tetramethyl (fluoromethanediyl)bis(phosphonate) | 1375082-68-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机膦酸及其衍生物
• 英文名称: tetramethyl (fluoromethanediyl)bis(phosphonate)
• 英文别名: tetramethyl fluoromethylenebisphosphonate；methyl [(dimethoxyphosphoryl)(fluoro)methyl]phosphonate；Bis(dimethoxyphosphoryl)-fluoromethane
• CAS: 1375082-68-0
• 化学式: C₅H₁₃FO₆P₂
• 分子量: 250.101
• InChiKey: SENNNOBYWUJTAV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  71.1
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tetramethyl (fluoromethanediyl)bis(phosphonate) 在 sodium iodide 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 以51%的产率得到sodium methyl[(dimethoxyphosphoryl)(fluoro)methyl]phosphonate
  参考文献：
  名称：

  β,γ-CHF- 和 β,γ-CHCl-dGTP 非对映异构体：DNA 聚合酶新型立体化学探针的合成、离散 31P NMR 特征和绝对构型

  摘要：

  脱氧核苷 5'-三磷酸类似物（其中 β,γ-桥氧已被 CXY 基团取代）是研究 DNA 聚合酶催化和碱基选择机制的有用化学探针。此类探针的局限性在于，当桥接碳取代不等价（X≠Y）时，常规合成方法会产生非对映异构体的混合物。我们在这里报告了这个长期存在的问题的通用解决方案，其中包括四个 β,γ-CXY dNTP 非对映体示例：(S)- 和 (R)-β,γ-CHCl-dGTP (12a-1/12a-2) 和(S)-和(R)-β,γ-CHF-dGTP (12b-1/12b-2)。其制备的核心是将前手性母体双膦酸转化为其 (R)-扁桃酸单酯的 P,C-二吗啉酰胺衍生物 7，从而获得各个非对映异构体 7a-1、7a-2、7b-1、和7b-2通过制备型HPLC。然后选择性酸性水解 PN 键，得到“门户”非对映异构体，该非对映异构体很容易与吗啉激活的 dGMP 偶联。通过 H(2) (Pd/C) 去除手性辅助物，得到四种单独的非对映核苷酸

  DOI：

  10.1021/ja300218x
• 作为产物：
  描述：

  四甲基亚甲基二磷酸酯 在 sodium hydride 、 Selectfluor 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以57%的产率得到tetramethyl (fluoromethanediyl)bis(phosphonate)
  参考文献：
  名称：

  SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF

  摘要：

  本文披露了核苷、核苷酸及其类似物，包括一个或多个核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物，以及它们的合成方法。本文还披露了使用核苷、核苷酸和其类似物来改善和/或治疗疾病和/或病况的方法，包括使用核苷、核苷酸和其类似物来治疗副粘病毒和/或正粘病毒感染的方法。

  公开号：

  US20130165400A1

文献信息

• Completing the β,γ-CXY-dNTP Stereochemical Probe Toolkit: Synthetic Access to the dCTP Diastereomers and ³¹P and ¹⁹F NMR Correlations with Absolute Configurations
  作者：Pouya Haratipour、Corinne Minard、Maryam Nakhjiri、Amirsoheil Negahbani、Brian T. Chamberlain、Jorge Osuna、Thomas G. Upton、Michelle Zhao、Boris A. Kashemirov、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/acs.joc.0c01204

  日期：2020.11.20

  documented here, but the reductive deprotection step is not compatible with dCTP or the bromo substituent in β,γ-CHBr-dNTP analogues. To complete assembly of the toolkit, we describe an alternative synthetic strategy featuring ethylbenzylamine or phenylglycine-derived chiral BP synthons incorporating a photolabile protecting group. After acid-catalyzed removal of the (R)-(+)-α-ethylbenzylamine auxiliary

  β，γ-氧被一个CXY基团模拟的核苷5'-三磷酸（dNTP）类似物（β，γ-CXY-dNTPs）提供了有关DNA聚合酶催化和保真度的信息。CXY立体化学的定义对于阐明精确的结合模式非常重要。我们之前曾报道过通过P，C-二吗啉酰胺CHCl（6a，6b）和CHF（7a，7b）双膦酸酯制备的（R）-和（S）-β，γ-CHX-dGTP非对映异构体（X = F，Cl）（BPs）配备（R）-扁桃酸作为手性助剂，并使用H 2 / Pd进行最终脱保护。该方法还提供了β，γ-CHCl-dTTP（11a，11b），β，γ-CHF（12a，12b）和β，γ-CHCl（13a，13b）dATP非对映异构体，但还原脱保护步骤与dCTP或β，γ-CHBr中的溴取代基不相容-dNTP类似物。为了完成该工具包的组装，我们描述了一种替代合成策略，其特征在于乙基苄胺或苯基甘氨酸衍生的手性BP合成子并入了对光不稳定的保护基团。
• 5′-β,γ-CHF-ATP Diastereomers: Synthesis and Fluorine-Mediated Selective Binding by c-Src Protein Kinase
  作者：Candy S. Hwang、Alvin Kung、Boris A. Kashemirov、Chao Zhang、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/ol503765n

  日期：2015.4.3

  the individual β,γ-CHF-ATP stereoisomers 12a and 12b is reported. Configurationally differing solely by the orientation of the C–F fluorine, 12a and 12b have discrete 31P (202 MHz, pH 10.9, ΔδPα 6 Hz, ΔδPβ 4 Hz) and 19F NMR (470 MHz, pH 9.8, ΔδF 25 Hz) spectral signatures and exhibit a 6-fold difference in IC50 values for c-Src kinase, attributed to a unique interaction of the (S)-fluorine of bound

  报道了单个β，γ-CHF-ATP立体异构体12a和12b的首次制备。构型上由C-F氟，的取向完全不同12A和12B具有离散31 P（202兆赫，pH值10.9，Δδ Pα 6赫兹，Δδ Pβ 4赫兹）和19 F NMR（470兆赫，pH值9.8，Δδ ˚F 25 Hz）的光谱特征，并显示c-Src激酶的IC 50值有6倍的差异，这归因于结合位点12b的（S）氟与活性位点R388的独特相互作用。
• Synthesis and Evaluation of Fluoroalkyl Phosphonyl Analogues of 2-<i>C</i>-Methylerythritol Phosphate as Substrates and Inhibitors of IspD from Human Pathogens
  作者：David Bartee、Michael J. Wheadon、Caren L. Freel Meyers

  DOI：10.1021/acs.joc.8b00686

  日期：2018.9.7

  synthesized a series of phosphonyl analogues of MEP and evaluated their abilities to interact with IspD, both as inhibitors of the natural reaction and as antimetabolite alternative substrates that could be processed enzymatically to form stable phosphonyl analogues as potential inhibitors of downstream MEP pathway intermediates. In this compound series, the S-monofluoro MEP analogue displays the most potent

  靶向细胞壁，蛋白质，核苷酸和叶酸合成以外的基本细菌过程，有望揭示出新的抗微生物剂并扩大可用于联合疗法的潜在药物。异戊二烯前体，异戊烯基二磷酸酯（IDP）和二甲基烯丙基二磷酸酯（DMADP）的合成对所有生物至关重要。然而，人类使用甲羟戊酸途径生产IDP / DMADP，而许多病原体，包括恶性疟原虫和结核分枝杆菌，请使用正交磷酸甲基赤藓糖醇（MEP）途径。为了开发新型抗微生物剂，我们设计和合成了一系列MEP的膦酰基类似物，并评估了它们与IspD相互作用的能力，既可以作为天然反应的抑制剂，又可以作为抗代谢物的替代底物，可以通过酶处理形成稳定的膦酰基类似物，例如下游MEP途径中间体的潜在抑制剂。在该化合物系列中，小号-monofluoro MEP类似物显示针对最有效的抑制活性大肠杆菌ISPD并且是两者的最佳基板的大肠杆菌和恶性疟原虫ISPD直向同源物与ķ米接近大肠杆菌酶的天然底物。这项工作代表了开
• MCKENNA, CHARLES E.;KHAWLI, LESLIE A.;AHMAD, WAN YAACOB;PHAM, PHUONG;BONG+, PHOSPHORUS AND SULFUR., 37,(1988) N-2, C. 1-12
  作者：MCKENNA, CHARLES E.、KHAWLI, LESLIE A.、AHMAD, WAN YAACOB、PHAM, PHUONG、BONG+

  DOI：——

  日期：——
• SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF
  申请人：Alios BioPharma, Inc.

  公开号：US20130165400A1

  公开（公告）日：2013-06-27

  Disclosed herein are nucleosides, nucleotides and analogs thereof, pharmaceutical compositions that include one or more of nucleosides, nucleotides and analogs thereof, and methods of synthesizing the same. Also disclosed herein are methods of ameliorating and/or treating a disease and/or a condition, including an infection from a paramyxovirus and/or an orthomyxovirus, with a nucleoside, a nucleotide and an analog thereof.

  本文披露了核苷、核苷酸及其类似物，包括一个或多个核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物，以及它们的合成方法。本文还披露了使用核苷、核苷酸和其类似物来改善和/或治疗疾病和/或病况的方法，包括使用核苷、核苷酸和其类似物来治疗副粘病毒和/或正粘病毒感染的方法。