GDP-6-amino-β-L-fucose | 1381944-92-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: GDP-6-amino-β-L-fucose
• 英文别名: GDP-FAm；guanosine 5'-diphospho-6-amino-β-L-fucopyranoside；[(2R,3S,4R,5S,6S)-6-(aminomethyl)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl] [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] hydrogen phosphate
• CAS: 1381944-92-8
• 化学式: C₁₆H₂₆N₆O₁₅P₂
• 分子量: 604.361
• InChiKey: JALIVUIIJSSMML-JGQUBWHWSA-N

物化性质

• 沸点：
  1042.9±75.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.51±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -8.8
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  333
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  GDP-6-amino-β-L-fucose 在 ammonium hydroxide 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 碳酸氢钠 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  唾液酸和岩藻糖基转移酶抑制剂的高通量筛选

  摘要：

  Sweet Screens：开发了一种基于荧光偏振 (FP) 鉴定唾液酸和岩藻糖基转移酶抑制剂的高通量筛选平台。带有荧光标记（绿星）的天然供体底物的类似物被转移到糖蛋白受体上，从而产生强大的 FP（见图）。针对不同糖基转移酶筛选 16 000 种化合物已确定了各种有趣的抑制剂。

  DOI：

  10.1002/anie.201105065
• 作为产物：
  描述：

  6-azido-L-fucose 在 ammonium hydroxide 、 pyrophosphatase 、 palladium on activated charcoal 、 B_. Fragilis FKP enzyme 、 氢气 、 5’-三磷酸腺苷 作用下， 反应 4.0h， 生成 GDP-6-amino-β-L-fucose
  参考文献：
  名称：

  唾液酸和岩藻糖基转移酶抑制剂的高通量筛选

  摘要：

  Sweet Screens：开发了一种基于荧光偏振 (FP) 鉴定唾液酸和岩藻糖基转移酶抑制剂的高通量筛选平台。带有荧光标记（绿星）的天然供体底物的类似物被转移到糖蛋白受体上，从而产生强大的 FP（见图）。针对不同糖基转移酶筛选 16 000 种化合物已确定了各种有趣的抑制剂。

  DOI：

  10.1002/anie.201105065

文献信息

• Chemoenzymatic Synthesis of GDP-L-Fucose Derivatives as Potent and Selective α-1,3-Fucosyltransferase Inhibitors
  作者：Yu-Nong Lin、Daniel Stein、Sheng-Wei Lin、Sue-Ming Chang、Ting-Chien Lin、Yu-Ruei Chuang、Jacquelyn Gervay-Hague、Hisashi Narimatsu、Chun-Hung Lin

  DOI：10.1002/adsc.201100940

  日期：2012.6.18

  we report the development of a chemoenzymatic method for synthesizing a library of guanosine diphosphate β‐L‐fucose (GDP‐Fuc) derivatives, followed by in situ screening for inhibitory activity against bacterial and human α‐1,3‐FucTs. Several compounds incorporating appropriate hydrophobic moieties were identified from the initial screening. These were individually synthesized, purified and characterized

  岩藻糖基转移酶（FucTs）通常催化糖基化的最终步骤，对许多生物过程至关重要。高水平的特定FucT活性通常与各种癌症有关。在这里，我们报告了一种化学合成方法的发展，该方法用于合成鸟苷二磷酸β- L-岩藻糖（GDP-Fuc）衍生物的文库，然后原位筛选对细菌和人α-1,3-FucTs的抑制活性。从最初的筛选中鉴定出掺入了适当的疏水部分的几种化合物。将它们分别合成，纯化并详细表征其抑制动力学。化合物5的K i对人类FucT-VI具有29 nM的选择性，比幽门螺杆菌FucT（K i = 7.8μM）和人类FucT-V（K i = 0.31μM）分别高269和11倍。
• [EN] SITE-SPECIFIC ANTIBODY CONJUGATES AND THE METHODS FOR PREPARATION OF THE SAME<br/>[FR] CONJUGUÉS D'ANTICORPS SPÉCIFIQUES À UN SITE ET LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION
  申请人：GLYCO THERAPY BIOTECHNOLOGY CO LTD

  公开号：WO2022037665A1

  公开（公告）日：2022-02-24

  The present disclosure provides a site-specific protein conjugate and the method for preparation of the same. The protein conjugate comprising a protein and an oligosaccharide, wherein said oligosaccharide comprises (I) wherein: said GlcNAc is directly or indirectly linked to an amino acid of said protein; said Gal is a galactose; said (Fuc) is a fucose, b is 0 or 1; said Fuc* comprises a fucose or a fucose derivative linked to a molecule of interest (MOI), said protein comprises an antigen binding fragment and/or a Fc fragment.

  本公开提供了一种特定于位点的蛋白质共轭物及其制备方法。所述蛋白质共轭物包括蛋白质和寡糖，其中所述寡糖包括（I），其中：所述GlcNAc直接或间接连接到所述蛋白质的氨基酸上；所述Gal是半乳糖；所述（Fuc）是岩藻糖，b为0或1；所述Fuc*包括与感兴趣分子（MOI）连接的岩藻糖或岩藻糖衍生物，所述蛋白质包括抗原结合片段和/或Fc片段。
• Trimming Crystallizable Fragment (Fc) Glycans Enables the Direct Enzymatic Transfer of Biomacromolecules to Antibodies as Therapeutics**
  作者：Yang Yang、Zhentao Song、Tian Tian、Zihan Zhao、Ji Chen、Jiangping Hu、Xin Jiang、Guoli Yang、Qi Xue、Xinlu Zhao、Wanxing Sha、Yi Yang、Jie P. Li

  DOI：10.1002/anie.202308174

  日期：2023.9.4

  Glycoengineering has provided powerful tools to construct site‐specific antibody conjugates. However, only small‐molecule payloads can be directly transferred to native or engineered antibodies using existing glycoengineering strategies. Herein, we demonstrate that reducing the complexity of crystallizable fragment (Fc) glycans could dramatically boost the chemoenzymatic modification of immunoglobulin G (IgG) via an engineered fucosyltransferase. In this platform, antibodies with Fc glycans engineered to a simple N‐acetyllactosamine (LacNAc) disaccharide are successfully conjugated to biomacromolecules, such as oligonucleotides and nanobodies, in a single step within hours. Accordingly, we synthesized an antibody‐conjugate‐based anti‐human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)/ cluster of differentiation 3 (CD3) bispecific antibody and used it to selectively destroy patient‐derived cancer organoids by reactivating endogenous T lymphocyte cells (T cells) inside the organoid. Our results highlight that this platform is a general approach to construct antibody‐biomacromolecule conjugates with translational values.

  摘要糖工程为构建位点特异性抗体共轭物提供了强大的工具。然而，现有的糖工程策略只能将小分子有效载荷直接转移到原生抗体或工程抗体上。在这里，我们证明了降低可结晶片段（Fc）聚糖的复杂性可以通过一种工程化的岩藻糖基转移酶极大地促进免疫球蛋白 G（IgG）的化学修饰。在这一平台中，Fc聚糖被工程化为简单的N-乙酰半乳糖胺（LacNAc）二糖的抗体可在数小时内通过单一步骤成功地与寡核苷酸和纳米抗体等生物大分子连接。因此，我们合成了一种基于抗体共轭物的抗人表皮生长因子受体2（HER2）/分化簇3（CD3）双特异性抗体，并用它通过重新激活器官组织内的内源性T淋巴细胞（T细胞）来选择性地破坏患者衍生的癌症器官组织。我们的研究结果表明，该平台是构建具有转化价值的抗体-生物大分子共轭物的通用方法。
• WO2023/65137
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——