N⁴-(3,5,5-trimethyl-1-hexanoyl)-2'-deoxycytidine | 1451048-43-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N⁴-(3,5,5-trimethyl-1-hexanoyl)-2'-deoxycytidine
• 英文别名: N4-(3,5,5-trimethyl-1-hexanoyl)-2'-deoxycytidine；N-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]-3,5,5-trimethylhexanamide
• CAS: 1451048-43-3
• 化学式: C₁₈H₂₉N₃O₅
• 分子量: 367.445
• InChiKey: DMBKAVHMWIOUBI-YVAZLZIHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  112
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-(3,5,5-trimethyl-1-hexanoyl)-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.33h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N⁴-(3,5,5-trimethyl-1-hexanoyl)-2'-deoxycytidine-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropylphosphoramidite]
  参考文献：
  名称：

  Oligonucleotide with protected base

  摘要：

  本发明提供了一种用于延伸的受保护核苷酸，可以通过液液萃取操作高效地和高产率地纯化，并且可以通过磷酰胺酯法实现寡核苷酸的生产方法。已经发现，上述问题可以通过包含受保护碱基和/或在3'-位置含有支链含芳基团的特定寡核苷酸来解决。

  公开号：

  US09371353B2
• 作为产物：
  描述：

  3,5,5-三甲基己酰氯 、 2'-脱氧胞嘧啶核苷 在 三甲基氯硅烷 作用下， 以 吡啶 、 水 为溶剂， 生成 N⁴-(3,5,5-trimethyl-1-hexanoyl)-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  OLIGONUCLEOTIDE WITH PROTECTED BASE

  摘要：

  本发明提供了一种用于延长的受保护核苷酸，可以通过液-液萃取操作高效且高产地纯化，并且可以通过磷酰胺酯法实现寡核苷酸的生产方法。已发现上述问题可以通过包含受保护碱基和/或在3'-位置带有分支链含芳基的特定寡核苷酸来解决。

  公开号：

  US20130267697A1

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE WITH PROTECTED BASE
  申请人：Ajinomoto Co., Inc.

  公开号：US20130267697A1

  公开（公告）日：2013-10-10

  The present invention provides a protected nucleotide for elongation, which can be purified efficiently and in a high yield by a liquid-liquid extraction operation, and can achieve an oligonucleotide production method by a phosphoramidite method. It has been found that the above-mentioned problem can be solved by a particular oligonucleotide comprising a protected base and/or particular oligonucleotide protected by a branched chain-containing aromatic group at 3′-position.

  本发明提供了一种用于延长的受保护核苷酸，可以通过液-液萃取操作高效且高产地纯化，并且可以通过磷酰胺酯法实现寡核苷酸的生产方法。已发现上述问题可以通过包含受保护碱基和/或在3'-位置带有分支链含芳基的特定寡核苷酸来解决。
• BASE-PROTECTED OLIGONUCLEOTIDE
  申请人：AJINOMOTO CO., INC.

  公开号：EP2816053B1

  公开（公告）日：2021-03-24
• Oligonucleotide with protected base
  申请人：Ajinomoto Co., Inc.

  公开号：US09371353B2

  公开（公告）日：2016-06-21

  The present invention provides a protected nucleotide for elongation, which can be purified efficiently and in a high yield by a liquid-liquid extraction operation, and can achieve an oligonucleotide production method by a phosphoramidite method. It has been found that the above-mentioned problem can be solved by a particular oligonucleotide comprising a protected base and/or particular oligonucleotide protected by a branched chain-containing aromatic group at 3′-position.

  本发明提供了一种用于延伸的受保护核苷酸，可以通过液液萃取操作高效地和高产率地纯化，并且可以通过磷酰胺酯法实现寡核苷酸的生产方法。已经发现，上述问题可以通过包含受保护碱基和/或在3'-位置含有支链含芳基团的特定寡核苷酸来解决。