the invention relates to a method of gene silencing in tissues and cells of the CNS, and in particular the striatum, that includes administering to a tissue/cell or a subject in need thereof a therapeutically effective amount of the lipophilic moieties-conjugated double-stranded iRNAs.

  本发明的一个方面涉及双链iRNA剂，包括一个与目标基因互补的反义链;一个与该反义链互补的正义链;以及一个或多个脂溶性基团，通过连接物或载体与至少一条链上的一个或多个内部位置结合，从而实现对中枢神经系统组织和细胞，特别是纹状体的靶向和摄取。本发明的另一个方面涉及一种在中枢神经系统组织和细胞，特别是纹状体中基因沉默的方法，包括向需要治疗的组织/细胞或受试者中注射足够疗效量的脂溶性基团结合的双链iRNA。
• 一种医药中间体及其制备方法
  申请人：苏州诺维康生物科技有限公司

  公开号：CN117866026A

  公开（公告）日：2024-04-12

  本发明公开了一种医药中间体DMT‑2'‑O‑丙炔基‑U‑CE‑亚磷酰胺的制备方法，利用5'‑O‑DMT‑2'‑O‑丙炔基‑尿苷在溶剂中与亚磷酰胺试剂在催化剂作用下得到DMT‑2'‑O‑丙炔基‑U‑CE‑亚磷酰胺；其中亚磷酰胺试剂选自式Ⅰ化合物、式Ⅱ化合物中的任意一种，催化剂选自四唑系化合物、咪唑系化合物中的任意一种。本发明的制备方法步骤简单，无特殊试剂和反应条件的苛刻要求，反应中副反应少、产物收率和纯度高。
• Versatile Site-Specific Conjugation of Small Molecules to siRNA Using Click Chemistry
  作者：Takeshi Yamada、Chang Geng Peng、Shigeo Matsuda、Haripriya Addepalli、K. Narayanannair Jayaprakash、Md. Rowshon Alam、Kathy Mills、Martin A. Maier、Klaus Charisse、Mitsuo Sekine、Muthiah Manoharan、Kallanthottathil G. Rajeev

  DOI：10.1021/jo101761g

  日期：2011.3.4

  We have previously demonstrated that conjugation of small molecule ligands to small interfering RNAs (siRNAs) and anti-microRNAs results in functional siRNAs and antagomirs in vivo. Here we report on the development of an efficient chemical strategy to make oligoribonucleotide-ligand conjugates using the copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) or click reaction. Three click reaction approaches were evaluated for their feasibility and suitability for high-throughput synthesis: the CuAAC reaction at the monomer level prior to oligonucleotide synthesis, the solution-phase postsynthetic "click conjugation", and the "click conjugation" on an immobilized and cornpletely protected alkyne-oligonucleotide scaffold. Nucleosides bearing 5'-alkyne moieties were used for conjugation to the 5'-end of the oligonucleotide. Previously described 2'- and 3'-O-propargylated nucleosides were prepared to introduce the alkyne moiety to the 3' and 5' termini and to the internal positions of the scaffold. Azido-functionalized ligands bearing lipophilic long chain alkyls, cholesterol, oligoamine, and carbohydrate were utilized to study the effect of physicochemical characteristics of the incoming azide on click conjugation to the alkyne-oligonucleotide scaffold in solution and on immobilized solid support. We found that microwave-assisted click conjugation of azido-functionalized ligands to a fully protected solid-support bound alkyne-oligonucleotide prior to deprotection was the most efficient "click conjugation" strategy for site-specific, high-throughput oligonucleotide conjugate synthesis tested. The siRNA conjugates synthesized using this approach effectively silenced expression of a luciferase gene in a stably transformed HeLa cell line.
• 2'-O-丙炔基-5'-二甲氧三苯甲基-N4-乙酰基-胞苷的合成方法
  申请人：苏州诺维康生物科技有限公司

  公开号：CN117417400A

  公开（公告）日：2024-01-19

  本发明涉及一种2'‑O‑丙炔基‑5'‑二甲氧三苯甲基‑N4‑乙酰基‑胞苷的合成方法，以5'‑O‑DMT‑2'‑O‑丙炔基‑尿苷为反应底物，采用四步联投的方式合成2'‑O‑丙炔基‑5'‑二甲氧三苯甲基‑N4‑乙酰基‑胞苷，避免了异构体的产生，提高了产物的纯度和质量，缩减了纯化的步骤，降低了生产成本，提高了生产效率，简化了操作，降低了成本。