Structurally Diverse Histone Deacetylase Photoreactive Probes: Design, Synthesis, and Photolabeling Studies in Live Cells and Tissue
作者:Shaimaa M. Aboukhatwa、Thomas W. Hanigan、Taha Y. Taha、Jayaprakash Neerasa、Rajeev Ranjan、Eman E. El‐Bastawissy、Mohamed A. Elkersh、Tarek F. El‐Moselhy、Jonna Frasor、Nadim Mahmud、Alan McLachlan、Pavel A. Petukhov
DOI:10.1002/cmdc.201900114
日期:2019.6.5
tools to study how these factors affect engagement of HDAC isoforms by HDAC inhibitors (HDACi) in cells and tissues are needed. In this study, a synthetic strategy to access chemically diverse photoreactive probes (PRPs) was developed and used to prepare seven novel HDAC PRPs 9-15. The class I HDAC isoform engagement by PRPs was determined in biochemical assays and photolabeling experiments in live SET-2
通过翻译后修饰和多蛋白复合物的形成在体内调节组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 活性。需要新的化学工具来研究这些因素如何影响细胞和组织中 HDAC 抑制剂 (HDACi) 对 HDAC 亚型的参与。在这项研究中,开发了一种获取化学多样性光反应探针 (PRP) 的合成策略,并用于制备七种新型 HDAC PRP 9-15。在活 SET-2、HepG2、HuH7 和 HEK293T 细胞系以及小鼠肝组织中的生化分析和光标记实验中确定了 PRP 与 I 类 HDAC 亚型的结合。与针对重组 HDAC 的 HDAC 蛋白丰度和生化活性不同,PRP 的化学型和细胞类型是定义 HDAC 同种型在活细胞中的参与的关键。