1-(3-azido-2,3-dideoxy-2-fluoro-β-D-ribofuranosyl)thymine | 127840-94-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(3-azido-2,3-dideoxy-2-fluoro-β-D-ribofuranosyl)thymine
• 英文别名: 1-(3-azido-2-fluoro-2,3-dideoxy-β-D-ribofuranosyl)thymine；3'-azido-2',3'-dideoxy-2'-fluoro-5-methyluridine；1-[(2R,3R,4R,5S)-4-azido-3-fluoro-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 127840-94-2
• 化学式: C₁₀H₁₂FN₅O₄
• 分子量: 285.235
• InChiKey: AVYGFRQPURLSLQ-JXOAFFINSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  93.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-azido-2,3-dideoxy-2-fluoro-β-D-ribofuranosyl)thymine 在 三苯基膦 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 1.5h， 以55%的产率得到1-(3-amino-2,3-dideoxy-2-fluoro-β-D-ribofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶抑制剂：2'-和3'-修饰胸苷类似物的生物学评价和构象分析

  摘要：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 最近被引入作为抗结核药物基于结构设计的潜在目标。基于 TMPKmt X 射线结构和先前的 SAR 研究，我们合成了核苷类似物 3a-b、6a-b、7a-b 和 8a-b，在呋喃核糖环部分的 2'-和 3'-位置进行了修饰. 令我们惊讶的是，这些类似物仅表现出中等的结合亲和力（即 Ki 介于 118 和 1260 μM 之间）。这促使我们研究这些核苷的构象特征。我们得出结论，该系列的化合物，尤其是 8a-b，强烈偏向于“北方”呋喃糖环构象，而 X 射线晶体学显示 TMPKmt 偏爱相反的“南方”构象异构体。本文涵盖了合成，2'-和3'-修饰的dT类似物的生物学评价和构象特征（即优选的环褶皱）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200300177
• 作为产物：
  描述：

  2,2'-O-脱水-5-甲基尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 trifluoromethanesulfonic acid anhydride 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 22.5h， 生成 1-(3-azido-2,3-dideoxy-2-fluoro-β-D-ribofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  Herdewijn, P.; Aerschot, A. Van, Bulletin des Societes Chimiques Belges, 1989, vol. 98, # 12, p. 943 - 948

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Fluorinated sugar analogs of potential anti-HIV-1 nucleosides
  作者：Jai Tung Huang、Ling Ching Chen、Liben Wang、Moon Hwan Kim、James A. Warshaw、Donald Armstrong、Qing Yu Zhu、Ting Chao Chou、Kyoichi A. Watanabe

  DOI：10.1021/jm00109a017

  日期：1991.5

  3'-dideoxy-5-methyluridine (31), and 2'3'-dideoxy-2' -fluoro-5-methyluridine (37). These new nucleosides were screened for their activity against HIV and feline TLV in vitro. None of the compounds showed significant activity. It is interesting to note that such a small modification in the sugar moiety of active anti-HIV nucleosides (i.e., displacement of hydrogen by fluorine) almost completely inactivate the agents

  为了获得具有优于AZT，FLT或D4T的治疗指数的药物，合成了抗HIV-1核苷的几种类似物。这些包括2'，3'-dideoxy-2'，3'-difluoro-5-methyluridine（13），其阿拉伯糖类似物19，arab-5--5-甲基胞嘧啶类似物21、3'-脱氧2'，3'-二氢-2'-氟胸苷（25），3'-叠氮基2'，3'-二脱氧基2'-氟-5-甲基尿苷（29），2'-叠氮基3'-氟-2'，3'-双脱氧-5-甲基尿苷（31）和2'3'-二脱氧-2'-氟-5-甲基尿苷（37）。对这些新核苷在体外针对HIV和猫TLV的活性进行了筛选。没有一种化合物显示出明显的活性。有趣的是，活性抗HIV核苷的糖部分有这么小的修饰（即
• HERDEWIJN, P.;VAN, AERSCHOT A., BULL. SOC. CHIM. BELG., 98,(1989) N2, C. 943-947
  作者：HERDEWIJN, P.、VAN, AERSCHOT A.

  DOI：——

  日期：——
• Herdewijn, P.; Aerschot, A. Van, Bulletin des Societes Chimiques Belges, 1989, vol. 98, # 12, p. 943 - 948
  作者：Herdewijn, P.、Aerschot, A. Van

  DOI：——

  日期：——
• Mycobacterium tuberculosis Thymidine Monophosphate Kinase Inhibitors: Biological Evaluation and Conformational Analysis of 2′- and 3′-Modified Thymidine Analogues
  作者：Philippe Van Rompaey、Koen Nauwelaerts、Veerle Vanheusden、Jef Rozenski、Hélène Munier-Lehmann、Piet Herdewijn、Serge Van Calenbergh

  DOI：10.1002/ejoc.200300177

  日期：2003.8

  Mycobacterium tuberculosis thymidine monophosphate kinase (TMPKmt) has recently been introduced as a potential target for the structure-based design of anti-tuberculosis drugs. Based on the TMPKmt X-ray structure and previous S.A.R. studies, we synthesised the nucleoside analogues 3a−b, 6a−b, 7a−b, and 8a−b, modified in 2′- and 3′-position of the ribofuranose ring moiety. To our surprise, these analogues

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 最近被引入作为抗结核药物基于结构设计的潜在目标。基于 TMPKmt X 射线结构和先前的 SAR 研究，我们合成了核苷类似物 3a-b、6a-b、7a-b 和 8a-b，在呋喃核糖环部分的 2'-和 3'-位置进行了修饰. 令我们惊讶的是，这些类似物仅表现出中等的结合亲和力（即 Ki 介于 118 和 1260 μM 之间）。这促使我们研究这些核苷的构象特征。我们得出结论，该系列的化合物，尤其是 8a-b，强烈偏向于“北方”呋喃糖环构象，而 X 射线晶体学显示 TMPKmt 偏爱相反的“南方”构象异构体。本文涵盖了合成，2'-和3'-修饰的dT类似物的生物学评价和构象特征（即优选的环褶皱）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)