6-azidohexyl 2-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)(2,4-dimethoxyphenyl)methyl)phenoxy)acetate | 1246625-65-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: 6-azidohexyl 2-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)(2,4-dimethoxyphenyl)methyl)phenoxy)acetate
• CAS: 1246625-65-9
• 化学式: C₃₈H₄₀N₄O₇
• 分子量: 664.758
• InChiKey: TVMUAOSDPZVVEI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.12
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  141.08
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-azidohexyl 2-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)(2,4-dimethoxyphenyl)methyl)phenoxy)acetate 在 哌啶 、 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 6-azidohexyl 2-(4-((2,4-dimethoxyphenyl)(oct-7-ynamido)methyl)phenoxy)acetate
  参考文献：
  名称：

  使用化学连接和质谱法选择性富集和鉴定叠氮化物标记的交联肽

  摘要：

  蛋白质-蛋白质相互作用是控制各种细胞过程中蛋白质功能的关键调节机制之一。化学交联与质谱联用已被证明是一种强大的方法，不仅用于绘制所有性质的蛋白质 - 蛋白质相互作用，包括弱和瞬态相互作用，而且还用于确定它们的相互作用界面。这种方法剩下的一个关键挑战是如何有效地从复杂的肽混合物中分离和鉴定交联产物。在这项工作中，我们开发了一种使用共轭化学选择性富集交联产物的新策略。设计并合成了叠氮化物标记的交联剂和两种生物素化偶联试剂。模型肽和细胞色素c 的交联以及对所得交联肽的富集进行了评估。已经使用两种策略证明了叠氮化物标记的交联肽的选择性缀合：铜催化环加成和施陶丁格连接。虽然这两种方法都有效，但 Staudinger 连接更适合富集交联肽，因为样品处理问题较少。LC MS n分析结合使用 Protein Prospector 软件包进行数据库搜索，可识别 58 种细胞色素c富集和亲和纯化后的交联肽。这项工作中开发的新富集策略为促进通过

  DOI：

  10.1016/j.jasms.2010.04.004
• 作为产物：
  描述：

  4-[(2,4-甲氧基苯基)(Fmoc-氨基)甲基]苯氧基乙酸 、 6-叠氮基-1-己醇 在 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以39%的产率得到6-azidohexyl 2-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)(2,4-dimethoxyphenyl)methyl)phenoxy)acetate
  参考文献：
  名称：

  使用化学连接和质谱法选择性富集和鉴定叠氮化物标记的交联肽

  摘要：

  蛋白质-蛋白质相互作用是控制各种细胞过程中蛋白质功能的关键调节机制之一。化学交联与质谱联用已被证明是一种强大的方法，不仅用于绘制所有性质的蛋白质 - 蛋白质相互作用，包括弱和瞬态相互作用，而且还用于确定它们的相互作用界面。这种方法剩下的一个关键挑战是如何有效地从复杂的肽混合物中分离和鉴定交联产物。在这项工作中，我们开发了一种使用共轭化学选择性富集交联产物的新策略。设计并合成了叠氮化物标记的交联剂和两种生物素化偶联试剂。模型肽和细胞色素c 的交联以及对所得交联肽的富集进行了评估。已经使用两种策略证明了叠氮化物标记的交联肽的选择性缀合：铜催化环加成和施陶丁格连接。虽然这两种方法都有效，但 Staudinger 连接更适合富集交联肽，因为样品处理问题较少。LC MS n分析结合使用 Protein Prospector 软件包进行数据库搜索，可识别 58 种细胞色素c富集和亲和纯化后的交联肽。这项工作中开发的新富集策略为促进通过

  DOI：

  10.1016/j.jasms.2010.04.004