α-2'-deoxycytidine | 4449-40-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: α-2'-deoxycytidine
• 英文别名: α-deoxycytidine；2'-deoxycytidine；2-deoxycytidine；4-amino-1-(α-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl)-1H-pyrimidin-2-one；4-Amino-1-(α-D-erythro-2-desoxy-pentofuranosyl)-1H-pyrimidin-2-on；2'-deoxy-α-cytidine；2'-Deoxy-alpha-cytidine；4-amino-1-[(2S,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 4449-40-5
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₄
• 分子量: 227.22
• InChiKey: CKTSBUTUHBMZGZ-BBVRLYRLSA-N

物化性质

• 熔点：
  197-198.5 °C(Solv: ethanol (64-17-5))
• 沸点：
  497.6±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.73±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  α-2'-deoxycytidine 生成
  参考文献：
  名称：

  合成核苷和核苷酸。二十一 关于2'-脱氧-α-D-核呋喃核糖基核苷和核苷酸的合成和生物学评价。

  摘要：

  将 N4-苯甲酰基-2'-脱氧胞苷（1）转化为其 3'，5'-二-O-乙酸酯（2）。通过与三氟甲磺酸三甲基硅酯（TMS-triflate）反应，化合物 2 顺利异构化成其 α-对应物（3）。3 的皂化反应得到了结晶α-2'-脱氧胞苷（4）。同样，3', 5'-di-O-p-toluoyl-2'-deoxythymidine (5) 被异构化为 α-异构体 (6)，然后脱锁得到 α-2'-deoxythymidine (7)。α-2'-脱氧腺苷（8）和 9-(2-脱氧-α-D-呋喃核糖基)-6-甲基硫嘌呤（9a）是通过 TMS-三late催化反式-2-脱氧核糖基化从化合物 2 分别制备成 N6-苯甲酰基腺嘌呤和 6-甲基硫嘌呤。α-5-氟-2'-脱氧胞苷（11a）及其 β-异构体（11b）是通过 N4-对甲苯甲酰基-5-氟胞嘧啶的三甲基硅烷衍生物与 1-O-乙酰基-3，5-二-O-苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖反应，然后脱锁合成的。在与α-2'-脱氧核苷有关的化合物中，化合物 4 和 11a 对培养中的小鼠白血病 L5178Y 细胞表现出微弱的生长抑制活性。在核苷 5'-三磷酸酯中，α-脱氧 ATP 在以活化 DNA 为模板引物时与 DNA 聚合酶 α 有一定的亲和力；α-脱氧胸苷 5'- 三磷酸酯（TTP）在以聚[rA]-醇溶 dT 为模板引物时对 DNA 聚合酶 β 有显著的抑制作用。

  DOI：

  10.1248/cpb.32.1441
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧-1-乙酸-3,5-二苯甲酸-D-赤式-五呋喃糖 在 二苯并-18-冠醚-6 、 氨 、 potassium iodide 作用下， 以 甲醇 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 生成 α-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  2'-脱氧核糖核苷的区域特异性合成的改进程序

  摘要：

  通过用KI-二苯并-18-冠-6 PTC催化未保护的甲硅烷基化的嘌呤和嘧啶与适当的易得的2-脱氧核糖呋喃糖基或吡喃糖基糖衍生物之间的缩合，可以高特异性合成2'-脱氧核糖核苷。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)97641-x

文献信息

• 2'-deoxy-L-nucleosides
  申请人：Watanabe Kyoichi

  公开号：US20050090660A1

  公开（公告）日：2005-04-28

  This invention provides processes for the preparation of compounds having the structure: wherein X and Y are same or different, and H, OH, OR, SH, SR, NH 2 , NHR′, or NR′R″ Z is H, F, Cl, Br, I, CN, or NH 2 . R is hydrogen, halogen, lower alkyl of C 1 -C 6 or aralkyl, NO 2 , NH 2 , NHR′, NR′R″, OH, OR, SH, SR, CN, CONH 2 , CSNH 2 , CO 2 H, CO 2 R′, CH 2 CO 2 H, CH 2 CO 2 R′, CH═CHR, CH 2 CH═CHR, or C═CR. R′ and R″ are same or different, and lower alkyl of C 1 -C 6 . R 13 is hydrogen, alkyl, acyl, phosphate (monophosphate, diphosphate, triphosphate, or stabilized phosphate) or silyl; and

  这项发明提供了制备具有以下结构的化合物的方法： 其中 X和Y相同或不同，且H、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR′或NR′R″ Z为H、F、Cl、Br、I、CN或NH2 R为氢、卤素、C1-C6的低碳烷基或芳基烷基、NO2、NH2、NHR′、NR′R″、OH、OR、SH、SR、CN、CONH2、CSNH2、CO2H、CO2R′、CH2CO2H、CH2CO2R′、CH═CHR、CH2CH═CHR或C═CR。 R′和R″相同或不同，且为C1-C6的低碳烷基。 R13为氢、烷基、酰基、磷酸酯（单磷酸酯、二磷酸酯、三磷酸酯或稳定磷酸酯）或硅基。
• Stereocontrolled Syntheses of Deoxyribonucleosides via Photoinduced Electron-Transfer Deoxygenation of Benzoyl-Protected Ribo- and Arabinonucleosides
  作者：Zhiwei Wang、Daniel R. Prudhomme、Jason R. Buck、Minnie Park、Carmelo J. Rizzo

  DOI：10.1021/jo0003652

  日期：2000.9.1

  arabinose, and xylose glycosylation precursors were synthesized bearing C2-esters capable of directing Vorbrüggen glycosylation. The key step is the regioselective deoxygenation of the desired hydroxyl group as either the benzoyl- or 3-(trifluoromethyl)benzoyl derivative. This deoxygenation is accomplished via a photoinduced electron-transfer (PET) mechanism using carbazole derivatives as the photosensitizer

  描述了β2'-脱氧-，α2'-脱氧-，β3'-脱氧-和β2'，3'-脱氧核糖核苷的立体控制的从头合成。合成了具有战略指导意义的受保护的核糖，阿拉伯糖和木糖糖基化前体，它们带有能够指导Vorbrüggen糖基化的C2-酯。关键步骤是所需羟基作为苯甲酰基-或3-（三氟甲基）苯甲酰基衍生物的区域选择性脱氧。该脱氧是通过使用咔唑衍生物作为光敏剂的光诱导电子转移（PET）机制完成的。所需脱氧核苷的合成通常从一个容易获得的常见前体分三步进行。
• Hoffer et al., Journal of the American Chemical Society, 1959, vol. 81, p. 4112
  作者：Hoffer et al.

  DOI：——

  日期：——
• Nucleosides. XII. Direct Synthesis of 2'-Deoxycytidine and its α-Anomer^1,2
  作者：Jack J. Fox、Naishun C. Yung、Iris Wempen、Max Hoffer

  DOI：10.1021/ja01480a027

  日期：1961.10
• Facile Synthesis of α-Anomeric Pyrimidine Nucleosides
  作者：Hiroaki Sawai、Akiko Nakamura、Hidekazu Hayashi、Kazuo Shinozuka

  DOI：10.1080/15257779408012178

  日期：1994.7

  2-Amino-alpha-D-ribofurano[1',2':4,5]-2-oxazoline reacted with alpha-bromoacrylonitrile yielding 2,2'-anhydro-1-alpha-D-ribofuranosylcytosine which was converted to alpha-cytidine and alpha-2'-deoxycytidine. Reaction of 2-amino-alpha-D-ribofurano[1',2':4,5]-2-oxazoline and ethyl alpha-(bromomethyl)acrylate afforded 2,2'anhydro-1- alpha-D-ribofuranosylthymine, a precursor of alpha-thymidine and alpha-ribothymidine.