10-cyanomethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7-tricarboxylic acid tri-tert-butyl ester | 437658-56-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪烷类
• 英文名称: 10-cyanomethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7-tricarboxylic acid tri-tert-butyl ester
• 英文别名: 1-cyanomethyl-4,7,10-tris(tert-butyloxycarbonyl)-1,4,7,10-tetraazacyclododecane；Tritert-butyl 10-(cyanomethyl)-1,4,7,10-tetrazacyclododecane-1,4,7-tricarboxylate
• CAS: 437658-56-5
• 化学式: C₂₅H₄₅N₅O₆
• 分子量: 511.662
• InChiKey: ZTKJLGMEBNXRGH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  587.6±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.089±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.84
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  10-cyanomethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7-tricarboxylic acid tri-tert-butyl ester 在 盐酸 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 氨 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 40.0 ℃ 、2.0 MPa 条件下， 反应 69.0h， 生成 octadecanoic acid [2-(1,4,7,10-tetraazacyclododec-1-yl)ethyl]amide
  参考文献：
  名称：

  来自两亲性锌 (II)-Cyclen 复合物的囊泡和胶束作为水解 DNA 裂解的高效促进剂

  摘要：

  磷酸酯对任何生物体都是必不可少的，它们的特定水解在许多代谢过程中起着重要作用。由于磷酸二酯键非常稳定，就像在 DNA 中一样，人们付出了很大的努力来模拟水解酶的活性位点，这些酶可以很容易地切割这些键，并且经常发现含有一种或多种配位金属离子。考虑到这一点，我们报告了胶束和囊泡 Zn(II)-cyclen 复合物，它们显着促进了天然 DNA 和活化模型底物双（4-硝基苯基）磷酸酯 (BNPP) 的水解裂解。它们是由先前使用的复合物在水溶液中的两亲衍生物自组装形成的，因此无需大量合成工作即可简单快速地连接多个活性金属位点。考虑到 BNPP 在 25 °C 和 pH 值为 8 时的水解裂解，胶束和囊泡金属催化剂显示出与相同条件下的单分子复合物相比，二级速率常数 (k(2)) 增加了 4-7 个数量级. 在中性 pH 值下，它们产生迄今为止报告的最高 k(2) 值。对于 pBR322 质粒 DNA，在与囊泡

  DOI：

  10.1021/ja209247w
• 作为产物：
  描述：

  二碳酸二叔丁酯 在 potassium carbonate 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 10-cyanomethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7-tricarboxylic acid tri-tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  来自两亲性锌 (II)-Cyclen 复合物的囊泡和胶束作为水解 DNA 裂解的高效促进剂

  摘要：

  磷酸酯对任何生物体都是必不可少的，它们的特定水解在许多代谢过程中起着重要作用。由于磷酸二酯键非常稳定，就像在 DNA 中一样，人们付出了很大的努力来模拟水解酶的活性位点，这些酶可以很容易地切割这些键，并且经常发现含有一种或多种配位金属离子。考虑到这一点，我们报告了胶束和囊泡 Zn(II)-cyclen 复合物，它们显着促进了天然 DNA 和活化模型底物双（4-硝基苯基）磷酸酯 (BNPP) 的水解裂解。它们是由先前使用的复合物在水溶液中的两亲衍生物自组装形成的，因此无需大量合成工作即可简单快速地连接多个活性金属位点。考虑到 BNPP 在 25 °C 和 pH 值为 8 时的水解裂解，胶束和囊泡金属催化剂显示出与相同条件下的单分子复合物相比，二级速率常数 (k(2)) 增加了 4-7 个数量级. 在中性 pH 值下，它们产生迄今为止报告的最高 k(2) 值。对于 pBR322 质粒 DNA，在与囊泡

  DOI：

  10.1021/ja209247w

文献信息

• Zinc(II)cyclen–peptide conjugates interacting with the weak effector binding state of Ras
  作者：Florian Schmidt、Ina C. Rosnizeck、Michael Spoerner、Hans Robert Kalbitzer、Burkhard König

  DOI：10.1016/j.ica.2010.07.067

  日期：2011.1

  obtained from alkyne-azide cycloaddition reactions. NMR investigations of the prepared compounds revealed that the peptide conjugates do not lead to an increase in Ras binding affinity of the metal complex–peptide conjugates. The dinuclear zinc complexes lead to an immediate precipitation of the protein prohibiting spectroscopic investigations of their binding.

  摘要制备了锌（II）环素-肽杂合化合物和双锌（II）环素复合物，作为鸟嘌呤核苷酸结合蛋白Ras的潜在结合剂，该蛋白是细胞信号转导中的重要分子开关。化合物的设计基于先前的观察结果，即锌（II）环素络合物可作为Ras-效应子相互作用抑制剂的先导化合物，因此能够中断Ras诱导的信号转导。锌（II）环素选择性地稳定了活性Ras的构象状态1，这种构象状态与效应蛋白（如Raf激酶）的亲和力大大降低。为了实现此类Ras-Raf相互作用抑制剂的更高结合亲和力，通过固相合成方案制备了衍生自Ras-活化剂SOS序列的具有短肽的锌（II）环素共轭物。从核-叠氮化物环加成反应获得双核双锌（II）环素复合物。所制备化合物的NMR研究表明，肽结合物不会导致金属络合物-肽结合物的Ras结合亲和力增加。双核锌复合物导致蛋白质立即沉淀，从而阻止了对其结合的光谱研究。
• NADH Model Systems Functionalized with Zn(II)-Cyclen as Flavin Binding SiteStructure Dependence of the Redox Reaction within Reversible Aggregates
  作者：Roland Reichenbach-Klinke、Michael Kruppa、Burkhard König

  DOI：10.1021/ja026719j

  日期：2002.11.1

  disposition of the redox partners for efficient reaction we have synthesized NADH models with Zn(II)-cyclen substituents for reversible flavin binding in water. Altogether, four of these model systems with systematically varying spacer length between the recognition site and the redox active dihydronicotinamide were prepared. The binding of these model systems to riboflavin tetraacetate was confirmed by

  在结构多样的黄素酶组中，辅基 FAD 和辅因子 NADH 的相对位置和构象非常保守。为了为氧化还原伙伴的这种明显最佳的相对处置提供化学合理性，以实现有效反应，我们合成了具有 Zn(II)-环烯取代基的 NADH 模型，用于在水中可逆地结合黄素。总之，这些模型系统中的四个在识别位点和氧化还原活性二氢烟酰胺之间具有系统地变化的间隔长度。这些模型系统与核黄素四乙酸酯的结合通过水中的电位 pH 滴定得到证实，并且它们与黄素的反应随后在生理条件下在水性介质中进行 UV-vis 光谱分析。测量结果表明，分子间反应的速率显着提高了 175 倍。此外，观察到反应速率对间隔长度的强烈依赖性，这清楚地表明，在动态可逆组装中，只有氧化还原伙伴的最佳相对配置才能确保有效的氧化还原反应。
• Guanidine Is a Zn²⁺-Binding Ligand at Neutral pH in Aqueous Solution
  作者：Shin Aoki、Kenta Iwaida、Noriko Hanamoto、Motoo Shiro、Eiichi Kimura

  DOI：10.1021/ja020029y

  日期：2002.5.1

  guanidine-coordinating complex ZnL(1). 4-Nitrophenyl phosphate dianion (NPP(2-)) interacted with ZnL(1) through a new Zn(2+)-phosphate coordination, as indicated by (31)P NMR titration and potentiometric pH titration. An apparent complexation constant for this new species, log K(app)(Zn(L(1).H(+))-NPP), was 4.0 +/- 0.1, which is larger than the log K(app)(ZnL(2)-NPP) value of 3.1 for the 1:1 complex of Zn(2+)-cyclen

  我们在 1:1 复合物 (ZnL(1)) 中发现了胍与 Zn(2+) 的第一个充分表征的协调，其中 Cyclen (= 1,4,7,10-四氮杂环十二烷) 用胍基乙基 (L( 1) = (2-胍基)乙基-环烯)。X 射线结构分析的 1:1 复杂结晶在 pH 值 7.5 揭示了悬垂胍基到 ZnL(1) 中的 Zn(2+) 离子的顶端协调。通过电位法 pH 滴定，最初形成 1:1 Zn(L(1).H(+)) 复合物，其中只有 cyclen N 与 Zn(2+) 结合，复合常数 log K(s) (K(s) = [Zn(L(1).H(+))]/[Zn(2+)][L(1).H(+)] (M(-1)))，为 12.4 +/- 0.1。Zn(L(1).H(+)) 中胍吊坠的轻松去质子化发生在 5.9 + /-0.1 的 pK(a) 值在 25 摄氏度与 I = 0.1 (NaNO(3)) 以产生胍配位络合物
• A straightforward and convenient pathway for the synthesis of functional bismacrocyclic ligands
  作者：Pascal Kadjane、Nikos K. Logothetis、Goran Angelovski

  DOI：10.1016/j.tetlet.2011.01.133

  日期：2011.4

  The synthesis of a novel DO3A-based bismacrocyclic ligand is reported. The synthetic pathway involved a series of simple and convenient steps, which can easily provide the desired product in larger quantities than produced in current synthetic procedures. This method enables the facile preparation of binuclear macrocyclic complexes which can be used in MRI, as well as other molecular imaging modalities. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.