N⁴-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-methylene-2'-deoxycitydylyl-(3'->5')-3'-O-methylene-5'-deoxy-5'-thiothymidylyl-(3'->5')-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine | 174523-23-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N⁴-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-methylene-2'-deoxycitydylyl-(3'->5')-3'-O-methylene-5'-deoxy-5'-thiothymidylyl-(3'->5')-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine
• 英文别名: N-[1-[(2R,4S,5R)-4-[[(2S,3S,5R)-3-[[(2S,3S,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-2-yl]methylsulfanylmethoxy]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethoxy]-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 174523-23-0
• 化学式: C₇₂H₈₀N₁₀O₁₄S₂Si
• 分子量: 1401.7
• InChiKey: VBNMHJQDVFJVRC-DNJIKFJOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.88
• 重原子数：
  99
• 可旋转键数：
  28
• 环数：
  12.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  318
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-methylene-2'-deoxycitydylyl-(3'->5')-3'-O-methylene-5'-deoxy-5'-thiothymidylyl-(3'->5')-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine 在 ammonium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 48.0h， 以19%的产率得到5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-methylene-2'-deoxycitydylyl-(3'->5')-3'-O-methylene-5'-deoxy-5'-thiothymidylyl-(3'->5')-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine
  参考文献：
  名称：

  A versatile approach to the synthesis of oligonucleotide analogs containing neutral 5<i>'</i>-thioformacetal internucleoside linkages

  摘要：

  DOI：

  10.1139/cjc-77-8-1410
• 作为产物：
  描述：

  5'-S-acetyl-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine 在 甲醇 、 sodium hydroxide 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 N⁴-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-methylene-2'-deoxycitydylyl-(3'->5')-3'-O-methylene-5'-deoxy-5'-thiothymidylyl-(3'->5')-N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2',5'-dideoxy-5'-thioadenosine
  参考文献：
  名称：

  A versatile approach to the synthesis of oligonucleotide analogs containing neutral 5<i>'</i>-thioformacetal internucleoside linkages

  摘要：

  DOI：

  10.1139/cjc-77-8-1410