N-(9H-9-fluoren-9-yl)methoxycarbonyl-O-tetrahydro-2H-pyran-2-yl-L-threonine | 918531-00-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: N-(9H-9-fluoren-9-yl)methoxycarbonyl-O-tetrahydro-2H-pyran-2-yl-L-threonine
• 英文别名: (2S,3R)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3-((tetrahydro-2H-pyran-2-yl)oxy)butanoic acid；Fmoc-Thr(Thp)；Fmoc-Thr(THP)-OH；(2S,3R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-(oxan-2-yloxy)butanoic acid
• CAS: 918531-00-7
• 化学式: C₂₄H₂₇NO₆
• 分子量: 425.481
• InChiKey: BSOWHWUPGMSWJV-XVWGVMGSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  94.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(9H-9-fluoren-9-yl)methoxycarbonyl-O-tetrahydro-2H-pyran-2-yl-L-threonine 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.25h， 生成 Fmoc-Thr-OH
  参考文献：
  名称：

  四氢吡喃基：一种非芳香族、温和酸不稳定基团，用于固相肽合成中的羟基保护。

  摘要：

  在固相肽合成中使用四氢吡喃基（Thp）基团保护丝氨酸和苏氨酸侧链羟基尚未得到广泛研究。本文介绍了用这种酸不稳定且非芳香族部分进行的丝/苏氨酸侧链羟基保护。虽然Thp与游离羧酸反应，但可以得出结论，在N保护的Ser和Thr的羟基上引入Thp醚，由于Thp酯的不稳定，不需要保护C端羧基。合成了受 Thp 保护的含 Ser/Thr 的三肽，并研究了在阳离子清除剂存在下在低浓度三氟乙酸中去除 Thp 的情况。鉴于其对大多数非酸性试剂的总体稳定性、其缀合物的溶解度提高以及易于去除，Thp 成为固相肽合成中 Ser 和 Thr 羟基的有效保护基团。

  DOI：

  10.1002/open.201600157
• 作为产物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-L-苏氨酸烯丙基酯 在 四(三苯基膦)钯 、 苯硅烷 、 4-甲基苯磺酸吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 12.75h， 生成 N-(9H-9-fluoren-9-yl)methoxycarbonyl-O-tetrahydro-2H-pyran-2-yl-L-threonine
  参考文献：
  名称：

  Callipeltin B的固相全合成及结构证明

  摘要：

  细胞毒性、环状七肽、天然产物 callipeltin B 在固相载体上合成，总产率为 15%。三种合成异构体的 1H NMR 谱与 callipeltin B 的 1H NMR 谱的比较证实其苏氨酸残基的构型重新分配为 d-别苏氨酸，并将其 β-甲氧基酪氨酸残基的构型分配为 (2R,3R)。

  DOI：

  10.1021/ja0666250

文献信息

• CYCLIC PEPTIDE COMPOUND HAVING HIGH MEMBRANE PERMEABILITY, AND LIBRARY CONTAINING SAME
  申请人：Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha

  公开号：EP3636807A1

  公开（公告）日：2020-04-15

  The present inventors have found that when screening for cyclic peptide compounds that can specifically bind to a target molecule, the use of a library including cyclic peptide compounds having a long side chain in the cyclic portion can improve the hit rate for cyclic peptide compounds that can specifically bind to the target molecule. Meanwhile, the present inventors have found that tryptophan and tyrosine residues, which have conventionally been used in oral low molecular-weight pharmaceuticals and are amino acid residues having an indole skeleton or a hydroxyphenyl group, are not suitable for peptides intended to attain high membrane permeability.

  本发明人发现，在筛选能与目标分子特异性结合的环肽化合物时，使用包括环状部分具有长侧链的环肽化合物库，可以提高能与目标分子特异性结合的环肽化合物的命中率。同时，本发明者发现色氨酸和酪氨酸残基不适合用于旨在获得高膜渗透性的肽，这两种残基通常用于口服低分子量药物，是具有吲哚骨架或羟基苯基的氨基酸残基。
• METHOD FOR SYNTHESIZING PEPTIDE CONTAINING N-SUBSTITUTED AMINO ACID
  申请人：Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha

  公开号：EP3636656A1

  公开（公告）日：2020-04-15

  Methods of producing a peptide containing an N-substituted amino acid or N-substituted amino acid analog of the present invention include the steps of: preparing an Fmoc-protected amino acid, an Fmoc-protected amino acid analog, or an Fmoc-protected peptide; deprotecting a protecting group which have an Fmoc skeleton of the Fmoc-protected amino acid and such by using a base; and forming an amide bond by adding a new Fmoc-protected amino acid and such; and when the peptide is produced by a solid-phase method, the obtained peptide is cleaved off from the solid phase under conditions of weaker acidity than TFA. Furthermore, at least one side chain of the obtained peptide has a protecting group that is not deprotected under basic conditions and is deprotected under conditions of weaker acidity than TFA.

  生产含有本发明的N-取代氨基酸或N-取代氨基酸类似物的多肽的方法包括以下步骤： 制备 Fmoc 保护的氨基酸、Fmoc 保护的氨基酸类似物或 Fmoc 保护的肽； 使用碱对具有 Fmoc 骨架的 Fmoc 保护氨基酸的保护基进行脱保护；以及 通过添加新的 Fmoc 保护氨基酸形成酰胺键； 当采用固相法生产多肽时，在酸性比反式脂肪酸弱的条件下从固相中裂解得到多肽。此外，所得多肽的至少一个侧链具有保护基团，该保护基团在碱性条件下未被脱保护，而在酸性弱于 TFA 的条件下被脱保护。
• METHOD FOR TREATING AND/OR PREVENTING REGNASE-1-RELATED DISEASE
  申请人：Osaka University

  公开号：EP3804759A1

  公开（公告）日：2021-04-14

  The present invention found that, for example, inhibiting phosphorylation of a Ser residue in Regnase-1 is effective in treating and/or preventing diseases. The invention also found that, for example, inhibiting the binding of Regnase-1 with at least one factor selected from the group consisting of TBK1, IKKi, Act-1, IKK, and IRAK is effective in treating and/or preventing diseases.

  本发明发现，例如，抑制 Regnase-1 中 Ser 残基的磷酸化可有效治疗和/或预防疾病。本发明还发现，例如，抑制 Regnase-1 与至少一种选自 TBK1、IKKi、Act-1、IKK 和 IRAK 所组成的组的因子的结合可有效治疗和/或预防疾病。
• AMINO ACID HAVING FUNCTIONAL GROUP CAPABLE OF INTERMOLECULAR HYDROGEN BONDING, PEPTIDE COMPOUND CONTAINING SAME AND METHOD FOR PRODUCTION THEREOF
  申请人：CHUGAI SEIYAKU KABUSHIKI KAISHA

  公开号：EP3896056A1

  公开（公告）日：2021-10-20

  It has been found that the membrane permeability of peptide compounds can be improved by making at least one of amino acids constituting the peptide compound be an amino acid having a side chain capable of forming an intramolecular hydrogen bond.

  研究发现，通过使构成多肽化合物的氨基酸中至少有一个氨基酸具有能够形成分子内氢键的侧链，可以改善多肽化合物的膜渗透性。
• MUTATED TRNA FOR CODON EXPANSION
  申请人：CHUGAI SEIYAKU KABUSHIKI KAISHA

  公开号：EP3904568A1

  公开（公告）日：2021-11-03

  In some embodiments, the present disclosure relates to mutated tRNAs in which the first letter of the anticodon has been substituted to lysidine or agmatidine, and translation systems containing the mutated tRNAs. In a specific embodiment, the present disclosure provides mutated tRNAs capable of selectively translating codon NNA. In another embodiment, the present disclosure provides translation systems capable of translating two or three types of amino acids from a single codon box. In still another embodiment, the present disclosure provides novel methods for synthesizing lysidine diphosphate, agmatidine diphosphate, and derivatives thereof.

  在某些实施方案中，本公开涉及反密码子的第一个字母被替换为赖氨酸或琼脂苷的突变 tRNA，以及含有该突变 tRNA 的翻译系统。在一个具体的实施方案中，本公开提供了能够选择性翻译密码子 NNA 的突变 tRNA。在另一个实施方案中，本公开提供了能够从单个密码子盒翻译两种或三种氨基酸的翻译系统。在另一个实施方案中，本公开提供了合成二磷酸赖氨酸、二磷酸阿加匹定及其衍生物的新方法。