1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyamino-5-hydroxymethylpyrimidin-2(1H)-one | 316808-54-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyamino-5-hydroxymethylpyrimidin-2(1H)-one
• 英文别名: N⁴-hydroxy-5-hydroxymethyl-2'-deoxycytidine；4-(hydroxyamino)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2-one
• CAS: 316808-54-5
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₆
• 分子量: 273.246
• InChiKey: WYZXKDZCZDBBDK-XLPZGREQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.2
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  135
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyamino-5-hydroxymethylpyrimidin-2(1H)-one 在 三(4-硝基苯基)磷酸酯 、 wheat shoot nucleoside phosphotransferase 作用下， 以 acetate buffer 为溶剂， 反应 40.0h， 以57%的产率得到1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyamino-5-hydroxymethylpyrimidin-2(1H)-one 5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  5位取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷及其5'-单磷酸酯：合成，构象，与肿瘤胸苷酸合酶的相互作用以及体外抗肿瘤活性。

  摘要：

  描述了通过转化各自的5-取代的3'，5'-二-O-乙酰基-2'-来合成5-取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷5a，b，dh的简便方法。脱氧尿苷1a-c，eh。这些程序包括在位置C（4）上进行位点特异性三唑基化或N-甲基咪唑基化，然后进行羟胺化并用MeOH-NH（3）进行解封。借助于麦芽磷酸转移酶系统，将核苷5a，b，dh选择性地转化为相应的5′-单磷酸酯6a，b，dh。由（1）H NMR光谱推导并通过分子力学计算证实的D（2）O溶液中每个核苷的构象表明，戊糖环主要存在于构象S（C-2'-endo）和N（ 4）-OH基为顺式旋转异构体。研究了两种L5178Y鼠白血病细胞系对亲本和5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUrd）的耐药性对细胞生长的抑制作用，后者对FdUrd的敏感性比前者低70倍。对于耐FdUrd的L5178Y细胞，5-氟-N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷（5e）引起的生长抑制作用几乎是F

  DOI：

  10.1021/jm000975u
• 作为产物：
  描述：

  5-羟甲基脱氧尿苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸羟胺 、 氨 、 三氯氧磷 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 48.5h， 生成 1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyamino-5-hydroxymethylpyrimidin-2(1H)-one
  参考文献：
  名称：

  5位取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷及其5'-单磷酸酯：合成，构象，与肿瘤胸苷酸合酶的相互作用以及体外抗肿瘤活性。

  摘要：

  描述了通过转化各自的5-取代的3'，5'-二-O-乙酰基-2'-来合成5-取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷5a，b，dh的简便方法。脱氧尿苷1a-c，eh。这些程序包括在位置C（4）上进行位点特异性三唑基化或N-甲基咪唑基化，然后进行羟胺化并用MeOH-NH（3）进行解封。借助于麦芽磷酸转移酶系统，将核苷5a，b，dh选择性地转化为相应的5′-单磷酸酯6a，b，dh。由（1）H NMR光谱推导并通过分子力学计算证实的D（2）O溶液中每个核苷的构象表明，戊糖环主要存在于构象S（C-2'-endo）和N（ 4）-OH基为顺式旋转异构体。研究了两种L5178Y鼠白血病细胞系对亲本和5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUrd）的耐药性对细胞生长的抑制作用，后者对FdUrd的敏感性比前者低70倍。对于耐FdUrd的L5178Y细胞，5-氟-N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷（5e）引起的生长抑制作用几乎是F

  DOI：

  10.1021/jm000975u

文献信息

• 5-Substituted <i>N</i>⁴-Hydroxy-2‘-deoxycytidines and Their 5‘-Monophosphates:  Synthesis, Conformation, Interaction with Tumor Thymidylate Synthase, and in Vitro Antitumor Activity
  作者：Krzysztof Felczak、Agnieszka Miazga、Jarosław Poznański、Maria Bretner、Tadeusz Kulikowski、Jolanta M. Dzik、Barbara Gołos、Zbigniew Zieliński、Joanna Cieśla、Wojciech Rode

  DOI：10.1021/jm000975u

  日期：2000.11.1

  procedures are described for the synthesis of 5-substituted N(4)-hydroxy-2'-deoxycytidines 5a,b,d-h via transformation of the respective 5-substituted 3', 5'-di-O-acetyl-2'-deoxyuridines 1a-c,e-h. These procedures involved site-specific triazolation or N-methylimidazolation at position C(4), followed by hydroxylamination and deblocking with MeOH-NH(3). Nucleosides 5a,b,d-h were selectively converted

  描述了通过转化各自的5-取代的3'，5'-二-O-乙酰基-2'-来合成5-取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷5a，b，dh的简便方法。脱氧尿苷1a-c，eh。这些程序包括在位置C（4）上进行位点特异性三唑基化或N-甲基咪唑基化，然后进行羟胺化并用MeOH-NH（3）进行解封。借助于麦芽磷酸转移酶系统，将核苷5a，b，dh选择性地转化为相应的5′-单磷酸酯6a，b，dh。由（1）H NMR光谱推导并通过分子力学计算证实的D（2）O溶液中每个核苷的构象表明，戊糖环主要存在于构象S（C-2'-endo）和N（ 4）-OH基为顺式旋转异构体。研究了两种L5178Y鼠白血病细胞系对亲本和5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUrd）的耐药性对细胞生长的抑制作用，后者对FdUrd的敏感性比前者低70倍。对于耐FdUrd的L5178Y细胞，5-氟-N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷（5e）引起的生长抑制作用几乎是F