(E)-1-benzyl-1,4-dihydro-4,6-dimethyl-7-(3-methyl-1-butenyl)-9H-imidazo<1,2-a>purin-9-one | 124910-11-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: (E)-1-benzyl-1,4-dihydro-4,6-dimethyl-7-(3-methyl-1-butenyl)-9H-imidazo<1,2-a>purin-9-one
• 英文别名: 1-benzyl-4,6-dimethyl-7-[(E)-3-methylbut-1-enyl]imidazo[1,2-a]purin-9-one
• CAS: 124910-11-8
• 化学式: C₂₁H₂₃N₅O
• 分子量: 361.447
• InChiKey: PODIOHLNNMKYSN-ZHACJKMWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  56
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-1-benzyl-1,4-dihydro-4,6-dimethyl-7-(3-methyl-1-butenyl)-9H-imidazo<1,2-a>purin-9-one 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 5.0h， 以73%的产率得到1-benzyl-1,4-dihydro-4,6-dimethyl-7-(3-methylbutyl)-9H-imidazo<1,2-a>purin-9-one
  参考文献：
  名称：

  Studies towards the synthesis of the fluorescent bases of phenylalanine transfer ribonucleic acids: Synthesis of 7-(2-Hydroxy-3-methylbutyl)wye, a model for the minor base isolated from rat liver.

  摘要：

  在 Ph3P 存在下，用 PBr3 处理 1-苄基-7-(羟甲基)碱 (8)，得到溴化鏻 9，收率很高；在 K2CO3 存在下，在 MeOH 中加热 9 和 Me2 CHCHO (7)，得到 1-苄基-1、4-二氢-4, 7-二甲基-6-(3-甲基-1-丁烯基)-9H-咪唑并[1, 2-a]嘌呤-9-酮 (11)的主要产物，它是客观存在的 1-苄基-7-(3-甲基-1-丁烯基)wye (5)的位置异构体。当以 n-BuLi 为碱在 Me2NCHO 中于 -65°C 进行反应时，可获得 7 : 2 的 (E)-5 和 (Z)-5 混合物，收率很高。在类似条件下，受保护的氨基醛 18 和 21 都没有得到所需的烯烃，这表明该方法在合成苯丙氨酸转移核糖核酸（tRNAsPhe）的荧光碱基方面的适用性较差。化合物 5 是通过 1-苄基-7-甲酰基黑麦草（3）和 Ph3P+CH2CHMe2 I- （4）在四氢呋喃中的 Wittig 反应合成的，为几何异构体的等摩尔混合物，收率为 50%。在室温下于 Me2SO 中使用 NaCH2SOMe 和 4 各两当量进行反应时，得到的高产率产物为 (E)-11。使用等摩尔量的碱得到(E)-5，收率为 26%。用 OsO4 氧化 (E)-5，然后在 Pd-C 上进行氢解，得到了 7-(2-羟基-3-甲基丁基)wye (2)，这是大鼠肝脏 tRNA.Phe 小碱基的模型。

  DOI：

  10.1248/cpb.37.1221
• 作为产物：
  描述：

  1-benzyl-1,4-dihydro-7-hydroxymethyl-4,6-dimethyl-9H-imidazo<1,2-a>purin-9-one 在 正丁基锂 、 三溴化磷 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.63h， 生成 (E)-1-benzyl-1,4-dihydro-4,6-dimethyl-7-(3-methyl-1-butenyl)-9H-imidazo<1,2-a>purin-9-one
  参考文献：
  名称：

  Studies towards the synthesis of the fluorescent bases of phenylalanine transfer ribonucleic acids: Synthesis of 7-(2-Hydroxy-3-methylbutyl)wye, a model for the minor base isolated from rat liver.

  摘要：

  在 Ph3P 存在下，用 PBr3 处理 1-苄基-7-(羟甲基)碱 (8)，得到溴化鏻 9，收率很高；在 K2CO3 存在下，在 MeOH 中加热 9 和 Me2 CHCHO (7)，得到 1-苄基-1、4-二氢-4, 7-二甲基-6-(3-甲基-1-丁烯基)-9H-咪唑并[1, 2-a]嘌呤-9-酮 (11)的主要产物，它是客观存在的 1-苄基-7-(3-甲基-1-丁烯基)wye (5)的位置异构体。当以 n-BuLi 为碱在 Me2NCHO 中于 -65°C 进行反应时，可获得 7 : 2 的 (E)-5 和 (Z)-5 混合物，收率很高。在类似条件下，受保护的氨基醛 18 和 21 都没有得到所需的烯烃，这表明该方法在合成苯丙氨酸转移核糖核酸（tRNAsPhe）的荧光碱基方面的适用性较差。化合物 5 是通过 1-苄基-7-甲酰基黑麦草（3）和 Ph3P+CH2CHMe2 I- （4）在四氢呋喃中的 Wittig 反应合成的，为几何异构体的等摩尔混合物，收率为 50%。在室温下于 Me2SO 中使用 NaCH2SOMe 和 4 各两当量进行反应时，得到的高产率产物为 (E)-11。使用等摩尔量的碱得到(E)-5，收率为 26%。用 OsO4 氧化 (E)-5，然后在 Pd-C 上进行氢解，得到了 7-(2-羟基-3-甲基丁基)wye (2)，这是大鼠肝脏 tRNA.Phe 小碱基的模型。

  DOI：

  10.1248/cpb.37.1221

文献信息

• Isomerization through Cleavage and Recombination of Imidazolide Linkage in the Condensed Tricyclic System Related to Hypermodified Bases of Phenylalanine Transfer Ribonucleic Acids.
  作者：Taisuke ITAYA、Tae KANAI、Shin-ichi OHYAMA、Yoshihisa SHIRASAKI、Nobuhiro MURAMOTO、Yukiko ONO

  DOI：10.1248/cpb.47.1464

  日期：——

  1-Benzyl-4, 6-dimethyl-4, 9-dihydro-1H-imidazo[1, 2-α]purin-9-one bearing an alkyl, a 1-alkenyl, a hydroxymethyl, a methoxymethyl, or a formyl group at the 7-position (3a-e) underwent rearrangement through fission and recyclization of the pyrimidine ring, attaining equilibrium with the corresponding positional isomer 4a-e in MeONa-MeOH at 25°C, whereas 7-methoxycarbonyl and 7-halogeno compounds 3f-i were irreversibly converted into the rearranged products 4f-i under identical conditions. The position of equilibrium appears to be affected by the electronic factor of the substitutent rather than the steric one. The pseudo-first-order rate constants measured for the reactions of 3a, b, d, f-i suggest that the reaction is accelerated by the electron-withdrawing substituent. However, the reactions of this series of compounds do not always obey the Hammett equation.On the other hand, a linear free energy relationship (ρ=+3.2) was observed for the rates of rearrangement of a 6-demethyl series of compounds 9a, b, d, f, g, when σ0P values were employed. The deviations from this relationship for the reactions with the 7-hydroxymethyl compound 9c and the 7-carbamoyl compound 9e are explicable in terms of the accelerative effect through intramolecular hydrogen bonding with the carbonyl oxygen at the 9-position.

  1-苄基-4, 6-二甲基-4, 9-脱氢-1H-咪唑[1, 2-α]嘌呤-9-酮在7位具有烷基、1-烯基、羟甲基、甲氧基甲基或甲酰基的化合物（3a-e）通过嘧啶环的裂解和重环化发生重排，在25°C下在MeONa-MeOH中达到与相应位置异构体4a-e的平衡，而7-甲氧基羧基和7-卤代化合物3f-i在相同条件下被不可逆地转化为重排产物4f-i。平衡位置似乎受到取代基电子因素的影响，而非空间因素。对化合物3a、b、d、f-i反应测得的伪一级速率常数表明，该反应因电子吸引取代基而加速。然而，这一系列化合物的反应并不总是遵循Hammett方程。另一方面，对于6-去甲基类化合物9a、b、d、f、g的重排速率，采用σ0P值时观察到线性自由能关系（ρ=+3.2）。对于与7-羟甲基化合物9c和7-氨基甲酰化合物9e的反应，这一关系的偏离可以通过与9位羰基氧的分子内氢键相互作用的加速效应来解释。
• Studies towards the Synthesis of the Hypermodified Nucleoside of Rat Liver Phenylalanine Transfer Ribonucleic Acid: Improved Synthesis of the Base .BETA.-Hydroxywybutine.
  作者：Taisuke ITAYA、Tae KANAI

  DOI：10.1248/cpb.46.1220

  日期：——

  An improved synthesis of the key intermediates (3 and 8) for the synthesis of beta-hydroxywybutines [[R-(R*,S*)]- and [S-(R*,R*)]-4], the most probable structures for the minor base from rat liver tRNA(Phe), has been achieved by the Wittig reaction between 1-benzyl-7-formylwye (1) and the phosphorane derived from (R)-2-[(methoxycarbonyl)amino]-3-(triphenylphosphonio)propanoate (10), followed by methylation

  改进的关键中间体（3和8）的合成方法，用于合成最大的β-羟基酪丁胺[[R-（R *，S *）]-和[S-（R *，R *）]-4]。 1-苄基-7-甲酰基wye（1）和衍生自（R）-2-[（（甲氧羰基）氨基]-的磷烷之间的Wittig反应已实现了大鼠肝脏tRNA（Phe）中次要碱基的可能结构3-（三苯基膦酰基）丙酸酯（10），然后进行甲基化，OsO4氧化，并在吡啶存在下用COCl2进行环缩合。确定[R-（R *，S *）]的光学纯度所需要的外消旋体形式的β-羟基丁酸[[R *，S *）-和（R *，R *）-4]。 -和[S-（R *，R *）]-4通过手性HPLC，通过环碳酸酯3的热解，然后NaBH4还原和催化氢解，方便地制备。[R-（R *，S *）]-和[S-（R *，
• ITAYA, TAISUKE;MIZUTANI, AKEMI;WATANABE, NOBUHIDE, CHEM. AND PHARM. BULL., 37,(1989) N, C. 1221-1225
  作者：ITAYA, TAISUKE、MIZUTANI, AKEMI、WATANABE, NOBUHIDE

  DOI：——

  日期：——
• Studies towards the synthesis of the fluorescent bases of phenylalanine transfer ribonucleic acids: Synthesis of 7-(2-Hydroxy-3-methylbutyl)wye, a model for the minor base isolated from rat liver.
  作者：Taisuke ITAYA、Akemi MIZUTANI、Nobuhide WATANABE

  DOI：10.1248/cpb.37.1221

  日期：——

  Treatment of 1-benzyl-7-(hydroxymethyl)wye (8) with PBr3 in the presence of Ph3P gave the phosphonium bromide 9 in good yield, Heating 9 and Me2 CHCHO (7) in MeOH in the presence of K2CO3 provided 1-benzyl-1, 4-dihydro-4, 7-dimethyl-6-(3-methyl-1-butenyl)-9H-imidazo[1, 2-a]purin-9-one (11), a positional isomer of the objective 1-benzyl-7-(3-methyl-1-butenyl)wye (5), as a major product. When the reaction was conducted in Me2NCHO at -65°C using n-BuLi as base, a 7 : 2 mixture of (E)-and (Z)-5 was obtained in good yield. Nevertheless, neither the protected amino aldehyde 18 nor 21 gave the desired olefin under similar conditions, implying poor applicability of this method to the synthesis of the fluorescent bases of phenylalanine transfer ribonucleic acids (tRNAsPhe).Compound 5 was alternatively synthesized by the Wittig reaction between 1-benzyl-7-formylwye (3) and Ph3P+CH2CHMe2 I- (4) in tetrahydrofuran as an equimolar mixture of the geometrical isomers in 50% yield. When the reaction was carried out in Me2SO at room temperature using two equivalents each of NaCH2SOMe and 4, the product, obtained in high yield, was (E)-11. The use of an equimolar amount of the base afforded (E)-5 in 26% yield. Oxidation of (E)-5 with OsO4 followed by hydrogenolysis over Pd-C gave 7-(2-hydroxy-3-methylbutyl)wye (2), a model for the minor base from rat liver tRNA.Phe.

  在 Ph3P 存在下，用 PBr3 处理 1-苄基-7-(羟甲基)碱 (8)，得到溴化鏻 9，收率很高；在 K2CO3 存在下，在 MeOH 中加热 9 和 Me2 CHCHO (7)，得到 1-苄基-1、4-二氢-4, 7-二甲基-6-(3-甲基-1-丁烯基)-9H-咪唑并[1, 2-a]嘌呤-9-酮 (11)的主要产物，它是客观存在的 1-苄基-7-(3-甲基-1-丁烯基)wye (5)的位置异构体。当以 n-BuLi 为碱在 Me2NCHO 中于 -65°C 进行反应时，可获得 7 : 2 的 (E)-5 和 (Z)-5 混合物，收率很高。在类似条件下，受保护的氨基醛 18 和 21 都没有得到所需的烯烃，这表明该方法在合成苯丙氨酸转移核糖核酸（tRNAsPhe）的荧光碱基方面的适用性较差。化合物 5 是通过 1-苄基-7-甲酰基黑麦草（3）和 Ph3P+CH2CHMe2 I- （4）在四氢呋喃中的 Wittig 反应合成的，为几何异构体的等摩尔混合物，收率为 50%。在室温下于 Me2SO 中使用 NaCH2SOMe 和 4 各两当量进行反应时，得到的高产率产物为 (E)-11。使用等摩尔量的碱得到(E)-5，收率为 26%。用 OsO4 氧化 (E)-5，然后在 Pd-C 上进行氢解，得到了 7-(2-羟基-3-甲基丁基)wye (2)，这是大鼠肝脏 tRNA.Phe 小碱基的模型。