牛病毒性腹泻病毒(BVDV)是一种瘟病毒,其在牛中的感染在全球范围内分布。抗病毒药的使用可以补充疫苗接种作为控制手段,并减少经济损失。病毒的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)对于其
基因组复制是必不可少的,并且构成了抗病毒药物鉴定的诱人靶标。为了获得选择性的BVDV
抑制剂,使用BVDV RdRp的晶体结构进行虚拟筛选。对来自商业数据库和内部数据库的大约15,000个小分子进行了评估,并在体外测试了几种结构不同的化合物的抗病毒活性。有趣的是,在十二种被评估化合物中,有五种处于活性状态并显示出
EC 50值在亚微摩尔和低微摩尔范围内。药物添加实验和测量细胞内BVDV RNA的时间表明,化合物7在RNA合成过程中起作用。进行了分子动力学和MM / P
BSA计算以表征最具活性的化合物与RdRp的相互作用,这将使将来的
配体优化成为可能。这些研究突出了计算机筛选技术的使用,以鉴定一类新的BVDV
抑制剂。