(5-hydroxy-7-methyl-2-oxo-2H-chromen-4-yl)-acetic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 香豆素及其衍生物
• 英文名称: (5-hydroxy-7-methyl-2-oxo-2H-chromen-4-yl)-acetic acid
• 英文别名: (5-Hydroxy-7-methyl-2-oxo-2H-chromen-4-yl)-essigsaeure；2-(5-Hydroxy-7-methyl-2-oxochromen-4-yl)acetic acid
• 化学式: C₁₂H₁₀O₅
• 分子量: 234.208
• InChiKey: MLEOHMMNTCSKQH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  83.8
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3,5-二羟基甲苯 、 柠檬酸 在 硫酸 作用下， 反应 2.92h， 以16%的产率得到(5-hydroxy-7-methyl-2-oxo-2H-chromen-4-yl)-acetic acid
  参考文献：
  名称：

  片段对接和连接以发现十文字组蛋白去甲基化酶抑制剂

  摘要：

  抑制 Jumonji 去甲基酶的工具分子的开发可以用于研究癌症相关的转录。虽然 2,4-吡啶二甲酸 (2,4-PDCA) 等支架是有效的抑制剂，但它们的选择性有限。为了发现 KDM4 去甲基酶（几种癌症中过度表达的酶）的新抑制剂，我们将包含 600 000 个片段的文库对接到 KDM4A 的高分辨率结构中。最有趣的化学型是 5-氨基水杨酸盐​​，它以两个不同但重叠的方向对接。对接姿势为共价连接片段化合物的设计提供了信息，并进一步衍生化。这种组合方法将亲和力提高了约 3 个对数级，得到化合物35 ( K = 43 nM)。几种杂合抑制剂对 KDM4C 的选择性高于相关酶 FIH、KDM2A 和 KDM6B，但对 KDM3 和 KDM5 亚家族缺乏选择性。共晶结构证实了对接预测。这项研究将基于结构的对接的使用从片段发现扩展到片段连接优化，产生了新型 KDM4 抑制剂。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b01527