5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-O-methylcytidine | 1171006-87-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-O-methylcytidine
• 英文别名: 4-amino-1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxy-3-methoxyoxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1171006-87-3
• 化学式: C₁₆H₂₉N₃O₅Si
• 分子量: 371.509
• InChiKey: ZIZPEUWYASTPSK-FMKGYKFTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.12
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-O-methylcytidine 、 4-甲氧基三苯基氯甲烷 在 吡啶 作用下， 反应 24.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-N(4)-(4-methoxytrityl)-2'-O-methylcytidine
  参考文献：
  名称：

  Chemical and enzymatic stability of amino acid derived phosphoramidates of antiviral nucleoside 5′-monophosphates bearing a biodegradable protecting group

  摘要：

  我们合成了以L-丙氨酸甲酯为基础的核糖核酸药物，分别含有O-苯基或可生物降解的O-[3-(乙酰氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基]或O-[3-(乙酰氧基甲氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基]保护基团的利巴韦林和2′-O-甲基胞苷5′-磷酰胺盐。通过高效液相色谱-电喷雾质谱/质谱(HPLC-ESI-MS/MS)，研究了这些前药在猪肝酯酶和人前列腺癌全细胞提取物中的去保护动力学。3-(乙酰氧基甲氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基和3-(乙酰氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基容易去除，释放出L-丙氨酸甲酯磷酰胺核苷酸，其中3-(乙酰氧基甲氧基)衍生物去保护的速度约为前者的20倍。此外，还在pH范围为7.5到10的条件下确定了2′-O-甲基胞苷前药的化学稳定性。

  DOI：

  10.1039/b924321f
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 2'-甲氧基胞苷 在 吡啶 作用下， 以100%的产率得到5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-O-methylcytidine
  参考文献：
  名称：

  Chemical and enzymatic stability of amino acid derived phosphoramidates of antiviral nucleoside 5′-monophosphates bearing a biodegradable protecting group

  摘要：

  我们合成了以L-丙氨酸甲酯为基础的核糖核酸药物，分别含有O-苯基或可生物降解的O-[3-(乙酰氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基]或O-[3-(乙酰氧基甲氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基]保护基团的利巴韦林和2′-O-甲基胞苷5′-磷酰胺盐。通过高效液相色谱-电喷雾质谱/质谱(HPLC-ESI-MS/MS)，研究了这些前药在猪肝酯酶和人前列腺癌全细胞提取物中的去保护动力学。3-(乙酰氧基甲氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基和3-(乙酰氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基容易去除，释放出L-丙氨酸甲酯磷酰胺核苷酸，其中3-(乙酰氧基甲氧基)衍生物去保护的速度约为前者的20倍。此外，还在pH范围为7.5到10的条件下确定了2′-O-甲基胞苷前药的化学稳定性。

  DOI：

  10.1039/b924321f

文献信息

• [EN] SUBSTITUTED NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE ANALOGS<br/>[FR] NUCLEOSIDE SUBSTITUE ET ANALOGUES NUCLEOTIDIQUES
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2010108140A1

  公开（公告）日：2010-09-23

  Disclosed herein are nucleotide analogs with protected phosphates, methods of synthesizing nucleotide analogs with protected phosphates and methods of treating diseases and/or conditions such as viral infections, cancer, and/or parasitic diseases with the nucleotide analogs with protected phosphates.

  本文披露了具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物，以及合成具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物的方法，以及利用具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物治疗病毒感染、癌症和/或寄生虫病等疾病和/或症状的方法。
• PROTECTED NUCLEOTIDE ANALOGS
  申请人：Beigelman Leonid

  公开号：US20100240604A1

  公开（公告）日：2010-09-23

  Disclosed herein are nucleotide analogs with protected phosphates, methods of synthesizing nucleotide analogs with protected phosphates and methods of treating diseases and/or conditions such as viral infections, cancer, and/or parasitic diseases with the nucleotide analogs with protected phosphates.

  本文披露了具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物，以及合成具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物的方法，以及利用具有保护磷酸酯基团的核苷酸类似物治疗病毒感染、癌症和/或寄生虫病等疾病和/或症状的方法。
• SUBSTITUTED NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE ANALOGS
  申请人：Beigelman Leonid

  公开号：US20100249068A1

  公开（公告）日：2010-09-30

  Disclosed herein are nucleotide analogs with protected phosphates, methods of synthesizing nucleotide analogs with protected phosphates and methods of treating diseases and/or conditions such as viral infections, cancer, and/or parasitic diseases with the nucleotide analogs with protected phosphates.

  本文公开了一种具有保护磷酸酯的核苷酸类似物，合成具有保护磷酸酯的核苷酸类似物的方法以及使用具有保护磷酸酯的核苷酸类似物治疗病毒感染、癌症和/或寄生虫病等疾病和/或病况的方法。
• Chemical and enzymatic stability of amino acid derived phosphoramidates of antiviral nucleoside 5′-monophosphates bearing a biodegradable protecting group
  作者：Anna Leisvuori、Yuichiro Aiba、Tuomas Lönnberg、Päivi Poijärvi-Virta、Laurence Blatt、Leo Beigelman、Harri Lönnberg

  DOI：10.1039/b924321f

  日期：——

  Ribavirin and 2′-O-methylcytidine 5′-phosphoramidates derived from L-alanine methyl ester bearing either an O-phenyl or a biodegradable O-[3-(acetyloxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl] or O-[3-(acetyloxymethoxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl] protecting group were prepared. The kinetics of the deprotection of these pro-drugs by porcine liver esterase and by a whole cell extract of human prostate carcinoma was studied by HPLC-ESI-MS/MS. The 3-(acetyloxymethoxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl and 3-(acetyloxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl groups were readily removed releasing the L-alanine methyl ester phosphoramidate nucleotide, the deprotection of the 3-(acetyloxymethoxy) derivative being approximately 20 times faster. The chemical stability of the 2′-O-methylcytidine pro-drugs was additionally determined over a pH range from 7.5 to 10.

  我们合成了以L-丙氨酸甲酯为基础的核糖核酸药物，分别含有O-苯基或可生物降解的O-[3-(乙酰氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基]或O-[3-(乙酰氧基甲氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基]保护基团的利巴韦林和2′-O-甲基胞苷5′-磷酰胺盐。通过高效液相色谱-电喷雾质谱/质谱(HPLC-ESI-MS/MS)，研究了这些前药在猪肝酯酶和人前列腺癌全细胞提取物中的去保护动力学。3-(乙酰氧基甲氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基和3-(乙酰氧基)-2,2-双(乙基碳酸酯)丙基容易去除，释放出L-丙氨酸甲酯磷酰胺核苷酸，其中3-(乙酰氧基甲氧基)衍生物去保护的速度约为前者的20倍。此外，还在pH范围为7.5到10的条件下确定了2′-O-甲基胞苷前药的化学稳定性。