Molecular recognition of biotin, barbital and tolbutamide with new synthetic receptors
作者:Rosa M. Claramunt、Fernando Herranz、M. Dolores Santa María、Elena Pinilla、M. Rosario Torres、José Elguero
DOI:10.1016/j.tet.2005.03.025
日期:2005.5
N′-bis(6-methylpyridin-2-yl)-2,6-pyridinedicarboxamide (8, hydrated) with biotin methyl ester (1), N,N′-dimethylurea (2), 2-imidazolidone (3), N,N′-trimethylenurea (4), barbital (5) and tolbutamide (6) as guests. Molecular Mechanics calculations (Monte Carlo Conformational Search, AMBER and OPLS force fields, MacroModel v.8.1) on the complexes formed between the foregoing guests and hosts 7 and 8, comparatively with
我们已经通过NMR滴定法测定了主体N,N'-双(6-甲基吡啶-2-基)-1,3-苯二甲酰胺(7)和4-氯-N,N之间的配合物的结合常数'-双(6-甲基吡啶-2-基)-2,6-吡啶二甲酰胺(8,水合)与生物素甲酯(1),N,N'-二甲基脲(2),2-咪唑啉酮(3),N,N'-三甲基尿素(4),巴比妥(5)和甲苯磺丁酰胺(6)作为客人。分子动力学计算(蒙特卡洛构象搜索,AMBER和OPLS力场,MacroModel v.8.1)对上述客体与主体7和8之间形成的配合物进行比较,与4-氧代-N,N'-双(6-甲基吡啶)为了确定实验结果与理论结果之间的相关性并了解设计的新宿主的行为,已进行了-2-基)-1,4-二氢-2,6-吡啶二甲酰胺(9a)的研究。最后,我们针对主体7 – 9与水之间的配合物,针对优化的分子力学几何形状进行了单点DFT [B3LYP / 6-31G(d,p)]计算。