3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1-methyl-1H-pyrrol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine | 1582719-87-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1-methyl-1H-pyrrol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine
• CAS: 1582719-87-6
• 化学式: C₂₇H₄₆N₄O₅Si₂
• 分子量: 562.857
• InChiKey: UBPMIMNZMFUXEH-QZNHQXDQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.11±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.53
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  96.61
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1-methyl-1H-pyrrol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 4.0h， 以75%的产率得到4-N-(1-methyl-1H-pyrrol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  A new modified cytosine base capable of base pairing with guanine using four hydrogen bonds

  摘要：

  含有4-N-(1H-吡咯-2-基甲酰)脱氧胞苷（dC^Pyc）及相关衍生物的寡核苷酸，通过使用1.5 M NaOMe/MeOH进行去保护合成。

  DOI：

  10.1039/c3ob42420k
• 作为产物：
  描述：

  1-甲基吡咯-2-羰酰氯 、 2',3'-二-O-(叔-丁基二甲基硅烷基)-2'-脱氧胞苷 在 吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以87%的产率得到3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1-methyl-1H-pyrrol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  A new modified cytosine base capable of base pairing with guanine using four hydrogen bonds

  摘要：

  含有4-N-(1H-吡咯-2-基甲酰)脱氧胞苷（dC^Pyc）及相关衍生物的寡核苷酸，通过使用1.5 M NaOMe/MeOH进行去保护合成。

  DOI：

  10.1039/c3ob42420k