1-oxo-1H-phenalene-2,3-dicarbonitrile

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 非那烯类
• 英文名称: 1-oxo-1H-phenalene-2,3-dicarbonitrile
• 英文别名: 1-Oxo-1H-phenalene-2,3-dicarbonitrile；3-oxophenalene-1,2-dicarbonitrile
• 化学式: C₁₅H₆N₂O
• 分子量: 230.225
• InChiKey: VAFDMFLAMOHYIE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  64.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-oxo-1H-phenalene-2,3-dicarbonitrile 在 水 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 6.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Targeting the Allosteric Pathway That Interconnects the Core-Functional Scaffold and the Distal Phosphorylation Sites for Specific Dephosphorylation of Bcl-2

  摘要：

  Protein phosphorylation is the most significant post-translational modification for regulating cellular activities, but site-specific modulation of phosphorylation is still challenging. Using three-dimensional NMR spectra, molecular dynamics simulations, and alanine mutations, we identified that the interaction network between pT69/pS70 and R106/R109 residues prevents the phosphorylation sites from exposure to phosphatase and subsequent dephosphorylation. A Bcl-2-dephosphorylation probe, S1-6e, was designed by installing a carboxylic acid group to a Bcl-2 inhibitor. The carboxyl group competitively disrupts the interaction network between R106/R109 and pT69/pS70 and subsequently facilitates Bcl-2 dephosphorylation in living cells. As a result, S1-6e manifests a more effective apoptosis induction in pBcl-2-dependent cancer cells than other inhibitors exhibiting a similar binding affinity for Bcl-2. We believe that targeting the allosteric pathways interconnecting the core-functional domain and the phosphorylation site can be a general strategy for a rational design of site-specific dephosphorylating probes, since the allosteric pathway has been discovered in a variety of proteins.

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c01290
• 作为产物：
  描述：

  1-(二氰基亚甲基)-2-氧代苊 以 乙腈 为溶剂， 以84%的产率得到1-oxo-1H-phenalene-2,3-dicarbonitrile
  参考文献：
  名称：

  A dynamic invertible intramolecular charge-transfer fluorescence probe: real-time monitoring of mitochondrial ATPase activity

  摘要：

  一种动态可逆的分子内电荷转移荧光探针成功用于监测线粒体ATP酶活性的实时监测。

  DOI：

  10.1039/c7cc02450a

文献信息

• A dynamic invertible intramolecular charge-transfer fluorescence probe: real-time monitoring of mitochondrial ATPase activity
  作者：Hua Zhang、Yafu Wang、Xiaopeng Xuan、Ge Wang、Haiming Guo、Jiangli Fan

  DOI：10.1039/c7cc02450a

  日期：——

  A dynamic invertible intramolecular charge-transfer fluorescence probe was successfully utilized for the real-time monitoring of mitochondrial ATPase activity.

  一种动态可逆的分子内电荷转移荧光探针成功用于监测线粒体ATP酶活性的实时监测。
• 1-Oxo-1<i>H</i>-phenalene-2,3-dicarbonitrile Heteroaromatic Scaffold: Revised Structure and Mechanistic Studies
  作者：Romaric Lenk、Arnaud Tessier、Pierre Lefranc、Virginie Silvestre、Aurélien Planchat、Virginie Blot、Didier Dubreuil、Jacques Lebreton

  DOI：10.1021/jo5016932

  日期：2014.10.17

  Synthesis of the originally proposed 8-oxo-8H-acenaphtho[1,2-b]pyrrol-9-carbonitrile led to a structural revision, and the product has now been identified as unknown compound 1-oxo-1H-phenalene-2,3-dicarbonitrile. The structural assignment was corroborated by detailed NMR studies and unambiguously confirmed by X-ray diffraction. A mechanism is proposed to explain the formation of this original heterocyclic

  最初提出的8-oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-甲腈的合成导致结构改变，该产品现已鉴定为未知化合物1-oxo-1 H -phenalene- 2,3-二碳腈。通过详细的NMR研究证实了结构归属，并通过X射线衍射明确证实了该结构归属。提出了一种机制来解释这种原始的杂环支架的形成。另外，提出了一些涉及该化合物的新化学转化。
• 2-氰基非那烯酮类化合物及其在白血病治疗中的应用
  申请人：大连理工大学

  公开号：CN112851558B

  公开（公告）日：2022-01-07

  本发明提供了一类2‑氰基非那烯酮类化合物及其应用，属于医药化学技术领域。所述化合物由对2,3‑二氰基非那烯酮的6‑位和3‑位进行化合物修饰(即分别引入R1和R2)而获得。本发明的2‑氰基非那烯酮类化合物能够在体外、细胞内和动物模型内与Hsp70蛋白结合，竞争性解离Hsp70/Bim蛋白二聚体，从而诱导慢性粒细胞白血病细胞凋亡，从而达到抑制慢性粒细胞白血病细胞生长以及杀伤慢性粒细胞白血病细胞的效果，是一类活性非常高的凋亡诱导剂，可作为制备治疗或预防慢性粒细胞白血病的潜在药物。
• 一类非那烯酮类化合物及其应用
  申请人：大连理工大学

  公开号：CN111170954B

  公开（公告）日：2023-03-28

  一类非那烯酮类化合物及其应用，其属于荧光标记的技术领域。它包括6‑(4‑取代哌嗪基)非那烯酮类化合物和6‑(1‑取代三氮唑‑4‑甲胺基)非那烯酮类化合物。该类化合物在体外、体内的竞争性结合和拮抗Bcl‑2和Mcl‑1蛋白，从而诱导细胞凋亡作用和作为抗癌化合物的应用；此外，以其为基础设计的衍生物可以作为双功能分子,实现对靶蛋白的表达水平，时空分布等生物信息的检测。以及这些化合物作为分子工具原位可视化和原位筛选抑制剂的应用，对早期临床诊断、疾病的发展和有效的治疗具有重要意义。
• Deactivation of Mcl-1 by Dual-Function Small-Molecule Inhibitors Targeting the Bcl-2 Homology 3 Domain and Facilitating Mcl-1 Ubiquitination
  作者：Ting Song、Ziqian Wang、Fangling Ji、Yingang Feng、Yudan Fan、Gaobo Chai、Xiangqian Li、Zhiqiang Li、Zhichao Zhang

  DOI：10.1002/anie.201606543

  日期：2016.11.7

  leading to the inhibition of ubiquitination. A dual function Mcl‐1 inhibitor, which locates at the BH3 domain of Mcl‐1 and forms hydrogen bond with His224 to drive a helical QRN conformation, so that it not only interferes with the pro‐apoptotic partners, but also facilitates Mcl‐1 ubiquitination in living cells, is described. As a result, this inhibitor manifests a more effective apoptosis induction

  通过有限的蛋白水解测定，三维NMR，X射线晶体学和丙氨酸突变，已确定Mcl-1的Bcl-2同源3（BH3）域中Q221R222N223基序的动态区域是构象转换，控制Mcl-1泛素化。Noxa BH3结合使QRN基序偏向螺旋构象，从而导致Mcl-1的体外泛素化增强。相比之下，Bim BH3结合使QRN基序偏向非螺旋构象，从而导致泛素化的抑制。Mcl-1双重功能抑制剂，位于Mcl-1的BH3结构域并与His224形成氢键以驱动螺旋QRN构象，因此它不仅干扰促凋亡伴侣，而且促进Mcl-1描述了活细胞中的泛素化。结果，这种抑制剂在Mcl-1依赖性癌细胞中表现出比其他具有相似结合亲和力的抑制剂更有效的凋亡诱导作用。