Design, synthesis and biological evaluation of renin inhibitors guided by simulated annealing of chemical potential simulations
作者:Ian S. Cloudsdale、John K. Dickson、Thomas E. Barta、Brian S. Grella、Emilie D. Smith、John L. Kulp、Frank Guarnieri、John L. Kulp
DOI:10.1016/j.bmc.2017.05.032
日期:2017.8
We have applied simulated annealing of chemical potential (SACP) to a diverse set of ∼150 very small molecules to provide insights into new interactions in the binding pocket of human renin, a historically difficult target for which to find low molecular weight (MW) inhibitors with good bioavailability. In one of its many uses in drug discovery, SACP provides an efficient, thermodynamically principled
我们已将化学势模拟退火(SACP)应用于约150个非常小的分子的多样化集合,以提供洞悉人肾素结合口袋中新相互作用的见解,这是历史上很难找到的低分子量(MW)抑制剂的目标具有良好的生物利用度。SACP在药物开发中的许多用途之一中,提供了一种高效的,热力学原理上的方法,用于对支架跳跃的化学型替换进行排名并为药物开发操纵理化特性。我们介绍了使用约束片段分析(CFA)来构建和分析配体,这些配体是通过将这些片段与预测的高亲和力相连接而组成的。该技术解决了将片段有效地连接在一起的问题,并提供了一种预测机制以对合成的前瞻性抑制剂进行排序。描述了这些技术在鉴定人肾素新抑制剂中的应用。合成了一组有限的设计化合物,可提供有效的低分子量类似物(IC50 s <100 nM)具有良好的口服生物利用度(F> 20–58%)。