PAMP-12（人，猪） | 196305-05-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 中文名称: PAMP-12（人，猪）
• 英文名称: FRKKWNKWALSR-NH2
• 英文别名: PAMP(9-20)；PAMP-12；(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-1-hydroxy-3-phenylpropylidene]amino]-5-carbamimidamido-1-hydroxypentylidene]amino]-1-hydroxyhexylidene]amino]-1-hydroxyhexylidene]amino]-1-hydroxy-3-(1H-indol-3-yl)propylidene]amino]-N-[(2S)-6-amino-1-[(2S)-1-[(2S)-1-[(2S)-1-[(2S)-1-[(2S)-5-carbamimidamido-1-hydroxy-1-iminopentan-2-yl]imino-1,3-dihydroxypropan-2-yl]imino-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]imino-1-hydroxypropan-2-yl]imino-1-hydroxy-3-(1H-indol-3-yl)propan-2-yl]imino-1-hydroxyhexan-2-yl]butanediimidic acid
• CAS: 196305-05-2
• 化学式: C₇₇H₁₁₉N₂₅O₁₄
• 分子量: 1618.95
• InChiKey: DNUWKYBPCFUDDK-DYQOJKGJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.7
• 重原子数：
  116
• 可旋转键数：
  56
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  686
• 氢给体数：
  26
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  p-nitrophenyl β-D-galactopyranosyl-(1->3)-2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranoside 、 PAMP-12（人，猪） 在 endo-α-N-acetylgalactosaminidase from Bifidobacterium longum 作用下， 以4.4%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Syntheses of mucin-type O-glycopeptides and oligosaccharides using transglycosylation and reverse-hydrolysis activities of Bifidobacterium endo-α-N-acetylgalactosaminidase

  摘要：

  内切-α-N-乙酰半乳糖苷酶催化粘蛋白糖蛋白和合成的对硝基苯基（pNP）α-连接底物的核心 1 型 O-糖（Galβ1-3GalNAcα1-Ser/Thr）释放 Galβ1-3GalNAc。在此，我们报告了利用长双歧杆菌的内-α-N-乙酰半乳糖苷酶（EngBF）的转糖基化活性酶解合成含核心 1 二糖的糖肽的情况。当使用 Galβ1-3GalNAcα1-pNP 作为供体底物时，该酶可直接将 Galβ1-3GalNAc 转化到 PAMP-12、缓激肽、肽-T 和 MUC1a 等生物活性肽的丝氨酸或苏氨酸残基上。研究还发现该酶能催化逆水解反应。将 EngBF 与葡萄糖或乳糖以及利用表达内-α-N-乙酰半乳糖苷酶的双歧杆菌细胞从猪胃粘蛋白中制备的 Galβ1-3GalNAc 培养时，该酶可合成核心 1 含二糖的低聚糖。合成的低聚糖是双歧杆菌很有前景的益生元。

  DOI：

  10.1007/s10719-009-9247-8