Ac-VQIVYK

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Ac-VQIVYK
• 英文别名: Ac-VQIVYK-NH₂；Ac-Val-Gln-Ile-Val-Tyr-Lys-OH；(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-acetamido-3-methylbutanoyl]amino]-5-amino-5-oxopentanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-6-aminohexanoic acid
• 化学式: C₃₈H₆₂N₈O₁₀
• 分子量: 790.958
• InChiKey: KFJBYIUZFNXOSI-RULZGXMMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  25
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.63
• 拓扑面积：
  301
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  potassium cyanate 、 Ac-VQIVYK 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 Ac-VQIVYK(Cb)
  参考文献：
  名称：

  氨基甲酰化促进淀粉样蛋白生成并诱导Tau核心六肽原纤维的结构变化。

  摘要：

  背景技术氨基甲酸酯化是非酶翻译后修饰（PTM），其涉及Lys的蛋白质或ε-氨基的N端的共价修饰。氨基甲酸酯化在几种与年龄有关的疾病中的作用已得到充分证明，但是，氨基甲酸酯化与包括阿尔茨海默氏病在内的神经退行性疾病之间的关系仍然未知。方法在本研究中，使用易于聚集的tau-core六肽片段306VQIVYK311（PHF6）和275VQIINK280（PHF6 *）作为模型，我们阐明了氨甲酰化对聚集动力学的影响以及原纤维3维结构中发生的变化使用生物物理分析和分子动力学模拟。结果我们发现氨基甲酸酯化有助于淀粉样蛋白的形成，并且可以将非结构化的非通路聚集体转化为对细胞有毒的健壮的淀粉样蛋白。PHF6原纤维的电子显微镜图像和分子动力学模拟表明，氨基甲酸酯化的肽可以形成过量的氢键，并调节肽原纤维的基音长度和扭曲。我们还比较了N端氨基甲酸酯化与乙酰化，并将我们的发现扩展到全长tau，即使在没有任何外部诱

  DOI：

  10.1016/j.bbagen.2018.07.030

文献信息

• Carbamylation promotes amyloidogenesis and induces structural changes in Tau-core hexapeptide fibrils
  作者：V. Guru KrishnaKumar、Lokesh Baweja、Krittika Ralhan、Sharad Gupta

  DOI：10.1016/j.bbagen.2018.07.030

  日期：2018.12

  is a non-enzymatic post-translational modification (PTM), which involves the covalent modification of N-terminus of protein or ε-amino group of Lys. The role of carbamylation in several age-related disorders is well documented, however, the relationship between carbamylation and neurodegenerative disorders including Alzheimer's disease remains uncharted. METHODS In the present study, using aggregation-prone

  背景技术氨基甲酸酯化是非酶翻译后修饰（PTM），其涉及Lys的蛋白质或ε-氨基的N端的共价修饰。氨基甲酸酯化在几种与年龄有关的疾病中的作用已得到充分证明，但是，氨基甲酸酯化与包括阿尔茨海默氏病在内的神经退行性疾病之间的关系仍然未知。方法在本研究中，使用易于聚集的tau-core六肽片段306VQIVYK311（PHF6）和275VQIINK280（PHF6 *）作为模型，我们阐明了氨甲酰化对聚集动力学的影响以及原纤维3维结构中发生的变化使用生物物理分析和分子动力学模拟。结果我们发现氨基甲酸酯化有助于淀粉样蛋白的形成，并且可以将非结构化的非通路聚集体转化为对细胞有毒的健壮的淀粉样蛋白。PHF6原纤维的电子显微镜图像和分子动力学模拟表明，氨基甲酸酯化的肽可以形成过量的氢键，并调节肽原纤维的基音长度和扭曲。我们还比较了N端氨基甲酸酯化与乙酰化，并将我们的发现扩展到全长tau，即使在没有任何外部诱