tert-butyl (S)-4-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-5-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)pentanoate | 1287745-42-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: tert-butyl (S)-4-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-5-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)pentanoate
• CAS: 1287745-42-9
• 化学式: C₃₃H₃₈N₂O₆
• 分子量: 558.675
• InChiKey: WLOWMHLWVZKLAS-DEOSSOPVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.35
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  102.96
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (S)-4-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-5-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)pentanoate 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  磺酰基-γ-AA肽作为具有广谱活性的高效HIV-1融合抑制剂的合理设计

  摘要：

  HIV-1 流行病对公共卫生具有重大的社会和经济影响。开发新的抗病毒药物以消除耐药性仍然是迫切需要的。在此，我们证明了磺酰基-γ-A肽可以被设计来模拟 MTSC22EK，一种源自 CHR 的有效 HIV 融合抑制剂。在真实的 HIV-1 感染测定中，最好的两个序列显示出与 MTSC22EK 相当的活性，并对许多 HIV-1 临床分离株表现出广谱抗 HIV-1 活性。此外，磺酰基-γ-A肽在PAMPA-GIT和PAMPA-BBB测定中表现出显着的蛋白水解抗性和良好的渗透性，表明这两种序列都可以控制中枢神经系统内的HIV-1并具有良好的口服生物利用度。机理研究表明，这些磺酰基-γ-AA肽通过模仿gp41的CHR发挥作用，并与NHR紧密结合，从而抑制HIV-1融合所需的6-HB结构的形成。总的来说，我们的结果表明磺酰基-γ-AA肽代表了新一代抗HIV-1融合抑制剂。此外，这种设计策略可以用来调节许多

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c01412
• 作为产物：
  描述：

  (S)-4-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-5-氧代戊酸叔丁酯 在 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.75h， 生成 tert-butyl (S)-4-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-5-((2-(benzyloxy)-2-oxoethyl)amino)pentanoate
  参考文献：
  名称：

  γ-AApeptides: design, synthesis and evaluation

  摘要：

  一种新型肽类似物被称为“γ-AA肽”，已被描述。γ-AA肽的设计和合成，以及其对p53/MDM2相互作用的潜在生物活性得到了证明。研究还发现，γ-AA肽对蛋白酶降解具有高度抗性。开发特定序列的γ-AA肽可能会引领一系列具有新框架的肽类模拟物，有助于药物发现或肽/蛋白的模仿。

  DOI：

  10.1039/c0nj00943a

文献信息

• α-Helix-Mimicking Sulfono-γ-AApeptide Inhibitors for p53–MDM2/MDMX Protein–Protein Interactions
  作者：Peng Sang、Yan Shi、Junhao Lu、Lihong Chen、Leixiang Yang、Wade Borcherds、Sami Abdulkadir、Qi Li、Gary Daughdrill、Jiandong Chen、Jianfeng Cai

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00993

  日期：2020.2.13

  for the inhibition of protein-protein interactions (PPIs). Herein, we demonstrate that sulfono-γ-AApeptides can be rationally designed to mimic the p53 α-helix and inhibit p53-MDM2 PPIs. The best inhibitor, with Kd and IC50 values of 26 nM and 0.891 μM toward MDM2, respectively, is among the most potent unnatural peptidomimetic inhibitors disrupting the p53-MDM2/MDMX interaction. Using fluorescence polarization

  拟肽支架的使用是抑制蛋白相互作用的一种有前途的策略。在本文中，我们证明了可以合理设计磺基-γ-AA肽以模仿p53α-螺旋并抑制p53-MDM2 PPI。最好的抑制剂对MDM2的Kd和IC50值分别为26 nM和0.891μM，是破坏p53-MDM2 / MDMX相互作用的最有效的非天然拟肽抑制剂之一。使用荧光偏振分析，圆二色性，核磁共振波谱和计算模拟，我们证明了磺基-γ-AA肽采用类似于p53的螺旋结构，并通过结合到MDM2的疏水缝隙竞争性抑制p53-MDM2相互作用。有趣的是 通过增强p53转录活性并诱导MDM2和p21的表达，吻合的磺酰基-γ-AA肽显示出有希望的细胞活性。此外，磺基-γ-AA肽对蛋白水解表现出显着的抗性，从而增强了它们的生物学潜力。我们的结果表明，磺基-γ-AA肽是一类新型的破坏PPI的非天然螺旋折叠剂。
• [EN] Β−CATENIN/ B-CELL LYMPHOMA 9 PROTEIN−PROTEIN INTERACTION INHIBITING PEPTIDOMIMETICS<br/>[FR] INTERACTION PROTÉINE-PROTÉINE DE β−CATÉNINE/LYMPHOME 9 À CELLULES B INHIBANT DES PEPTIDOMIMÉTIQUES
  申请人：UNIV SOUTH FLORIDA

  公开号：WO2020219819A1

  公开（公告）日：2020-10-29

  Disclosed herein is a series of helical sulfono-γ-AApeptides that mimic the binding mode of the α-helical HD2 domain of B-Cell Lymphoma 9 (BCL9). As disclosed herein, sulfono-γ-AApeptides can structurally and functionally mimic the α-helical domain of BCL9, and selectively disrupt β−catenin/BCL9 PPIs with even higher potency. More intriguingly, these sulfono-γ-AApeptides can enter cancer cells, bind with β−catenin and disrupt β−catenin/BCL PPI, and exhibit excellent cellular activity, which is much more potent than the BCL9 peptide. Furthermore, enzymatic stability studies demonstrated the remarkable stability of the helical sulfono-γ-AApeptides, with no degradation in the presence of pronase for 24 h, augmenting their biological potential.

  本文披露了一系列螺旋状磺酸γ-AA肽，其模拟B细胞淋巴瘤9（BCL9）的α螺旋HD2结构域的结合方式。如本文所披露的，磺酸γ-AA肽可以在结构上和功能上模拟BCL9的α螺旋结构域，并且具有更高效的选择性破坏β-连环蛋白/BCL9蛋白相互作用。更有趣的是，这些磺酸γ-AA肽可以进入癌细胞，与β-连环蛋白结合并破坏β-连环蛋白/BCL蛋白相互作用，并展现出优秀的细胞活性，远比BCL9肽更为有效。此外，酶稳定性研究表明，这些螺旋状磺酸γ-AA肽具有显著的稳定性，在存在胃蛋白酶的情况下，24小时内不会发生降解，增强了它们的生物潜力。
• Lipo-γ-AApeptides as a New Class of Potent and Broad-Spectrum Antimicrobial Agents
  作者：Youhong Niu、Shruti Padhee、Haifan Wu、Ge Bai、Qiao Qiao、Yaogang Hu、Lacey Harrington、Whittney N. Burda、Lindsey N. Shaw、Chuanhai Cao、Jianfeng Cai

  DOI：10.1021/jm300274p

  日期：2012.4.26

  antibiotic agents, as they have the potential to circumvent emerging drug resistance against conventional antibiotic treatments. Non-natural antimicrobial peptidomimetics are an ideal example of this, as they have significant potency and in vivo stability. Here we report for the first time the design of lipidated γ-AApeptides as antimicrobial agents. These lipo-γ-AApeptides show potent broad-spectrum activities

  对开发抗菌肽（AMPs）作为下一代抗生素的需求日益增长，因为它们具有规避新兴的对常规抗生素治疗的耐药性的潜力。非天然抗菌肽模拟物是一个理想的例子，因为它们具有显着的效力和体内稳定性。在这里，我们首次报道了脂化的γ-AA肽作为抗菌剂的设计。这些脂质-γ-AA肽对真菌和一系列革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌（包括对大多数抗生素具有抗药性的临床相关病原体）显示出有效的广谱活性。我们使用膜去极化和荧光显微镜分析了它们的结构-功能关系和抗菌机制。引入不饱和脂质链显着降低了溶血活性，从而提高了选择性。此外，代表性的lipo-γ-AA肽不会在小鼠体内诱导耐药性金黄色葡萄球菌，即使经过17轮传代。这些结果表明，脂质-γ-AA肽具有类似于AMP的杀菌机制，并且具有作为新型新型抗生素治疗剂的强大潜力。
• DNA-Templated Polymerization of Side-Chain-Functionalized Peptide Nucleic Acid Aldehydes
  作者：Ralph E. Kleiner、Yevgeny Brudno、Michael E. Birnbaum、David R. Liu

  DOI：10.1021/ja0753997

  日期：2008.4.1

  The DNA-templated polymerization of synthetic building blocks provides a potential route to the laboratory evolution of sequence-defined polymers with structures and properties not necessarily limited to those of natural biopolymers. We previously reported the efficient and sequence-specific DNA-templated polymerization of peptide nucleic acid (PNA) aldehydes. Here, we report the enzyme-free, DNA-templated polymerization of side-chain-functionalized PNA tetramer and pentamer aldehydes. We observed that polymerization of tetramer and pentamer PNA building blocks with a single lysine-based side chain at various positions in the building block could proceed efficiently and sequence specifically. In addition, DNA-templated polymerization also proceeded efficiently and in a sequence-specific manner with pentamer PNA aldehydes containing two or three lysine side chains in a single building block to generate more densely functionalized polymers. To further our understanding of side-chain compatibility and expand the capabilities of this system, we also examined the polymerization efficiencies of 20 pentamer building blocks each containing one of five different side-chain groups and four different side-chain regio- and stereochemistries. Polymerization reactions were efficient for all five different side-chain groups and for three of the four combinations of side-chain regio- and stereochemistries. Differences in the efficiency and initial rate of polymerization correlate with the apparent melting temperature of each building block, which is dependent on side-chain regio- and stereochemistry but relatively insensitive to side-chain structure among the substrates tested. Our findings represent a significant step toward the evolution of sequence-defined synthetic polymers and also demonstrate that enzyme-free nucleic acid-templated polymerization can occur efficiently using substrates with a wide range of side-chain structures, functionalization positions within each building block, and functionalization densities.