3'-azido-3'-deoxythymidine 5'-O-β,γ-methylenetriphosphate | 116015-32-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机膦酸及其衍生物
• 英文名称: 3'-azido-3'-deoxythymidine 5'-O-β,γ-methylenetriphosphate
• 英文别名: AZTppCH2p；[[[(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]methylphosphonic acid
• CAS: 116015-32-8
• 化学式: C₁₁H₁₈N₅O₁₂P₃
• 分子量: 505.212
• InChiKey: ATXGWBPEWGUGFS-DJLDLDEBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.4
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  224
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-azido-3'-deoxythymidine 5'-O-β,γ-methylenetriphosphate 在 乙二胺四乙酸 、 水 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.58h， 以276 mg的产率得到cytidine 5'-O-β,γ-methylenetriphosphate
  参考文献：
  名称：

  Solid-phase synthesis of 5′-O-β,γ-methylenetriphosphate derivatives of nucleosides and evaluation of their inhibitory activity against HIV-1 reverse transcriptase

  摘要：

  Bis(dichlorophosphino)methane was converted to a beta,gamma-methylenetriphosphitylating reagent. The reagent was immobilized on aminomethyl polystyrene resin-bound linker of 4-acetoxy-3-phenylbenzyl alcohol to afford a polymer-bound beta,gamma-methylenetriphosphitylating reagent, which was reacted with unprotected nucleosides followed by oxidation with tert-butyl hydroperoxide, deprotection of cyanoethoxy groups with DBU, and acidic cleavage to produce 5'-O-beta,gamma-methylene triphosphate nucleosides in 53- 82% overall yields. Among all the compounds, cytidine 5'-O-beta,gamma-methylenetriphosphate inhibited completely RNase H activity of HIV-1 reverse transcriptase at 700 mu M. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2010.04.005
• 作为产物：
  描述：

  齐多夫定 在 磷酸三甲酯 、 三氯氧磷 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 75.0h， 生成 3'-azido-3'-deoxythymidine 5'-O-β,γ-methylenetriphosphate
  参考文献：
  名称：

  将天然和非天然核苷三磷酸导入细菌的工具

  摘要：

  三磷酸核苷在生物学中发挥着核心作用，但研究这些作用的努力已被证明是困难的，因为细胞中三磷酸的水平受到严格调控，而且单个三磷酸可能难以标记或修饰。此外，许多合成生物学工作都集中在开发在细胞环境中发挥特定功能的非天然三磷酸核苷。一般而言，将所需的三磷酸盐直接引入细胞的一般手段将促进这两种努力。以前，我们证明了来自三角褐指藻 (PtNTT2) 的核苷三磷酸转运蛋白在大肠杆菌中的重组表达，其功能是导入添加到培养基中的三磷酸。在这里，为了探索这种方法的普遍性和实用性，我们报告了 PtNTT2 的构效关系研究。我们使用传统的竞争性摄取抑制分析来表征核碱基、糖和三磷酸修饰的影响，然后开发 LC-MS/MS 分析以直接测量修饰对导入的影响。最后，我们使用转运蛋白导入放射性标记或 2'-氟修饰的三磷酸，并量化它们与 DNA 和 RNA 的结合。结果证明了 PtNTT2 介导的天然或修饰的三磷酸核苷导入对于不

  DOI：

  10.1021/jacs.7b11404

文献信息

• A Tool for the Import of Natural and Unnatural Nucleoside Triphosphates into Bacteria
  作者：Aaron W. Feldman、Emil C. Fischer、Michael P. Ledbetter、Jen-Yu Liao、John C. Chaput、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1021/jacs.7b11404

  日期：2018.1.31

  Nucleoside triphosphates play a central role in biology, but efforts to study these roles have proven difficult because the levels of triphosphates are tightly regulated in a cell and because individual triphosphates can be difficult to label or modify. In addition, many synthetic biology efforts are focused on the development of unnatural nucleoside triphosphates that perform specific functions in

  三磷酸核苷在生物学中发挥着核心作用，但研究这些作用的努力已被证明是困难的，因为细胞中三磷酸的水平受到严格调控，而且单个三磷酸可能难以标记或修饰。此外，许多合成生物学工作都集中在开发在细胞环境中发挥特定功能的非天然三磷酸核苷。一般而言，将所需的三磷酸盐直接引入细胞的一般手段将促进这两种努力。以前，我们证明了来自三角褐指藻 (PtNTT2) 的核苷三磷酸转运蛋白在大肠杆菌中的重组表达，其功能是导入添加到培养基中的三磷酸。在这里，为了探索这种方法的普遍性和实用性，我们报告了 PtNTT2 的构效关系研究。我们使用传统的竞争性摄取抑制分析来表征核碱基、糖和三磷酸修饰的影响，然后开发 LC-MS/MS 分析以直接测量修饰对导入的影响。最后，我们使用转运蛋白导入放射性标记或 2'-氟修饰的三磷酸，并量化它们与 DNA 和 RNA 的结合。结果证明了 PtNTT2 介导的天然或修饰的三磷酸核苷导入对于不
• Solid-phase synthesis of 5′-O-β,γ-methylenetriphosphate derivatives of nucleosides and evaluation of their inhibitory activity against HIV-1 reverse transcriptase
  作者：Yousef Ahmadibeni、Chandravanu Dash、Stuart F.J. Le Grice、Keykavous Parang

  DOI：10.1016/j.tetlet.2010.04.005

  日期：2010.6

  Bis(dichlorophosphino)methane was converted to a beta,gamma-methylenetriphosphitylating reagent. The reagent was immobilized on aminomethyl polystyrene resin-bound linker of 4-acetoxy-3-phenylbenzyl alcohol to afford a polymer-bound beta,gamma-methylenetriphosphitylating reagent, which was reacted with unprotected nucleosides followed by oxidation with tert-butyl hydroperoxide, deprotection of cyanoethoxy groups with DBU, and acidic cleavage to produce 5'-O-beta,gamma-methylene triphosphate nucleosides in 53- 82% overall yields. Among all the compounds, cytidine 5'-O-beta,gamma-methylenetriphosphate inhibited completely RNase H activity of HIV-1 reverse transcriptase at 700 mu M. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.