precolibactin B

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并吡啶类
• 英文名称: precolibactin B
• 英文别名: 2-[[4-[(3S)-3-[[(2R)-4-amino-4-oxo-2-(tetradecanoylamino)butanoyl]amino]butyl]-3,6-dioxospiro[2H-pyrrolo[3,4-c]pyridine-1,1'-cyclopropane]-5-yl]methyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid
• 化学式: C₃₆H₅₂N₆O₇S
• 分子量: 712.911
• InChiKey: CYECZFOLZAKWQB-UKILVPOCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  229
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-半胱氨酸 、 precolibactin B 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.0h， 以89%的产率得到precolibactin A
  参考文献：
  名称：

  候选前大肠杆菌素的收敛和模块化合成。Precolibactin A 的结构修正

  摘要：

  大肠杆菌素是由某些共生和肠外致病性大肠杆菌菌株产生的混合聚酮化合物-非核糖体肽天然产物。代谢物由 clb 基因簇编码，称为前体药物。clb(+) 大肠杆菌在体外和体内诱导哺乳动物细胞 DNA 双链断裂，并且在 55-67% 的结肠直肠癌患者中发现，表明成熟的大肠杆菌素可以引发肿瘤发生。然而，阐明它们的结构一直是一项艰巨的任务，因为从细菌培养物中获得的代谢物数量极少 (μg/L)，并且被认为是不稳定的。在此，我们描述了一种灵活且收敛的合成路线来制备先进的前大肠杆菌素和衍生物。合成通过两个复杂前体（例如，28 + 17 → 29a，90%），然后是碱诱导的双脱水级联反应，形成两个目标环（例如，29a → 30a，79%）。该序列提供了超过发酵获得的数量的先进候选前大肠杆菌素的数量，并且预计可以很容易地进行缩放。这些研究指导了预测代谢物 precolibactin A（从 5a 或 5b 到 7）的结构修订，并证实了分离的代谢物

  DOI：

  10.1021/jacs.6b02276
• 作为产物：
  描述：

  2-[[(叔丁氧羰基)氨基]甲基]噻唑-4-羧酸 在 盐酸 、 silver trifluoroacetate 、 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 precolibactin B
  参考文献：
  名称：

  候选前大肠杆菌素的收敛和模块化合成。Precolibactin A 的结构修正

  摘要：

  大肠杆菌素是由某些共生和肠外致病性大肠杆菌菌株产生的混合聚酮化合物-非核糖体肽天然产物。代谢物由 clb 基因簇编码，称为前体药物。clb(+) 大肠杆菌在体外和体内诱导哺乳动物细胞 DNA 双链断裂，并且在 55-67% 的结肠直肠癌患者中发现，表明成熟的大肠杆菌素可以引发肿瘤发生。然而，阐明它们的结构一直是一项艰巨的任务，因为从细菌培养物中获得的代谢物数量极少 (μg/L)，并且被认为是不稳定的。在此，我们描述了一种灵活且收敛的合成路线来制备先进的前大肠杆菌素和衍生物。合成通过两个复杂前体（例如，28 + 17 → 29a，90%），然后是碱诱导的双脱水级联反应，形成两个目标环（例如，29a → 30a，79%）。该序列提供了超过发酵获得的数量的先进候选前大肠杆菌素的数量，并且预计可以很容易地进行缩放。这些研究指导了预测代谢物 precolibactin A（从 5a 或 5b 到 7）的结构修订，并证实了分离的代谢物

  DOI：

  10.1021/jacs.6b02276

文献信息

• Convergent and Modular Synthesis of Candidate Precolibactins. Structural Revision of Precolibactin A
  作者：Alan R. Healy、Maria I. Vizcaino、Jason M. Crawford、Seth B. Herzon

  DOI：10.1021/jacs.6b02276

  日期：2016.4.27

  Escherichia coli. The metabolites are encoded by the clb gene cluster as prodrugs termed precolibactins. clb(+) E. coli induce DNA double-strand breaks in mammalian cells in vitro and in vivo and are found in 55-67% of colorectal cancer patients, suggesting that mature colibactins could initiate tumorigenesis. However, elucidation of their structures has been an arduous task as the metabolites are obtained

  大肠杆菌素是由某些共生和肠外致病性大肠杆菌菌株产生的混合聚酮化合物-非核糖体肽天然产物。代谢物由 clb 基因簇编码，称为前体药物。clb(+) 大肠杆菌在体外和体内诱导哺乳动物细胞 DNA 双链断裂，并且在 55-67% 的结肠直肠癌患者中发现，表明成熟的大肠杆菌素可以引发肿瘤发生。然而，阐明它们的结构一直是一项艰巨的任务，因为从细菌培养物中获得的代谢物数量极少 (μg/L)，并且被认为是不稳定的。在此，我们描述了一种灵活且收敛的合成路线来制备先进的前大肠杆菌素和衍生物。合成通过两个复杂前体（例如，28 + 17 → 29a，90%），然后是碱诱导的双脱水级联反应，形成两个目标环（例如，29a → 30a，79%）。该序列提供了超过发酵获得的数量的先进候选前大肠杆菌素的数量，并且预计可以很容易地进行缩放。这些研究指导了预测代谢物 precolibactin A（从 5a 或 5b 到 7）的结构修订，并证实了分离的代谢物