由于
ATP 结合位点的高度保守性,对单一激酶亚型的特异性抑制是一项具有挑战性的任务。
酪蛋白激酶 1 (CK1) δ 和 ε 在其催化结构域中具有 97% 的序列同一性。通过比较 CK1δ 和 CK1ε 的 X 射线晶体结构,我们开发了一种有效且高度 CK1ε 亚型选择性
抑制剂 (SR-4133)。CK1δ−SR-4133 复合物的 X 射线共晶结构表明 SR-4133 的
萘基单元和 CK1δ 之间的静电表面不匹配,从而破坏了 SR-4133 与 CK1δ 的相互作用。相反,CK1ε 的 Asp−Phe−Gly 基序 (DFG)-out 构象产生的疏
水表面积稳定了 SR-4133 在 CK1ε
ATP 结合袋中的结合,从而导致 CK1ε 的选择性抑制。