Supramolecular Fluorescence Resonance Energy Transfer in Nucleobase‐Modified Fluorogenic RNA Aptamers
作者:Christian Steinmetzger、Carmen Bäuerlein、Claudia Höbartner
DOI:10.1002/anie.201916707
日期:2020.4.20
RNA aptamers form compact tertiary structures and bind their ligands in specific binding sites. Fluorescence-based strategies reveal information on structure and dynamics of RNA aptamers. Herein, we report the incorporation of the universal emissive nucleobase analog 4-cyanoindole into the fluorogenic RNA aptamer Chili, and its application as a donor for supramolecular FRET to the bound ligands DMHBI+
RNA适体形成紧凑的三级结构并在特定的结合位点结合其配体。基于荧光的策略揭示了 RNA 适体的结构和动力学信息。在此,我们报告了将通用发射核碱基类似物 4-氰基吲哚掺入荧光 RNA 适体 Chili 中,及其作为结合配体 DMHBI+ 或 DMHBO+ 的超分子 FRET 供体的应用。新核碱基-配体-FRET 对的光物理特性揭示了整个 RNA 适体组织的结构限制,并确定了适合基于 FRET 的配体结合读数的核苷酸位置。该策略通常适用于结合位点作图,也可应用于响应适体装置。