双底物类似物策略是开发蛋白质甲基转移酶的有效和选择性
抑制剂的有前途的方法。在此,研究了一系列双底物类似物与蛋白质 N 端甲基转移酶 1 (N
TMT1) 的相互作用,以探测 N
TMT1 活性位点的分子特性。我们的结果表明,2-C 到 4-C 原子接头使其各自的双底物类似物能够占据 N
TMT1 的底物和辅因子结合位点,但具有 5-C 原子接头的双底物类似物仅与底物结合相互作用位点并起到基底的作用。此外,4-C 原子接头是最佳的,并产生最有效的
抑制剂 ( K i,app= 130 ± 40 pM) 对于迄今为止的 N
TMT1,显示对其他甲基转移酶甚至其同源物 N
TMT2 的选择性超过 3000 倍。这项研究揭示了 N
TMT1 活性位点可塑性的分子基础。此外,我们的研究概述了开发任何甲基转移酶双底物
抑制剂的一般指导。