Synthesis and Molecular Modeling of Thermally Stable DNA G-Quadruplexes with Anthraquinone Insertions
作者:Alaa S. Gouda、Mahasen S. Amine、Erik B. Pedersen
DOI:10.1002/ejoc.201700065
日期:2017.6.8
Two new phosphoramidite building blocks for DNA synthesis were synthesized from 1,5- and 2,6-dihydroxyanthraquinones through alkylation with 3-bromo-1-propanol followed by DMT-protection. The novel synthesized 1,5- and 2,6-disubstituted anthraquinone monomers H15 and H26 are incorporated into a G-quadruplex by single and double replacements of TGT and TT loops. Monomers H15 and H26 were found to destabilize
从 1,5- 和 2,6-二羟基蒽醌通过 3-溴-1-丙醇烷基化和 DMT 保护合成了两种用于 DNA 合成的新亚磷酰胺结构单元。新合成的 1,5-和 2,6-二取代蒽醌单体 H15 和 H26 通过 TGT 和 TT 环的单次和双次置换合并到 G-四链体中。发现单体 H15 和 H26 会破坏 TGT 或 TT 环的所有单一置换的 G-四链体结构。当 H26 接头替换 TT 环时,观察到最大的不稳定。相比之下,两个 TT 环中蒽醌单体的存在导致它们的热稳定性增加 1-18°C,这取决于单体的接头连接几何形状。H15 和 H26 接头取代两个 TT 环的存在导致 G-四链体结构的最高稳定性达 18.2 °C。所有蒽醌修饰的四链体的圆二色光谱显示,与钾缓冲条件下的野生型相比,反平行结构没有变化。通过对蒽醌修饰的 G-四链体的分子建模来解释显着增加的热稳定性。