3-(3-Mercaptopropionylsulfanyl)-propionic acid pentafluorophenyl ester

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯酚酯
• 英文名称: 3-(3-Mercaptopropionylsulfanyl)-propionic acid pentafluorophenyl ester
• 英文别名: (2,3,4,5,6-pentafluorophenyl) 3-(3-sulfanylpropanoylsulfanyl)propanoate
• 化学式: C₁₂H₉F₅O₃S₂
• 分子量: 360.326
• InChiKey: WZWIXTZNZKBWDT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  69.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  五氟苯酚 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 3-(3-Mercaptopropionylsulfanyl)-propionic acid pentafluorophenyl ester
  参考文献：
  名称：

  赖氨酸靶向不可逆共价 NDM-1 抑制剂的策略设计

  摘要：

  新德里金属-β-内酰胺酶1（NDM-1）能水解大部分β-内酰胺类抗生素，是革兰氏阴性菌产生耐药性的主要因素。由于 NDM-1 的活性口袋较浅，大多数可逆抑制剂与 NDM-1 的结合相对较弱。或者，不可逆的共价抑制剂可以阻止它们与靶标的解离，从而导致蛋白质的永久失活。在此，我们报告了一系列针对活性口袋中保守的 Lys211 的 NDM-1 不可逆共价抑制剂。包括质谱、十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳、荧光标记和香豆素探针在内的几种方法被用来证明五氟苯酯形成了与 Lys211 形成共价键。此外，我们的目标抑制剂与美罗培南联合使用，对耐药菌具有抗菌作用，同时具有出色的安全性。我们设计赖氨酸靶向不可逆共价 NDM-1 抑制剂的新策略为革兰氏阴性菌的临床治疗提供了一个潜在的选择。

  DOI：

  10.1016/j.cclet.2022.108072

文献信息

• Irreversible Inhibition of Metallo-β-lactamase (IMP-1) by 3-(3-Mercaptopropionylsulfanyl)propionic Acid Pentafluorophenyl Ester
  作者：Hiromasa Kurosaki、Yoshihiro Yamaguchi、Toshihiro Higashi、Kimitaka Soga、Satoshi Matsueda、Haruka Yumoto、Shogo Misumi、Yuriko Yamagata、Yoshichika Arakawa、Masafumi Goto

  DOI：10.1002/anie.200500835

  日期：2005.6.20
• SMALL MOLECULE COMPOUNDS AS BROAD-SPECTRUM INHIBITORS OF METALLO-BETA-LACTAMASES
  申请人：Song Yongcheng

  公开号：US20120329842A1

  公开（公告）日：2012-12-27

  The present invention concerns methods and/or compositions for treatment and/or prevention of bacterial infection wherein the bacteria has at least one metallo-β-lactamase. The bacteria are provided with an inhibitor of the metallo-β-lactamase, for example in conjunction with an antibiotic that targets the bacteria. The bacteria may be a drug-resistant strain or susceptible to becoming a drug-resistant strain. In specific embodiments, the bacteria is Pseudomonas or Acinetobacter spp.
• [EN] SMALL MOLECULE COMPOUNDS AS BROAD-SPECTRUM INHIBITORS OF METALLO-BETA-LACTAMASES<br/>[FR] COMPOSÉS À PETITES MOLÉCULES COMME INHIBITEURS À LARGE SPECTRE DE MÉTALLO-BÊTA-LACTAMASES
  申请人：BAYLOR COLLEGE MEDICINE

  公开号：WO2012088283A1

  公开（公告）日：2012-06-28

  The present invention concerns methods and/or compositions for treatment and/or prevention of bacterial infection wherein the bacteria has at least one metallo-P-lactamase. The bacteria are provided with an inhibitor of the metallo-P-lactamase, for example in conjunction with an antibiotic that targets the bacteria. The bacteria may be a drug-resistant strain or susceptible to becoming a drug-resistant strain. In specific embodiments, the bacteria is Pseudomonas or Acinetobacter spp.
• Strategic design of lysine-targeted irreversible covalent NDM-1 inhibitors
  作者：Youzhen Ma、Yongxi Liang、Menglu Guo、Delin Min、Lulu Zheng、Yun Tang、Xun Sun

  DOI：10.1016/j.cclet.2022.108072

  日期：2022.12

  Gram-negative bacteria. The binding of most reversible inhibitors to NDM-1 is relatively weak due to the shallow active pocket of NDM-1. Alternatively, irreversible covalent inhibitors can prevent their dissociation from the target, leading to permanent inactivation of the protein. Herein, we report a series of irreversible covalent inhibitors of NDM-1 targeting the conserved Lys211 in the active pocket

  新德里金属-β-内酰胺酶1（NDM-1）能水解大部分β-内酰胺类抗生素，是革兰氏阴性菌产生耐药性的主要因素。由于 NDM-1 的活性口袋较浅，大多数可逆抑制剂与 NDM-1 的结合相对较弱。或者，不可逆的共价抑制剂可以阻止它们与靶标的解离，从而导致蛋白质的永久失活。在此，我们报告了一系列针对活性口袋中保守的 Lys211 的 NDM-1 不可逆共价抑制剂。包括质谱、十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳、荧光标记和香豆素探针在内的几种方法被用来证明五氟苯酯形成了与 Lys211 形成共价键。此外，我们的目标抑制剂与美罗培南联合使用，对耐药菌具有抗菌作用，同时具有出色的安全性。我们设计赖氨酸靶向不可逆共价 NDM-1 抑制剂的新策略为革兰氏阴性菌的临床治疗提供了一个潜在的选择。