δ-acryloyl L-ornithine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: δ-acryloyl L-ornithine
• 英文别名: N-δ-acryloyl ornithine；N-δ-acrylic ornithine；(2S)-2-amino-5-(prop-2-enoylamino)pentanoic acid
• 化学式: C₈H₁₄N₂O₃
• 分子量: 186.211
• InChiKey: HNRQUDVWKBDXFB-LURJTMIESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.1
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  92.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  δ-acryloyl L-ornithine 、 氯甲酸-9-芴基甲酯 在 sodium carbonate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 以35 %的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Peptidic Inhibitors and a Fluorescent Probe for the Selective Inhibition and Labelling of Factor XIIIa Transglutaminase

  摘要：

  因子 XIIIa（FXIIIa）是一种转谷氨酰胺酶，在血液凝固级联过程中起着至关重要的作用，因此对抗凝剂的开发具有重要的治疗意义。虽然已有许多 FXIIIa 抑制剂的报道，但由于它们缺乏代谢稳定性，而且对转谷氨酰胺酶 2 (TG2) 的选择性较低，因此未能进行临床评估。此外，用于研究 FXIIIa 活性和定位的化学工具也极为有限。为了克服这些不足，我们设计、合成并评估了一个包含 21 种新型 FXIIIa 抑制剂的文库。我们改变了小分子和多肽支架上的亲电弹头、链接长度和疏水单元，以优化同工酶的选择性和效力。随后，对之前报道的一种 FXIIIa 抑制剂进行了改良，设计出了一种带有罗丹明 B 分子的探针，从而产生了创新性的 KM93，它是第一个已知的荧光探针，可选择性地标记活性 FXIIIa，具有高效率（kinact/KI = 127,300 M-1 min-1）和比 TG2 高 6.5 倍的选择性。KM93 探针有助于在骨髓巨噬细胞内进行荧光显微镜研究，在细胞培养中高效、选择性地标记 FXIIIa。这些新型抑制剂和探针的结构-活性趋势将有助于今后研究 FXIIIa 的活性、抑制和定位。

  DOI：

  10.3390/molecules28041634
• 作为产物：
  描述：

  在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 δ-acryloyl L-ornithine
  参考文献：
  名称：

  Peptidic Inhibitors and a Fluorescent Probe for the Selective Inhibition and Labelling of Factor XIIIa Transglutaminase

  摘要：

  因子 XIIIa（FXIIIa）是一种转谷氨酰胺酶，在血液凝固级联过程中起着至关重要的作用，因此对抗凝剂的开发具有重要的治疗意义。虽然已有许多 FXIIIa 抑制剂的报道，但由于它们缺乏代谢稳定性，而且对转谷氨酰胺酶 2 (TG2) 的选择性较低，因此未能进行临床评估。此外，用于研究 FXIIIa 活性和定位的化学工具也极为有限。为了克服这些不足，我们设计、合成并评估了一个包含 21 种新型 FXIIIa 抑制剂的文库。我们改变了小分子和多肽支架上的亲电弹头、链接长度和疏水单元，以优化同工酶的选择性和效力。随后，对之前报道的一种 FXIIIa 抑制剂进行了改良，设计出了一种带有罗丹明 B 分子的探针，从而产生了创新性的 KM93，它是第一个已知的荧光探针，可选择性地标记活性 FXIIIa，具有高效率（kinact/KI = 127,300 M-1 min-1）和比 TG2 高 6.5 倍的选择性。KM93 探针有助于在骨髓巨噬细胞内进行荧光显微镜研究，在细胞培养中高效、选择性地标记 FXIIIa。这些新型抑制剂和探针的结构-活性趋势将有助于今后研究 FXIIIa 的活性、抑制和定位。

  DOI：

  10.3390/molecules28041634

文献信息

• [EN] RAS BINDING PEPTIDES AND METHODS OF USE<br/>[FR] PEPTIDES DE LIAISON À RAS ET MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：RA PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2017181061A1

  公开（公告）日：2017-10-19

  The present invention provides Ras modulators including inhibitors and/or antagonists of Ras, Ras binding, and Ras-dependent cell signaling activity. Also provided are methods of utilizing the Ras modulators as therapeutics.

  本发明提供了Ras调节剂，包括Ras的抑制剂和/或拮抗剂，以及Ras结合和Ras依赖的细胞信号活性。还提供了利用这些Ras调节剂作为治疗药物的方法。
• Influence of polymer network-metal ion complexation on the swelling behaviour of new gels with incorporated α-amino acid groups
  作者：Marcin Karbarz、Jan Romanski、Kamila Michniewicz、Janusz Jurczak、Zbigniew Stojek

  DOI：10.1039/b920809g

  日期：——

  New gels based on N-isopropylacrylamide and amino acid L-ornithine were prepared by free radical polymerization in aqueous solutions. To make the amino acid attachable to the polymer chain the acrylic group was added to the δ-amino group of ornithine, to obtain N-δ-acrylic ornithine. After the polymerization process the α-amino acid groups were unbound. The relative content of amino acid incorporated into the polymeric network of the gels was estimated from 1HNMR spectra, then compared with the molar fraction used for the polymerization process. The presence of free α-amino acid groups attached to the polymeric network of the gels enabled the complexation of some di- and trivalent metal cations. Copper ions, which can form two complexes of different stoichiometry (1 : 1 and 1 : 2) with amino acids, were used to investigate the influence of the complexation process on the swelling behavior of the gels. The influence of amino acid content, temperature and copper ion concentration on the swelling process was also examined. The gels were found to be most sensitive to concentrations of copper ions in the range 10−6–10−5 M. As the amount of amino acid in the polymer network increases the gels gradually lose their temperature-sensitivity and become more sensitive to copper ion concentration. The volume-phase-transition temperature decreases significantly after the addition of copper ions. Analysis of the UV-Vis spectra and the swelling behavior indicates that both 1 : 1 and 1 : 2 complexes are present in the swollen state of the gels, whereas the latter complex is more dominant in the shrunken state.

  基于N-异丙基丙烯酰胺和氨基酸L-鸟氨酸的新型凝胶通过自由基聚合在水溶液中制备。为了使氨基酸附着在聚合物链上，将丙烯酸基团添加到鸟氨酸的γ-氨基上，得到N-γ-丙烯酸鸟氨酸。聚合过程结束后，α-氨基被解离。通过1HNMR光谱估计氨基酸掺入凝胶聚合网络的相对含量，然后与聚合过程中使用的摩尔分数进行比较。自由α-氨基附着在凝胶的聚合网络上，能够与一些二价和三价金属阳离子形成络合物。铜离子可以与氨基酸形成两种不同化学计量比的络合物（1∶1和1∶2），用于研究络合过程对凝胶溶胀行为的影响。还研究了氨基酸含量、温度和铜离子浓度对溶胀过程的影响。凝胶对10⁻⁶-10⁻⁵ M范围内的铜离子浓度最为敏感。随着聚合物网络中氨基酸含量的增加，凝胶逐渐失去对温度的敏感性，而对铜离子浓度变得更加敏感。加入铜离子后，体积相变温度显著降低。对紫外-可见光谱和溶胀行为进行分析表明，凝胶溶胀状态下存在1∶1和1∶2络合物，而后者在收缩状态下更占主导地位。
• Polymeric hydrogels modified with ornithine and lysine: Sorption and release of metal cations and amino acids
  作者：Jan Romanski、Marcin Karbarz、Krystyna Pyrzynska、Janusz Jurczak、Zbigniew Stojek

  DOI：10.1002/pola.25063

  日期：2012.2.1

  acryloyl and methacryloyl ornithine and lysine without the need to use protecting groups and chromatographic purifications. Three methods of removing the copper ions from the amino acid derivatives were examined. The obtained acryloyl and methacryloyl ornithine and lysine were copolymerized with N‐isopropylacrylamide and N,N′‐methylenebisacrylamide as crosslinking agents, resulting in a series of hydrogels

  描述了一种使用铜离子的新颖，便捷的合成方法，可以克级制备丙烯酰基和甲基丙烯酰基鸟氨酸和赖氨酸，而无需使用保护基和色谱纯化方法。研究了从氨基酸衍生物中除去铜离子的三种方法。将获得的丙烯酰基和甲基丙烯酰基鸟氨酸和赖氨酸与N-异丙基丙烯酰胺和N，N'-亚甲基双丙烯酰胺作为交联剂共聚，得到一系列具有不同掺入氨基酸含量的水凝胶。给定氨基酸的相对含量由1估算1 H NMR数据并与其在聚合过程中使用的摩尔分数进行比较。我们调查了掺入聚合物网络中的氨基酸基团的数量对在具有不同形成配合物（Cu 2 +，Co 2+和Ca 2+）能力的金属离子存在下凝胶的溶胀行为的影响。α-氨基酸基团和铜离子的吸附。接下来，利用存在于聚合物网络上的α-氨基酸基团来键合可以使金属离子复合的化合物。选择苯丙氨酸来检查其Cu 2+的共络合物适当改变pH值后，聚合物网络氨基酸及其从凝胶中连续释放出来。©2011 Wiley Periodicals，Inc
• Ras binding peptides and methods of use
  申请人：Ra Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US10954287B2

  公开（公告）日：2021-03-23

  The present invention provides Ras modulators including inhibitors and/or antagonists of Ras, Ras binding, and Ras-dependent cell signaling activity. Also provided are methods of utilizing the Ras modulators as therapeutics.

  本发明提供了 Ras 调节剂，包括 Ras、Ras 结合和依赖 Ras 的细胞信号活性的抑制剂和/或拮抗剂。本发明还提供了将 Ras 调节剂用作治疗的方法。
• New poly(N-δ-acryloyl ornithine) gels cross-linked with N,N′-methylenebisacrylamide. Sorption properties
  作者：Marcin Karbarz、Krystyna Pyrzynska、Jan Romanski、Janusz Jurczak、Zbigniew Stojek

  DOI：10.1016/j.polymer.2010.05.023

  日期：2010.6

  To make a polymer from ornithine the acryloyl group was added to delta-amino group of the amino acid and N-delta-acryloyl ornithine was polymerized. The presence of alpha-amino acid groups attached to the polymeric network of the gels enables the complexation of some di- and trivalent metal cations. Copper ions, which can form two complexes of different stoichiometry (1:1 and 1:2) with amino acids, were used to investigate the influence of the complexation process on the swelling behavior and sorption properties of the obtained gels. The swelling ratio decreased as copper ion concentration increased. The poly(N-delta-acryloyl ornithine) gel was most sensitive to the copper ions in the concentration range of 1-100 mg/mL. The obtained UV-Vis spectra indicated that the copper ions mainly formed complexes of stoichiomery 1:2 with the alpha-amino acid group. Copper ion uptake was found to exceed 94% in a wide pH range (4-10). The maximum sorption capacity calculated by applying the Langmuir equation was 18.0 mg/g. Kinetic data showed that the sorption process reached equilibrium within 30 min and indicated the importance of the intraparticle diffusion step. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.