methyl 3-((4-bromobenzyl)oxy)propanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl 3-((4-bromobenzyl)oxy)propanoate
• 英文别名: Methyl 3-[(4-bromophenyl)methoxy]propanoate；methyl 3-[(4-bromophenyl)methoxy]propanoate
• 化学式: C₁₁H₁₃BrO₃
• 分子量: 273.126
• InChiKey: FETAPYZBHUKSAN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  35.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 3-((4-bromobenzyl)oxy)propanoate 、 苯乙炔 在 copper(l) iodide 、 sodium tetrachloropalladate(II) 、 四甲基乙二胺 、 2-二叔丁基膦-1-苯基吲哚 作用下， 以 水 为溶剂， 以98%的产率得到methyl 3-((4-(phenylethynyl)benzyl)oxy)propanoate
  参考文献：
  名称：

  通过 Tolane 修饰的肽核酸鉴别 SNP：在病原体耐药性检测中的应用

  摘要：

  在治疗病毒或细菌感染期间，重要的是评估对所用治疗剂的任何耐药性。由特定基因中的单个碱基突变引起的氨基酸取代通常会导致病原体产生耐药性。因此，需要区分目标序列中单个碱基错配的分子工具来实现治疗成功。在这里，我们通过 N 末端的酰胺键合成了由 tolane 衍生的肽核酸 (PNA)，并成功地提高了序列特异性，即使在双链末端区域附近存在错配的碱基对也是如此。我们通过紫外线熔化温度分析、热力学分析、计算机构象搜索和凝胶迁移率变化测定评估了 tolane-PNA 对单链 DNA 和 RNA 的序列特异性。结果，所有 PNA-tolane 衍生物都稳定了与匹配目标序列的双链体形成，而不会导致错配目标结合。在不同的 PNA-tolane 衍生物中，用萘基型 tolane 修饰的 PNA 可以有效区分错配的碱基对，并用于检测甲型 H1N1 流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的耐药性。因此，我们的分子工具可用于区分

  DOI：

  10.3390/molecules25040769
• 作为产物：
  描述：

  4-溴丁酸甲酯 、 4-溴苄醇 在 sodium hydride 作用下， 以 甲苯 、 mineral oil 为溶剂， 反应 0.5h， 以63%的产率得到methyl 3-((4-bromobenzyl)oxy)propanoate
  参考文献：
  名称：

  通过 Tolane 修饰的肽核酸鉴别 SNP：在病原体耐药性检测中的应用

  摘要：

  在治疗病毒或细菌感染期间，重要的是评估对所用治疗剂的任何耐药性。由特定基因中的单个碱基突变引起的氨基酸取代通常会导致病原体产生耐药性。因此，需要区分目标序列中单个碱基错配的分子工具来实现治疗成功。在这里，我们通过 N 末端的酰胺键合成了由 tolane 衍生的肽核酸 (PNA)，并成功地提高了序列特异性，即使在双链末端区域附近存在错配的碱基对也是如此。我们通过紫外线熔化温度分析、热力学分析、计算机构象搜索和凝胶迁移率变化测定评估了 tolane-PNA 对单链 DNA 和 RNA 的序列特异性。结果，所有 PNA-tolane 衍生物都稳定了与匹配目标序列的双链体形成，而不会导致错配目标结合。在不同的 PNA-tolane 衍生物中，用萘基型 tolane 修饰的 PNA 可以有效区分错配的碱基对，并用于检测甲型 H1N1 流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的耐药性。因此，我们的分子工具可用于区分

  DOI：

  10.3390/molecules25040769

文献信息

• SNP Discrimination by Tolane-Modified Peptide Nucleic Acids: Application for the Detection of Drug Resistance in Pathogens
  作者：Kenji Takagi、Tenko Hayashi、Shinjiro Sawada、Miku Okazaki、Sakiko Hori、Katsuya Ogata、Nobuo Kato、Yasuhito Ebara、Kunihiro Kaihatsu

  DOI：10.3390/molecules25040769

  日期：——

  with a mismatched base pair located near the terminal region of the duplex. We assessed the sequence specificities of the tolane-PNAs for single-strand DNA and RNA by UV-melting temperature analysis, thermodynamic analysis, an in silico conformational search, and a gel mobility shift assay. As a result, all of the PNA-tolane derivatives stabilized duplex formation to the matched target sequence without

  在治疗病毒或细菌感染期间，重要的是评估对所用治疗剂的任何耐药性。由特定基因中的单个碱基突变引起的氨基酸取代通常会导致病原体产生耐药性。因此，需要区分目标序列中单个碱基错配的分子工具来实现治疗成功。在这里，我们通过 N 末端的酰胺键合成了由 tolane 衍生的肽核酸 (PNA)，并成功地提高了序列特异性，即使在双链末端区域附近存在错配的碱基对也是如此。我们通过紫外线熔化温度分析、热力学分析、计算机构象搜索和凝胶迁移率变化测定评估了 tolane-PNA 对单链 DNA 和 RNA 的序列特异性。结果，所有 PNA-tolane 衍生物都稳定了与匹配目标序列的双链体形成，而不会导致错配目标结合。在不同的 PNA-tolane 衍生物中，用萘基型 tolane 修饰的 PNA 可以有效区分错配的碱基对，并用于检测甲型 H1N1 流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的耐药性。因此，我们的分子工具可用于区分