A Computer‐Driven Scaffold‐Hopping Approach Generating New PTP1B Inhibitors from the Pyrrolo[1,2‐
<i>a</i>
]quinoxaline Core
作者:Javier García‐Marín、Mercedes Griera、Ramón Alajarín、Manuel Rodríguez‐Puyol、Diego Rodríguez‐Puyol、Juan J. Vaquero
DOI:10.1002/cmdc.202100338
日期:2021.9.16
developed and implemented a scaffold-hopping approach to vary the pyrrole ring of the pyrrolo[1,2-a]quinoxaline core, supported by extensive computational techniques aimed to explain the molecular interaction with PTP1B. Using a combination of docking, molecular dynamics and end-point free-energy calculations, we have rationally designed a hypothesis for new PTP1B inhibitors, supporting their recognition
蛋白酪氨酸磷酸酶 1B (PTP1B) 是治疗 II 型糖尿病等代谢性疾病的一个非常有前景的靶点。尽管30多年前它就被证实是治疗该疾病的一个有希望的靶点,但迄今为止还没有药物进入高级临床试验,其生化机制和功能仍在研究中。在本研究中,根据我们生成 PTP1B 抑制剂的经验,我们开发并实施了一种支架跳跃方法来改变吡咯并[1,2- a ]喹喔啉核心的吡咯环,并得到广泛的计算技术的支持,旨在解释与 PTP1B 的分子相互作用。通过结合对接、分子动力学和终点自由能计算,我们合理地设计了新型PTP1B抑制剂的假设,在分子水平上支持了它们的识别机制。设计阶段结束后,我们能够轻松地综合提出的候选方案,并且发现它们针对 PTP1B 的评估与我们的预测非常一致。此外,最好的候选者在纤维素模型中表现出葡萄糖摄取增量,从而证实了它们对 PTP1B 抑制的效用,并验证了这种抑制剂设计和由此获得的分子的方法。