thymidine 5'-di-tert-butyl phosphite

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: thymidine 5'-di-tert-butyl phosphite
• 英文别名: ditert-butyl [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl phosphite
• 化学式: C₁₈H₃₁N₂O₇P
• 分子量: 418.427
• InChiKey: FPGODPUJOHDKEI-BFHYXJOUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  thymidine 5'-di-tert-butyl phosphite 在 叔丁基过氧化氢 作用下， 以 吡啶 、 正壬烷 为溶剂， 反应 16.0h， 以764 mg的产率得到5'-O-(di-tert-butyl)phosphate-2'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  焦磷酸键连接寡核苷酸的合成

  摘要：

  在本文中，我们重新审视了通过焦磷酸盐互连的寡核苷酸的合成方法，该方法依赖于磷酸二酰胺酐的反应性。我们发现这种由 Ahmadibeni 和 Parang (2007) 先前发表的方法在我们手中是不可复制的。我们通过我们独立开发的方法成功合成了三个焦磷酸互连的胸苷寡核苷酸，与他们文章中要求保护的结构相同。对新合成产品的光谱数据的评估使人们对 Ahmadibeni-Parang 方法的可行性产生了怀疑。因此，我们相信在这里报告了通过焦磷酸键互连的 DNA 寡聚体的首次成功合成。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201500911
• 作为产物：
  描述：

  N,N-二异丙基亚磷酰胺二叔丁酯 、 beta-胸苷 在 吡啶 、 吡啶盐酸盐 作用下， 反应 0.5h， 生成 thymidine 5'-di-tert-butyl phosphite 、
  参考文献：
  名称：

  焦磷酸键连接寡核苷酸的合成

  摘要：

  在本文中，我们重新审视了通过焦磷酸盐互连的寡核苷酸的合成方法，该方法依赖于磷酸二酰胺酐的反应性。我们发现这种由 Ahmadibeni 和 Parang (2007) 先前发表的方法在我们手中是不可复制的。我们通过我们独立开发的方法成功合成了三个焦磷酸互连的胸苷寡核苷酸，与他们文章中要求保护的结构相同。对新合成产品的光谱数据的评估使人们对 Ahmadibeni-Parang 方法的可行性产生了怀疑。因此，我们相信在这里报告了通过焦磷酸键互连的 DNA 寡聚体的首次成功合成。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201500911

文献信息

• Highly chemo- and regioselective phosphitylation of unprotected 2′-deoxyribonucleosides
  作者：Yukiko Kato、Natsuhisa Oka、Takeshi Wada

  DOI：10.1016/j.tetlet.2006.02.060

  日期：2006.4

  regioselective phosphitylation of unprotected 2′-deoxyribonucleosides by the use of di-tert-butyl N,N-diethylphosphoramidite, a sterically hindered phosphoramidite. Both N/O- and primary hydroxy group-selectivities were simultaneously achieved, and the selectivity for the 5′-hydroxy groups was up to 97% regardless of the base moiety of the 2′-deoxyribonucleosides. The 3′-O-isomers and the 5′-O-isomers were easily

  我们已经通过使用二叔丁基N，N-二乙基亚磷酰胺，一种位阻的亚磷酰胺，开发了未保护的2'-脱氧核糖核苷的化学和区域选择性磷酸化。同时实现N / O-和伯羟基选择性，并且无论2'-脱氧核糖核苷的碱基部分如何，对5'-羟基的选择性均高达97％。通过硅胶柱色谱法或结晶容易地分离3'-O-异构体和5'-O-异构体，以中等至良好的产率得到纯的2'-脱氧核糖核苷5'-亚磷酸酯。