2'-deoxy-2'-α-C-(2-amidoethyl)uridine | 924891-00-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-deoxy-2'-α-C-(2-amidoethyl)uridine
• CAS: 924891-00-9
• 化学式: C₁₂H₁₇N₃O₆
• 分子量: 299.283
• InChiKey: KSIKICKFURDYNX-FEMGGFCSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.33
• 重原子数：
  21.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  147.64
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-deoxy-2'-α-C-(2-amidoethyl)uridine 在 吡啶 、 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 2'-deoxy-2'-α-C-2'-(2-amidoethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  含2'- C-酰氨基烷基和2'- C-氰基烷基的寡脱氧核糖核苷酸的合成及其对互补DNA和RNA的杂交亲和力评估

  摘要：

  合成了含有2'- C-支链核苷且酰胺或腈附接到一个或两个碳烷基链上的寡脱氧核苷酸。制备2'- C-修饰的核苷的亚磷酰胺，并使用自动DNA合成将其掺入寡核苷酸中。通过紫外熔解实验测量了具有互补RNA和DNA的双链体稳定性，以评估酰胺/腈功能是否可以在不存在2'-氧的情况下诱导任何双链体稳定性。在没有2'-氧的情况下，含有2'- C-修饰的寡核苷酸的双链体稳定性降低。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2006.11.024
• 作为产物：
  描述：

  2'-deoxy-2'-α-C-(2-cyanoethyl)-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxy)uridine 在 manganese(IV) oxide 、 silica gel 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 2'-deoxy-2'-α-C-(2-amidoethyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  含2'- C-酰氨基烷基和2'- C-氰基烷基的寡脱氧核糖核苷酸的合成及其对互补DNA和RNA的杂交亲和力评估

  摘要：

  合成了含有2'- C-支链核苷且酰胺或腈附接到一个或两个碳烷基链上的寡脱氧核苷酸。制备2'- C-修饰的核苷的亚磷酰胺，并使用自动DNA合成将其掺入寡核苷酸中。通过紫外熔解实验测量了具有互补RNA和DNA的双链体稳定性，以评估酰胺/腈功能是否可以在不存在2'-氧的情况下诱导任何双链体稳定性。在没有2'-氧的情况下，含有2'- C-修饰的寡核苷酸的双链体稳定性降低。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2006.11.024