Fmoc-Gly(1-¹³C)-OH

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: Fmoc-Gly(1-¹³C)-OH
• 英文别名: Fmoc-glycine-1-13C；Fmoc-Gly-OH-1-¹³C；Fmoc-glycine (¹³C-1)；Fmoc-glycine (¹³C-1)-OH；Fmoc-Gly(¹³C-1)-OH；Fmoc-Gly-OH-1-13C；2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)acetic acid
• 化学式: C₁₇H₁₅NO₄
• 分子量: 298.299
• InChiKey: NDKDFTQNXLHCGO-LOYIAQTISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-Gly(1-¹³C)-OH 在 重氧水 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 48.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Evaluation of Dihedral Angles of Peptides Using IR Bands of Two Successive Isotope Labeled Residues

  摘要：

  由于肽键（酰胺带）引起的红外（IR）吸收带已被广泛用于确定肽的二级结构并分析酰胺之间的分子内和分子间相互作用。在本研究中，还利用标记同位素的两个连续残基的酰胺 I 红外带评估了肽中一个残基的二面角。用 13C 和 18O 同位素标记的两个连续残基产生了双峰酰胺 I 红外带，利用 GF 矩阵和从头算分子轨道计算分析了双峰带的强度比（Rint）和峰位差（Δν）。我们得到了 Rint 和 Δν 随两个二面角变化的二维计算图。Rint 和 Δν 曲线的交点即为测量残基的两个二面角。评估得到的简单肽的二面角与已报道的值进行了比较。我们讨论了基于获得结果的本方法在生物聚合物中的局限性和应用。

  DOI：

  10.1246/bcsj.20180183
• 作为产物：
  描述：

  9-芴甲基-N-琥珀酰亚胺基碳酸酯 、 甘氨酸-1-13C 在 三乙胺 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.5h， 以83%的产率得到Fmoc-Gly(1-¹³C)-OH
  参考文献：
  名称：

  通过N→Se酰基转移形成肽硫酯的研究。

  摘要：

  天然化学连接被广泛用于蛋白质的收敛合成。生产该过程所需的肽硫酯可能具有挑战性，特别是在使用基于Fmoc的固相肽合成时。先前我们已经报道了在Fmoc固相肽合成之后，通过N → S合成肽硫酯的方法在弱酸性条件下，由C端半胱氨酸残基的存在引发的酰基转移。在典型的反应条件下，由于反应时间长（〜48小时），我们偶尔会观察到明显的硫酯水解，并试图加速反应。在这里，我们提出了一种更快的肽硫酯途径，方法是用硒代半胱氨酸取代C端半胱氨酸残基，并通过N → Se引发硫酯形成酰基转移。这种修饰使得硫酯的形成可以在较低的温度和较短的时间范围内进行。当线性前体具有N端半胱氨酸和C端硒代半胱氨酸时，我们还证明了该策略的应用如何还可以加速肽环化。版权所有©2013欧洲多肽协会和John Wiley＆Sons，Ltd.

  DOI：

  10.1002/psc.2469

文献信息

• Generation of an<i>S</i>-Peptide via an<i>N</i>–<i>S</i>Acyl Shift Reaction in a TFA Solution
  作者：Ken’ichiroh Nakamura、Megumi Sumida、Toru Kawakami、Thomas Vorherr、Saburo Aimoto

  DOI：10.1246/bcsj.79.1773

  日期：2006.11

  An N–S acyl shift reaction of thiol-containing peptides in a trifluoroacetic acid (TFA) solution was confirmed by a combination of 13C NMR spectroscopy, reversed-phase (RP) HPLC, and MS analyses. A model peptide containing a cysteine residue was transformed into an S-peptide in a TFA solution. The S-peptide was quickly transformed to the original peptide during RP-HPLC analysis even when an eluent that contained 0.1% TFA was used. A peptide that had an N-2-mercapto-4,5-dimethoxybenzyl (Dmmb) group was also transformed into an S-peptide, forming a thioester bond with the thiol of the Dmmb group by TFA treatment. The generated S-peptide was isolated by directly injecting the reaction mixture into a RP-HPLC and was readily converted to the corresponding 2-sulfoethyl thioester via an intermolecular thiol exchange reaction with sodium 2-mercaptoethanesulfonate. The 2-sulfoethyl peptide thioester is widely used as a building block in polypeptide synthesis. The N–S acyl shift reaction observed in peptides with or without an auxiliary group provides a new route for the preparation of peptide thioesters.

  在三氟乙酸（TFA）溶液中，通过13C NMR光谱学、反相（RP）高效液相色谱（HPLC）和质谱分析的组合，证实了含硫醇肽的N–S酰基移位反应。一个含有半胱氨酸残基的模型肽在TFA溶液中转化为S-肽。即使在含有0.1% TFA的洗脱液中进行RP-HPLC分析时，S-肽也迅速转变为原始肽。含有N-2-巯基-4,5-二甲氧基苄基（Dmmb）基团的肽也通过TFA处理转化为S-肽，与Dmmb基团的硫醇形成硫酯键。生成的S-肽通过直接将反应混合物注入RP-HPLC中分离，并通过与硫醇乙磺酸钠的分子间硫醇交换反应，容易地转化为相应的2-磺乙基硫酯。2-磺乙基肽硫酯广泛用作多肽合成中的构建块。在有无辅助基团的肽中观察到的N–S酰基移位反应为肽硫酯的制备提供了一条新途径。
• Expanding the scope of N → S acyl transfer in native peptide sequences
  作者：Ben Cowper、Leila Shariff、Wenjie Chen、Samantha M. Gibson、Wei-Li Di、Derek Macmillan

  DOI：10.1039/c5ob01029b

  日期：——

  influence N → S acyl transfer in native peptide sequences, and discovery of new reagents that facilitate it, will be key to expanding its scope and applicability. Here, through a study of short model peptides in thioester formation and cyclisation reactions, we demonstrate that a wider variety of Xaa-Cys motifs than originally envisaged are capable of undergoing efficient N → S acyl transfer. We present

  了解影响天然肽序列中N→S酰基转移的因素，并发现促进其转移的新试剂，将是扩大其范围和适用性的关键。在这里，通过对硫酯形成和环化反应中的短模型肽的研究，我们证明了比最初设想的更广泛的Xaa-Cys基序能够进行有效的N→S酰基转移。我们提供了一组代表性氨基酸的硫酯形成和环化的相对速率的数据，并显示了这种扩大的范围如何可以应用于天然蛋白酶抑制剂向日葵胰蛋白酶抑制剂1（SFTI-1）的生产。
• Solid-Phase Synthesis of Oligosaccharides and On-Resin Quantitative Monitoring Using Gated Decoupling ¹³C NMR
  作者：Takuya Kanemitsu、Chi-Huey Wong、Osamu Kanie

  DOI：10.1021/ja0167396

  日期：2002.4.1

  A general strategy for solid-phase oligosaccharide synthesis capable of nondestructive quantitative monitoring has been developed. The synthesis was carried out on TentaGel using thioglycosides as glycosylating agents and dimethylthiomethylsulfonium triflate as the activator. An acylsulfonamide linker was introduced to cleave the oligosaccharide from the resin. The solid-phase reactions were monitored

  已经开发出能够进行无损定量监测的固相寡糖合成的一般策略。合成是在 TentaGel 上进行的，使用硫糖苷作为糖基化剂，使用二甲基硫代甲基锍三氟甲磺酸盐作为活化剂。引入酰基磺酰胺接头以从树脂上裂解寡糖。通过使用 13C NMR 的反向门控去耦技术对固相反应进行定量监测，其中使用两种富含 13C 的标记物来监测反应：一种是作为接头的一部分并作为内标的富含 13C 的甘氨酸，另一个是富含 13C 的乙酰基，用作糖基化试剂的保护基团。展示了唾液酸路易斯 X 支链四糖的代表性合成。
• Peptide thioester synthesis through N→S acyl-transfer: application to the synthesis of a β-defensin
  作者：Jaskiranjit Kang、Natalie L. Reynolds、Christine Tyrrell、Julia R. Dorin、Derek Macmillan

  DOI：10.1039/b913886b

  日期：——

  Peptide thioesters readily prepared through N→S acyl transfer of a specific C-terminal motif provide access to biologically active mini-proteins using native chemical ligation.

  通过对特定的 C 端基团进行 NâS酰基转移，肽硫代酯很容易制备，这样就可以利用原生化学连接技术获得具有生物活性的微型蛋白质。