Kinetics and stereochemistry of hydrolysis of an N-(phenylacetyl)-α-hydroxyglycine ester catalyzed by serine β-lactamases and dd-peptidases
作者:Ryan B. Pelto、R. F. Pratt
DOI:10.1039/c2ob25585e
日期:——
β-lactamases usually prefer L(S) enantiomers and DD-peptidases D(R). Product analysis, employing peptidylglycine α-amidating lyase, showed that the preferred enantiomer is D(R). Thus, it is the β-lactamases that have switched preference rather than the DD-peptidases. Molecular modeling of the P99 β-lactamase active site suggests that the α-hydroxyl of 5 may interact with conserved Asn and Lys residues
α-羟基缩氨酸 3-羧基苯基N- (苯乙酰基)-α-羟基甘氨酸( 5 ) 是非常有效的底物丝氨酸β-内酰胺酶和低分子量DD-肽酶。C 类 P99 和 ampC β-内酰胺酶催化5的两种对映异构体的水解,尽管它们表现出对其中一种的强烈偏好。A 类 TEM-2 和 D 类 OXA-1 β-内酰胺酶以及链霉菌R61 和放线马杜拉R39 DD-肽酶仅以任何显着速率催化5 的一种对映异构体的水解。实验表明,上述所有酶均强烈更喜欢 相同的对映异构体,这是一个令人惊讶的结果,因为 β-内酰胺酶通常 更喜欢 L ( S ) 对映异构体和DD-肽酶D ( R )。使用肽基甘氨酸 α-酰胺化裂解酶进行的产物分析表明,优选的对映异构体是D ( R )。因此,改变偏好的是β-内酰胺酶而不是DD-肽酶。P99 β-内酰胺酶活性位点的分子模型表明5的 α-羟基可能与保守的相互作用Asn和赖氨酸残基。因此,甘氨酸酯底物上的