Design, synthesis and molecular modelling of phenoxyacetohydrazide derivatives as Staphylococcus aureus MurD inhibitors
作者:Srikanth Jupudi、Mohammed Afzal Azam、Ashish Wadhwani
DOI:10.1007/s11696-020-01380-2
日期:2021.3
Gram-negative bacteria P. aeruginosa NCIM 2036 with MIC value of 64 µg/ml. Among three tested compounds, 4k exhibited highest inhibitory activity against S. aureus MurD enzyme with IC50 value of 35.80 µM. Further binding interactions of 4a-k with the modelled S. aureus MurD catalytic pocket residues is investigated with the extra-precision molecular docking and binding free energy calculation by MM-GBSA approach
在本工作中,我们合成了一系列新的苯氧基乙酰肼功能化合物4a-k,并通过光谱数据对其进行了表征。在体外筛选合成的化合物的抗菌活性。化合物4a,4j和4k对金黄色葡萄球菌NCIM 5022表现出抑制活性,MIC值为64 µg / ml。这些化合物还对耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌ATCC 43300表现出MIC为128 µg / ml。在所有测试的化合物中,化合物4c和4j分别显示出最高的抗枯草芽孢杆菌NCIM 2545和肺炎克雷伯氏菌的活性。NCIM2706。只有一种化合物(即4d)显示出对另一种革兰氏阴性细菌铜绿假单胞菌NCIM 2036的活性,MIC值为64 µg / ml。在三种测试化合物中,4k表现出对金黄色葡萄球菌MurD酶的最高抑制活性,IC 50值为35.80 µM。通过超精确分子对接和结合自由能的MM-GBSA计算,研究了4a-k与金黄色葡萄球菌MurD催化口袋残基的进一步结合相