monomethyl fosmidomycin

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机膦酸及其衍生物
• 英文名称: monomethyl fosmidomycin
• 英文别名: 3-[Formyl(hydroxy)amino]propyl-methoxyphosphinic acid
• 化学式: C₅H₁₂NO₅P
• 分子量: 197.128
• InChiKey: BZYOWYHVVMLFCJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  87.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  monomethyl fosmidomycin 在 α-ketoglutarate hydroxylase 、 iron(II) sulfate 、 维生素 C 作用下， 反应 24.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Characterization and application of the Fe(ii) and α-ketoglutarate dependent hydroxylase FrbJ

  摘要：

  Fe(II)和α-酮戊二酸依赖的羟化酶FrbJ之前已被证实能够利用FR-900098合成第二种磷酸酯FR-33289。在这里，我们评估了它对其他可能底物的羟化能力，生成了一系列潜在的抗疟药物。在一系列生物测定和体外实验中，我们发现了两种新的抗疟药物。

  DOI：

  10.1039/c1cc13597j
• 作为产物：
  描述：

  S-腺苷-L-蛋氨酸 、 膦胺霉素 在 Escherichia coli AdoHcy nucleosidase 、 N-terminal hexahistidine tagged DhpI proteine 作用下， 生成 monomethyl fosmidomycin
  参考文献：
  名称：

  Characterization and structure of DhpI, a phosphonate O -methyltransferase involved in dehydrophos biosynthesis

  摘要：

  膦酸天然产物具有一系列生物活性，这是因为它们能够模拟在羧基代谢中涉及的酶反应中形成的磷酸酯或四面体中间体。这些化合物在pH 7下的二阴离子形式对于模拟羧酸和四面体中间体的能力存在缺陷。产生膦酸的微生物已经演化出两种解决方案来克服这个障碍：合成含有两个P-C键的单阴离子膦酸盐或对膦酸基团进行酯化。后一种解决方案首次发现于含有膦酸脱氢丙氨酸甲酯基团的抗生素脱氢膦。我们在这里报道了脱氢膦生物合成基因簇中的O-甲基转移酶的表达、纯化、底物范围和结构。该酶利用S-腺苷甲硫氨酸对多种膦酸进行甲基化，包括1-羟乙基膦酸、1,2-二羟乙基膦酸和乙酰-1-氨基乙基膦酸。动力学分析表明，最佳底物是三肽，其C-末端残基是丙氨酸的膦酸类似物，这表明该酶在脱氢膦的生物合成过程中起到晚期作用。这些结论得到了X射线结构的证实，揭示了一个可以容纳三肽底物的活性位点。此外，结构研究表明，底物或产物结合引起了构象变化。有趣的是，该酶的底物特异性较低，并且已被用于甲基化临床抗生素磷霉素和抗疟疾临床候选药物磷膜多霉素，显示了其在生物工程应用中的潜力。

  DOI：

  10.1073/pnas.1006848107

文献信息

• DE2733658
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• Characterization and application of the Fe(ii) and α-ketoglutarate dependent hydroxylase FrbJ
  作者：Matthew A. DeSieno、Wilfred A. van der Donk、Huimin Zhao

  DOI：10.1039/c1cc13597j

  日期：——

  The Fe(II) and α-ketoglutarate-dependent hydroxylase FrbJ was previously demonstrated to utilize FR-900098 synthesizing a second phosphonate FR-33289. Here we assessed its ability to hydroxylate other possible substrates, generating a library of potential antimalarial compounds. Through a series of bioassays and in vitro experiments, we identified two new antimalarials.

  Fe(II)和α-酮戊二酸依赖的羟化酶FrbJ之前已被证实能够利用FR-900098合成第二种磷酸酯FR-33289。在这里，我们评估了它对其他可能底物的羟化能力，生成了一系列潜在的抗疟药物。在一系列生物测定和体外实验中，我们发现了两种新的抗疟药物。
• Characterization and structure of DhpI, a phosphonate <i>O</i> -methyltransferase involved in dehydrophos biosynthesis
  作者：Jin-Hee Lee、Brian Bae、Michael Kuemin、Benjamin T. Circello、William W. Metcalf、Satish K. Nair、Wilfred A. van der Donk

  DOI：10.1073/pnas.1006848107

  日期：2010.10.12

  Phosphonate natural products possess a range of biological activities as a consequence of their ability to mimic phosphate esters or tetrahedral intermediates formed in enzymatic reactions involved in carboxyl group metabolism. The dianionic form of these compounds at pH 7 poses a drawback with respect to their ability to mimic carboxylates and tetrahedral intermediates. Microorganisms producing phosphonates have evolved two solutions to overcome this hurdle: biosynthesis of monoanionic phosphinates containing two P-C bonds or esterification of the phosphonate group. The latter solution was first discovered for the antibiotic dehydrophos that contains a methyl ester of a phosphonodehydroalanine group. We report here the expression, purification, substrate scope, and structure of the O -methyltransferase from the dehydrophos biosynthetic gene cluster. The enzyme utilizes S -adenosylmethionine to methylate a variety of phosphonates including 1-hydroxyethylphosphonate, 1,2-dihydroxyethylphosphonate, and acetyl-1-aminoethylphosphonate. Kinetic analysis showed that the best substrates are tripeptides containing as C-terminal residue a phosphonate analog of alanine suggesting the enzyme acts late in the biosynthesis of dehydrophos. These conclusions are corroborated by the X-ray structure that reveals an active site that can accommodate a tripeptide substrate. Furthermore, the structural studies demonstrate a conformational change brought about by substrate or product binding. Interestingly, the enzyme has low substrate specificity and was used to methylate the clinical antibiotic fosfomycin and the antimalaria clinical candidate fosmidomycin, showing its promise for applications in bioengineering.

  膦酸天然产物具有一系列生物活性，这是因为它们能够模拟在羧基代谢中涉及的酶反应中形成的磷酸酯或四面体中间体。这些化合物在pH 7下的二阴离子形式对于模拟羧酸和四面体中间体的能力存在缺陷。产生膦酸的微生物已经演化出两种解决方案来克服这个障碍：合成含有两个P-C键的单阴离子膦酸盐或对膦酸基团进行酯化。后一种解决方案首次发现于含有膦酸脱氢丙氨酸甲酯基团的抗生素脱氢膦。我们在这里报道了脱氢膦生物合成基因簇中的O-甲基转移酶的表达、纯化、底物范围和结构。该酶利用S-腺苷甲硫氨酸对多种膦酸进行甲基化，包括1-羟乙基膦酸、1,2-二羟乙基膦酸和乙酰-1-氨基乙基膦酸。动力学分析表明，最佳底物是三肽，其C-末端残基是丙氨酸的膦酸类似物，这表明该酶在脱氢膦的生物合成过程中起到晚期作用。这些结论得到了X射线结构的证实，揭示了一个可以容纳三肽底物的活性位点。此外，结构研究表明，底物或产物结合引起了构象变化。有趣的是，该酶的底物特异性较低，并且已被用于甲基化临床抗生素磷霉素和抗疟疾临床候选药物磷膜多霉素，显示了其在生物工程应用中的潜力。